141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0142 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0142  ISNCY family transposase  100 
 
 
306 aa  632  1e-180  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00131  predicted transposase  92.16 
 
 
300 aa  580  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3470  putative transposase YhgA family protein  92.16 
 
 
300 aa  580  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3527  putative transposase YhgA family protein  92.16 
 
 
300 aa  580  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.653665  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00130  hypothetical protein  92.16 
 
 
300 aa  580  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.969091  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0135  hypothetical protein  91.5 
 
 
300 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0125  hypothetical protein  91.5 
 
 
298 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0141  hypothetical protein  91.18 
 
 
298 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0136  hypothetical protein  90.98 
 
 
238 aa  455  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3726  putative transposase  53.54 
 
 
310 aa  320  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3878  hypothetical protein  51.97 
 
 
308 aa  317  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3782  hypothetical protein  51.66 
 
 
304 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3816  hypothetical protein  51.66 
 
 
304 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.792275 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3710  hypothetical protein  51.66 
 
 
304 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3707  hypothetical protein  50.99 
 
 
304 aa  311  9e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2461  hypothetical protein  52.22 
 
 
300 aa  309  4e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.171355  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02230  hypothetical protein  51.88 
 
 
296 aa  308  6.999999999999999e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.326611  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2599  hypothetical protein  51.88 
 
 
296 aa  308  6.999999999999999e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00513302  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02190  hypothetical protein  51.88 
 
 
296 aa  308  6.999999999999999e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.428095  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1351  putative transposase YhgA family protein  51.88 
 
 
296 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0581087  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1347  putative transposase YhgA family protein  51.88 
 
 
296 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0644465  normal  0.765955 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3445  hypothetical protein  55.09 
 
 
296 aa  306  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.143681  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0086  putative transposase  53.44 
 
 
319 aa  305  7e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.864811  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0084  hypothetical protein  53.44 
 
 
319 aa  305  7e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4129  putative transposase YhgA family protein  53.44 
 
 
319 aa  305  7e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.683023  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3382  hypothetical protein  50.66 
 
 
308 aa  303  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0122  putative transposase  51.52 
 
 
313 aa  302  6.000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  1.2156300000000001e-29 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4045  hypothetical protein  51.5 
 
 
309 aa  301  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.673826  normal  0.0374243 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3973  hypothetical protein  51.5 
 
 
309 aa  301  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4776  hypothetical protein  49.84 
 
 
317 aa  298  8e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4874  hypothetical protein  49.84 
 
 
317 aa  297  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.702519 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0520  hypothetical protein  47.67 
 
 
307 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4851  hypothetical protein  49.52 
 
 
321 aa  296  3e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2542  hypothetical protein  50.99 
 
 
300 aa  296  4e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2627  hypothetical protein  50.99 
 
 
300 aa  296  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4096  hypothetical protein  51.8 
 
 
313 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0539  hypothetical protein  47.57 
 
 
311 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3991  hypothetical protein  51.8 
 
 
313 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4159  hypothetical protein  51.8 
 
 
313 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.241117  normal  0.413105 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02170  hypothetical protein  50.99 
 
 
300 aa  295  7e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1406  hypothetical protein  50.83 
 
 
299 aa  295  7e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.286093  normal  0.84386 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2397  hypothetical protein  48.57 
 
 
319 aa  294  1e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0523  hypothetical protein  47.25 
 
 
311 aa  293  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0529  hypothetical protein  47.7 
 
 
311 aa  292  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2386  hypothetical protein  50.66 
 
 
300 aa  291  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0599  putative transposase YhgA family protein  48.68 
 
 
318 aa  291  1e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02129  hypothetical protein  51.74 
 
 
282 aa  291  1e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1415  putative transposase YhgA family protein  50.17 
 
 
299 aa  288  6e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.571537  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3692  hypothetical protein  52.96 
 
 
292 aa  285  7e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03263  predicted transposase  52.96 
 
