133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3432 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010468  EcolC_3432  putative transposase YhgA family protein  100 
 
 
218 aa  444  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0122  putative transposase  76.11 
 
 
313 aa  348  5e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2156300000000001e-29 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0599  putative transposase YhgA family protein  75.66 
 
 
318 aa  343  8.999999999999999e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0086  putative transposase  60.09 
 
 
319 aa  276  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864811  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0084  hypothetical protein  60.09 
 
 
319 aa  276  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4129  putative transposase YhgA family protein  60.09 
 
 
319 aa  276  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.683023  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3726  putative transposase  56.64 
 
 
310 aa  263  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3878  hypothetical protein  55.5 
 
 
308 aa  261  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3707  hypothetical protein  55.05 
 
 
304 aa  255  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3816  hypothetical protein  55.05 
 
 
304 aa  254  8e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.792275 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3782  hypothetical protein  55.05 
 
 
304 aa  254  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3710  hypothetical protein  55.05 
 
 
304 aa  254  9e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4045  hypothetical protein  55.25 
 
 
309 aa  251  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal  0.0374243 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3973  hypothetical protein  55.25 
 
 
309 aa  251  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3382  hypothetical protein  52.29 
 
 
308 aa  243  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3046  transposase  50 
 
 
282 aa  242  3.9999999999999997e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131132  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0039  transposase  48.67 
 
 
316 aa  236  1e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4096  hypothetical protein  54.26 
 
 
313 aa  234  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3991  hypothetical protein  54.26 
 
 
313 aa  234  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4159  hypothetical protein  54.26 
 
 
313 aa  234  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.241117  normal  0.413105 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04729  hypothetical protein  53.24 
 
 
309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2542  hypothetical protein  51.83 
 
 
300 aa  233  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2627  hypothetical protein  51.83 
 
 
300 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2461  hypothetical protein  51.83 
 
 
300 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.171355  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02170  hypothetical protein  51.38 
 
 
300 aa  232  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2386  hypothetical protein  51.38 
 
 
300 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2397  hypothetical protein  48.68 
 
 
319 aa  228  5e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1406  hypothetical protein  50 
 
 
299 aa  226  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286093  normal  0.84386 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4776  hypothetical protein  48.9 
 
 
317 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4851  hypothetical protein  48.48 
 
 
321 aa  225  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02230  hypothetical protein  50.46 
 
 
296 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.326611  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02190  hypothetical protein  50.46 
 
 
296 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2599  hypothetical protein  50.46 
 
 
296 aa  225  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00513302  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0539  hypothetical protein  49.55 
 
 
311 aa  224  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0520  hypothetical protein  48.17 
 
 
307 aa  224  6e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1351  putative transposase YhgA family protein  50 
 
 
296 aa  224  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0581087  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1347  putative transposase YhgA family protein  50 
 
 
296 aa  224  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0644465  normal  0.765955 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4874  hypothetical protein  48.46 
 
 
317 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.702519 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0523  hypothetical protein  49.1 
 
 
311 aa  223  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0529  hypothetical protein  49.1 
 
 
311 aa  222  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0029  transposase  46.96 
 
 
320 aa  222  3e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3445  hypothetical protein  48.62 
 
 
296 aa  221  8e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02129  hypothetical protein  52 
 
 
282 aa  220  9.999999999999999e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1415  putative transposase YhgA family protein  49.77 
 
 
299 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.571537  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0068  putative transposase  52.29 
 
 
296 aa  219  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.565138  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4766  hypothetical protein  49.07 
 
 
334 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0302  putative transposase YhgA family protein  48.13 
 
 
292 aa  211  9e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.78914  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03263  predicted transposase  47.66 
 
 
292 aa  210  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.100095  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03215  hypothetical protein  47.66 
 
 
292 aa  210  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0821559  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3608  hypothetical protein  47.66 
 
 
292 aa  210  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0302  hypothetical protein  47.66 
 
 
292 aa  210  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.094929  normal  0.0909002 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4885  hypothetical protein  48.6 
 
 
318 aa  211  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287711  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3792  hypothetical protein  47.66 
 
 
292 aa  210  1e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4718  hypothetical protein  47.2 
 
 
292 aa  208  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3886  hypothetical protein  47.2 
 
 
292 aa  207  7e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3692  hypothetical protein  47.2 
 
 
292 aa  207  9e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0125  hypothetical protein  48.8 
 
 
298 aa  206  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0141  hypothetical protein  48.61 
 
 
298 aa  206  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00131  predicted transposase  48.56 
 
 
300 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3470  putative transposase YhgA family protein  48.56 
 
 
300 aa  206  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00130  hypothetical protein  48.56 
 
 
300 aa  206  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0135  hypothetical protein  48.8 
 
 
300 aa  205  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3527  putative transposase YhgA family protein  48.56 
 
 
300 aa  206  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.653665  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2727  putative transposase YhgA family protein  48.54 
 
 
310 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0136  hypothetical protein  48.56 
 
 
238 aa  202  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4566  hypothetical protein  48.13 
 
 
314 aa  198  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0911  putative transposase YhgA family protein  44.91 
 
 
298 aa  198  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3724  putative transposase YhgA family protein  47.2 
 
 
314 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0142  ISNCY family transposase  46.63 
 
 
306 aa  195  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1429  putative transposase YhgA family protein  45.37 
 
 
302 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0065  hypothetical protein  50 
 
 
313 aa  187  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0980043  hitchhiker  0.0000000385113 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04207  predicted transposase  52.73 
 
 
255 aa  185  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1547  putative transposase YhgA family protein  42.92 
 
 
288 aa  176  3e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.738107  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04171  hypothetical protein  50.37 
 
 
135 aa  148  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1306  hypothetical protein  28.57 
 
 
275 aa  122  6e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0115  putative transposase  82.09 
 
 
101 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  3.91333e-16  hitchhiker  6.87308e-79 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4924  hypothetical protein  36.3 
 
 
170 aa  88.2  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.414279  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3166  putative transposase YhgA family protein  27.07 
 
 
317 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0894  hypothetical protein  24.78 
 
 
308 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.284853 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2153  hypothetical protein  24.58 
 
 
332 aa  62.8  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.101261 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05826  hypothetical protein  46.25 
 
 
86 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0409  hypothetical protein  24.58 
 
 
336 aa  58.5  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.650641  hitchhiker  0.00708611 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1250  hypothetical protein  25.62 
 
 
331 aa  57.8  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  28.65 
 
 
322 aa  55.8  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0996  hypothetical protein  52.08 
 
 
266 aa  55.1  0.0000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  28.65 
 
 
318 aa  54.3  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2307  hypothetical protein  24.79 
 
 
321 aa  53.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000450312  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2630  hypothetical protein  24.9 
 
 
317 aa  53.1  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  28.21 
 
 
314 aa  52.4  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  27.75 
 
 
322 aa  52.4  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2583  hypothetical protein  42.37 
 
 
317 aa  51.6  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.21441e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0238  hypothetical protein  24.08 
 
 
344 aa  50.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.447255  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  26.94 
 
 
337 aa  51.2  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2547  hypothetical protein  28.57 
 
 
314 aa  50.8  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0376053  normal  0.0608447 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1543  hypothetical protein  24.76 
 
 
323 aa  50.8  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1137  hypothetical protein  52.27 
 
 
256 aa  49.7  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4014  putative transposase  20.87 
 
 
332 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.456112  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2289  hypothetical protein  25.1 
 
 
333 aa  49.7  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0492229  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2880  hypothetical protein  30.98 
 
 
323 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149752  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4059  putative transposase  20.87 
 
 
332 aa  48.9  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.860661 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>