34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_2398 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2398  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  122  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3382  hypothetical protein  90.77 
 
 		 308 aa  116  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2542  hypothetical protein  93.44 
 
 		 300 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2627  hypothetical protein  93.44 
 
 		 300 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2386  hypothetical protein  91.8 
 
 		 300 aa  111  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02170  hypothetical protein  91.8 
 
 		 300 aa  111  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1415  putative transposase YhgA family protein  75.41 
 
 		 299 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.571537  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1406  hypothetical protein  75.41 
 
 		 299 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286093  normal  0.84386 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2397  hypothetical protein  63.01 
 
 		 319 aa  89.4  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02129  hypothetical protein  88.37 
 
 		 282 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3707  hypothetical protein  60.66 
 
 		 304 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3816  hypothetical protein  59.02 
 
 		 304 aa  70.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.792275 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3710  hypothetical protein  57.38 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3782  hypothetical protein  57.38 
 
 		 304 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3878  hypothetical protein  58.46 
 
 		 308 aa  68.2  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2461  hypothetical protein  47.54 
 
 		 300 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.171355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02190  hypothetical protein  45.9 
 
 		 296 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1347  putative transposase YhgA family protein  45.9 
 
 		 296 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0644465  normal  0.765955 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02230  hypothetical protein  45.9 
 
 		 296 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.326611  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1351  putative transposase YhgA family protein  45.9 
 
 		 296 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0581087  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2599  hypothetical protein  45.9 
 
 		 296 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00513302  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4045  hypothetical protein  44.62 
 
 		 309 aa  53.9  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal  0.0374243 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3973  hypothetical protein  44.62 
 
 		 309 aa  53.9  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3445  hypothetical protein  45.9 
 
 		 296 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.143681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3726  putative transposase  40.58 
 
 		 310 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3432  putative transposase YhgA family protein  46.15 
 
 		 218 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0084  hypothetical protein  44.62 
 
 		 319 aa  47.4  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0086  putative transposase  44.62 
 
 		 319 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864811  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4129  putative transposase YhgA family protein  44.62 
 
 		 319 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.683023  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4096  hypothetical protein  40.58 
 
 		 313 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3991  hypothetical protein  40.58 
 
 		 313 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4159  hypothetical protein  40.58 
 
 		 313 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.241117  normal  0.413105 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4718  hypothetical protein  44.83 
 
 		 292 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0302  putative transposase YhgA family protein  44.83 
 
 		 292 aa  40.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.78914  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>