More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_00849 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012892  B21_00855  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  185  1e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00849  putative DNA-invertase  100 
 
 		 91 aa  185  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  98.75 
 
 		 188 aa  163  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  93.75 
 
 		 184 aa  156  9e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  93.75 
 
 		 184 aa  156  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  92.5 
 
 		 197 aa  154  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  71.25 
 
 		 189 aa  118  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  66.25 
 
 		 188 aa  117  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  67.5 
 
 		 185 aa  117  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  67.5 
 
 		 185 aa  116  9e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  67.95 
 
 		 187 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  67.95 
 
 		 190 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  67.95 
 
 		 188 aa  114  5e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  65 
 
 		 185 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  65 
 
 		 185 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1818  Resolvase domain protein  65 
 
 		 184 aa  111  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  61.73 
 
 		 193 aa  110  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  66.25 
 
 		 185 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  66.25 
 
 		 185 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  65 
 
 		 188 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  66.25 
 
 		 188 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  63.75 
 
 		 185 aa  106  9.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  69.44 
 
 		 193 aa  106  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  60.24 
 
 		 209 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  62.96 
 
 		 197 aa  105  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  56.79 
 
 		 201 aa  105  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  59.04 
 
 		 201 aa  104  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  62.5 
 
 		 309 aa  103  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  60.49 
 
 		 191 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  61.73 
 
 		 189 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  60.49 
 
 		 191 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  60 
 
 		 307 aa  101  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  60 
 
 		 307 aa  101  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  59.26 
 
 		 188 aa  101  4e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  58.75 
 
 		 192 aa  101  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2170  DNA invertase  61.73 
 
 		 281 aa  101  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0593579  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  58.75 
 
 		 197 aa  100  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  58.75 
 
 		 197 aa  100  5e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  59.26 
 
 		 203 aa  100  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  57.5 
 
 		 199 aa  100  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4931  resolvase domain-containing protein  60 
 
 		 208 aa  100  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.107506  normal  0.566204 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  58.75 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  56.63 
 
 		 189 aa  99.4  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  68.06 
 
 		 193 aa  99.4  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0219  DNA-invertase hin  56.25 
 
 		 184 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0242276 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4488  DNA-invertase  53.75 
 
 		 187 aa  98.6  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.258493  normal  0.0155508 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0073  resolvase  56.25 
 
 		 184 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  56.25 
 
 		 187 aa  98.6  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  56.25 
 
 		 186 aa  98.2  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  56.1 
 
 		 182 aa  97.1  7e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  60.26 
 
 		 194 aa  97.1  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9833  Resolvase Protein  60.24 
 
 		 210 aa  96.3  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0696  resolvase-like protein  57.83 
 
 		 190 aa  95.9  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  60.49 
 
 		 194 aa  95.5  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  57.5 
 
 		 201 aa  94.7  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  56.98 
 
 		 194 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0585  resolvase-like protein  60.26 
 
 		 189 aa  94.7  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.698292  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  56.98 
 
 		 194 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  56.79 
 
 		 184 aa  94.4  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  53.75 
 
 		 184 aa  94  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  60.27 
 
 		 219 aa  94  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  55 
 
 		 201 aa  92.8  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  56.79 
 
 		 198 aa  93.2  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  53.09 
 
 		 190 aa  93.2  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2347  Resolvase domain protein  55.81 
 
 		 204 aa  92  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  57.65 
 
 		 204 aa  92  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  57.65 
 
 		 204 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  53.75 
 
 		 186 aa  92  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3007  resolvase-like protein  55.95 
 
 		 204 aa  92  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0154323 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4042  serine-based site-specific recombinase activity  55.95 
 
 		 204 aa  92  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  0.169813 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4975  serine-based site-specific recombinase activity  55.95 
 
 		 204 aa  92  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.283487  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  58.23 
 
 		 209 aa  92.4  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  48.75 
 
 		 181 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  51.28 
 
 		 183 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  56.25 
 
 		 176 aa  92  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  51.28 
 
 		 183 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  50 
 
 		 188 aa  91.3  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  56.79 
 
 		 193 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  52.56 
 
 		 195 aa  90.5  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  56.79 
 
 		 193 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  56.79 
 
 		 193 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  56.79 
 
 		 193 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  58.02 
 
 		 189 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  55.56 
 
 		 197 aa  89.4  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  53.75 
 
 		 188 aa  89.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  51.95 
 
 		 191 aa  89  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  56.47 
 
 		 206 aa  89  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  55.56 
 
 		 193 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  56.41 
 
 		 189 aa  88.6  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  51.25 
 
 		 201 aa  88.6  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  55.56 
 
 		 196 aa  87.8  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  52.44 
 
 		 305 aa  87.4  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  51.95 
 
 		 198 aa  87  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  52.44 
 
 		 197 aa  86.7  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  57.14 
 
 		 215 aa  86.7  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  58.02 
 
 		 214 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3606  resolvase domain-containing protein  54.65 
 
 		 219 aa  85.9  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996271 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1104  resolvase domain-containing protein  54.65 
 
 		 219 aa  85.9  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3570  resolvase domain-containing protein  53.49 
 
 		 197 aa  85.9  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3497  resolvase domain-containing protein  54.65 
 
 		 219 aa  85.9  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503079  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>