78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_04171 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04207  predicted transposase  100 
 
 
255 aa  281  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04171  hypothetical protein  100 
 
 
135 aa  280  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4566  hypothetical protein  96.3 
 
 
314 aa  272  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4766  hypothetical protein  96.3 
 
 
334 aa  270  5.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3724  putative transposase YhgA family protein  95.56 
 
 
314 aa  269  8.000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4885  hypothetical protein  95.56 
 
 
318 aa  268  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287711  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3878  hypothetical protein  72.59 
 
 
308 aa  216  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3707  hypothetical protein  72.59 
 
 
304 aa  216  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3782  hypothetical protein  71.85 
 
 
304 aa  214  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3710  hypothetical protein  71.85 
 
 
304 aa  214  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3816  hypothetical protein  71.85 
 
 
304 aa  214  2.9999999999999998e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.792275 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3445  hypothetical protein  68.89 
 
 
296 aa  209  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2461  hypothetical protein  68.15 
 
 
300 aa  207  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.171355  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1347  putative transposase YhgA family protein  68.15 
 
 
296 aa  207  4e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0644465  normal  0.765955 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2599  hypothetical protein  68.15 
 
 
296 aa  207  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00513302  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02190  hypothetical protein  68.15 
 
 
296 aa  207  4e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428095  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02230  hypothetical protein  68.15 
 
 
296 aa  207  4e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.326611  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1351  putative transposase YhgA family protein  68.15 
 
 
296 aa  207  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0581087  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3973  hypothetical protein  66.91 
 
 
309 aa  202  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4045  hypothetical protein  66.91 
 
 
309 aa  202  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal  0.0374243 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4159  hypothetical protein  66.91 
 
 
313 aa  202  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.241117  normal  0.413105 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4096  hypothetical protein  66.91 
 
 
313 aa  202  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3991  hypothetical protein  66.91 
 
 
313 aa  202  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0302  hypothetical protein  66.67 
 
 
292 aa  200  5e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.094929  normal  0.0909002 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03215  hypothetical protein  66.67 
 
 
292 aa  200  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0821559  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03263  predicted transposase  66.67 
 
 
292 aa  200  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.100095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3608  hypothetical protein  66.67 
 
 
292 aa  200  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0302  putative transposase YhgA family protein  66.67 
 
 
292 aa  200  6e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.78914  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3792  hypothetical protein  66.67 
 
 
292 aa  200  6e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3692  hypothetical protein  65.93 
 
 
292 aa  197  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3886  hypothetical protein  65.93 
 
 
292 aa  197  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4718  hypothetical protein  65.19 
 
 
292 aa  197  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2386  hypothetical protein  62.22 
 
 
300 aa  186  7e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3382  hypothetical protein  62.22 
 
 
308 aa  186  8e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02170  hypothetical protein  62.22 
 
 
300 aa  186  8e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2397  hypothetical protein  62.22 
 
 
319 aa  186  8e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2627  hypothetical protein  62.22 
 
 
300 aa  186  9e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2542  hypothetical protein  62.22 
 
 
300 aa  186  9e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02129  hypothetical protein  62.22 
 
 
282 aa  186  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1406  hypothetical protein  62.22 
 
 
299 aa  186  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286093  normal  0.84386 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4851  hypothetical protein  63.64 
 
 
321 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4776  hypothetical protein  63.64 
 
 
317 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4874  hypothetical protein  63.64 
 
 
317 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.702519 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1415  putative transposase YhgA family protein  61.48 
 
 
299 aa  182  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.571537  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3726  putative transposase  54.07 
 
 
310 aa  160  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04729  hypothetical protein  51.11 
 
 
309 aa  158  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0122  putative transposase  52.59 
 
 
313 aa  155  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2156300000000001e-29 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4129  putative transposase YhgA family protein  50.37 
 
 
319 aa  150  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.683023  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0084  hypothetical protein  50.37 
 
 
319 aa  150  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0086  putative transposase  50.37 
 
 
319 aa  150  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864811  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0599  putative transposase YhgA family protein  51.11 
 
 
318 aa  150  7e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3432  putative transposase YhgA family protein  50.37 
 
 
218 aa  148  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0029  transposase  48.09 
 
 
320 aa  145  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0539  hypothetical protein  47.41 
 
 
311 aa  144  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3046  transposase  46.67 
 
 
282 aa  144  5e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131132  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0523  hypothetical protein  47.41 
 
 
311 aa  143  9e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0039  transposase  47.41 
 
 
316 aa  142  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0520  hypothetical protein  47.41 
 
 
307 aa  143  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0529  hypothetical protein  47.41 
 
 
311 aa  142  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0068  putative transposase  50.37 
 
 
296 aa  142  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.565138  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0065  hypothetical protein  53.44 
 
 
313 aa  140  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0980043  hitchhiker  0.0000000385113 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1429  putative transposase YhgA family protein  51.11 
 
 
302 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3527  putative transposase YhgA family protein  48.89 
 
 
300 aa  137  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.653665  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00130  hypothetical protein  48.89 
 
 
300 aa  137  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00131  predicted transposase  48.89 
 
 
300 aa  137  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3470  putative transposase YhgA family protein  48.89 
 
 
300 aa  137  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0142  ISNCY family transposase  48.89 
 
 
306 aa  136  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0136  hypothetical protein  48.89 
 
 
238 aa  136  8.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0141  hypothetical protein  48.15 
 
 
298 aa  136  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0135  hypothetical protein  48.89 
 
 
300 aa  136  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0125  hypothetical protein  48.89 
 
 
298 aa  136  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0911  putative transposase YhgA family protein  47.41 
 
 
298 aa  133  7.000000000000001e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2727  putative transposase YhgA family protein  48.89 
 
 
310 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1547  putative transposase YhgA family protein  60 
 
 
288 aa  105  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.738107  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4924  hypothetical protein  47.06 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.414279  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0894  hypothetical protein  28.87 
 
 
308 aa  55.5  0.0000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.284853 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1306  hypothetical protein  25.78 
 
 
275 aa  51.2  0.000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0115  putative transposase  38 
 
 
101 aa  47.4  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.91333e-16  hitchhiker  6.87308e-79 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>