 
292 aa  285  8e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.100095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3608  hypothetical protein  52.96 
 
 
292 aa  285  8e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0302  hypothetical protein  52.96 
 
 
292 aa  285  8e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.094929  normal  0.0909002 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03215  hypothetical protein  52.96 
 
 
292 aa  285  8e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0821559  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0302  putative transposase YhgA family protein  48.61 
 
 
292 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.78914  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3792  hypothetical protein  52.57 
 
 
292 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4718  hypothetical protein  48.96 
 
 
292 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04207  predicted transposase  53.97 
 
 
255 aa  281  8.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3886  hypothetical protein  52.17 
 
 
292 aa  281  1e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4885  hypothetical protein  46.33 
 
 
318 aa  280  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.287711  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4766  hypothetical protein  50.37 
 
 
334 aa  280  2e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4566  hypothetical protein  52.85 
 
 
314 aa  279  5e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3724  putative transposase YhgA family protein  52.85 
 
 
314 aa  276  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04729  hypothetical protein  45.7 
 
 
309 aa  276  4e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0029  transposase  46.37 
 
 
320 aa  273  4.0000000000000004e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2727  putative transposase YhgA family protein  45.64 
 
 
310 aa  262  4.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0039  transposase  40.78 
 
 
316 aa  259  5.0000000000000005e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1429  putative transposase YhgA family protein  41.61 
 
 
302 aa  250  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0068  putative transposase  47.84 
 
 
296 aa  249  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.565138  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3046  transposase  44.13 
 
 
282 aa  248  8e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131132  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1547  putative transposase YhgA family protein  42.81 
 
 
288 aa  245  8e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.738107  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0065  hypothetical protein  47.56 
 
 
313 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0980043  hitchhiker  0.0000000385113 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0911  putative transposase YhgA family protein  43.4 
 
 
298 aa  239  5e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3432  putative transposase YhgA family protein  46.63 
 
 
218 aa  195  7e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04171  hypothetical protein  48.89 
 
 
135 aa  136  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04170  hypothetical protein  60.2 
 
 
103 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.858892  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0894  hypothetical protein  29.9 
 
 
308 aa  132  6e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.284853 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3166  putative transposase YhgA family protein  26.28 
 
 
317 aa  102  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2880  hypothetical protein  28.57 
 
 
323 aa  95.5  9e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149752  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  30 
 
 
322 aa  94.7  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1250  hypothetical protein  34.75 
 
 
331 aa  94.4  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0628  hypothetical protein  33.06 
 
 
327 aa  92.4  7e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.939458  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2902  putative transposase  27.74 
 
 
335 aa  92.4  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0045  hypothetical protein  26.35 
 
 
341 aa  90.9  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.242935 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  30.32 
 
 
322 aa  90.9  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2547  hypothetical protein  29.63 
 
 
314 aa  88.2  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0376053  normal  0.0608447 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  29.56 
 
 
318 aa  88.6  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0878  putative transposase  27.54 
 
 
321 aa  87.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0147  hypothetical protein  31.97 
 
 
141 aa  87.4  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.320665  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  28.15 
 
 
345 aa  86.7  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  29.26 
 
 
314 aa  86.7  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2960  putative transposase  27.74 
 
 
329 aa  86.3  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26307  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0990  putative transposase  27.37 
 
 
321 aa  85.1  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.271034  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  26.73 
 
 
337 aa  85.5  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1034  hypothetical protein  25.45 
 
 
312 aa  85.5  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1059  putative transposase  28.62 
 
 
329 aa  84.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1306  hypothetical protein  34.13 
 
 
275 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0802  putative transposase  28.26 
 
 
333 aa  82.4  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1702  hypothetical protein  29.68 
 
 
326 aa  82.4  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.412934  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2785  hypothetical protein  27.13 
 
 
310 aa  79  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  27.3 
 
 
343 aa  77  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>