More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2232 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2232  extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 373 aa  746    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2773  Extracellular ligand-binding receptor  47.19 
 
 		 413 aa  298  7e-80  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2831  substrate-binding protein, putative  42.61 
 
 		 375 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00332473  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2331  Extracellular ligand-binding receptor  41.33 
 
 		 377 aa  240  4e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0744  Extracellular ligand-binding receptor  40.06 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2389  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  37.39 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.520842  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1970  extracellular ligand-binding receptor  35.45 
 
 		 372 aa  213  5.999999999999999e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0123  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0532  Extracellular ligand-binding receptor  35.66 
 
 		 370 aa  202  8e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0390708  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2947  extracellular ligand-binding receptor  33.05 
 
 		 367 aa  176  8e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.752891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0561  Extracellular ligand-binding receptor  30.46 
 
 		 368 aa  142  7e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.378991  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  29.17 
 
 		 384 aa  133  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  27.84 
 
 		 404 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  27.56 
 
 		 404 aa  123  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  29.68 
 
 		 374 aa  123  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  25.58 
 
 		 376 aa  123  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  27.56 
 
 		 404 aa  123  6e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  26.78 
 
 		 402 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  27.14 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1392  extracellular ligand-binding receptor  29 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  27.76 
 
 		 381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0937  Extracellular ligand-binding receptor  26.75 
 
 		 380 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000952162  normal  0.230854 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 419 aa  110  5e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0522  Extracellular ligand-binding receptor  28.06 
 
 		 387 aa  110  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  24.54 
 
 		 390 aa  108  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  26.5 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  27.42 
 
 		 378 aa  106  7e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  26.32 
 
 		 382 aa  105  1e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1478  Extracellular ligand-binding receptor  27.25 
 
 		 376 aa  105  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  28 
 
 		 398 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1598  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.57 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0260  extracellular ligand-binding receptor  27.11 
 
 		 380 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.962079 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2829  extracellular ligand-binding receptor  27.11 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.617546  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0278  extracellular ligand-binding receptor  27.11 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730585  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1610  extracellular ligand-binding receptor  28.36 
 
 		 370 aa  100  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136446  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0192  extracellular ligand-binding receptor  26.29 
 
 		 380 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1257  extracellular ligand-binding receptor  24.11 
 
 		 386 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000744493  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0660  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26 
 
 		 380 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.792803  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2389  outative extracellular ligand binding protein  26 
 
 		 372 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1769  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26 
 
 		 380 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1178  outative extracellular ligand binding protein  26 
 
 		 380 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0805  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26 
 
 		 380 aa  99.8  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.351699  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1468  extracellular ligand-binding receptor  26.25 
 
 		 369 aa  100  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000538626  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1102  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  26 
 
 		 380 aa  99.8  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391264  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0051  outative extracellular ligand binding protein  25.71 
 
 		 380 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3381  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.53 
 
 		 380 aa  99.8  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3831  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.71 
 
 		 380 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3912  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.71 
 
 		 380 aa  99.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.24 
 
 		 399 aa  99.4  8e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2901  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.71 
 
 		 376 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.971399  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3407  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.71 
 
 		 380 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.251793  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0112  extracellular ligand-binding receptor  27.43 
 
 		 381 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3488  extracellular ligand-binding receptor  26.49 
 
 		 383 aa  99.4  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.761675 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0562  extracellular ligand-binding receptor  26.32 
 
 		 385 aa  99  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.419655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1639  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.71 
 
 		 380 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.516456  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0205  extracellular ligand-binding receptor  26 
 
 		 380 aa  99.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2962  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  25.71 
 
 		 380 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.49524  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3105  extracellular ligand-binding receptor  26.05 
 
 		 389 aa  99.4  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0186  extracellular ligand-binding receptor  26.24 
 
 		 380 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000207737 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3339  extracellular ligand-binding receptor  26.19 
 
 		 383 aa  97.4  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0137407  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2491  extracellular ligand-binding receptor  24.79 
 
 		 373 aa  97.1  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3158  amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26 
 
 		 380 aa  97.4  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  24 
 
 		 394 aa  96.7  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0588  extracellular ligand-binding receptor  27.7 
 
 		 399 aa  96.7  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1620  extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 		 443 aa  96.3  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3728  extracellular ligand-binding receptor  28.27 
 
 		 392 aa  96.3  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172455  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  26.71 
 
 		 376 aa  95.9  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1267  Extracellular ligand-binding receptor  26.37 
 
 		 471 aa  94.7  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6079  extracellular ligand-binding receptor  26.92 
 
 		 384 aa  95.1  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.829496  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1298  Extracellular ligand-binding receptor  26.37 
 
 		 471 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5831  extracellular ligand-binding receptor  27.01 
 
 		 384 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.468117  normal  0.310951 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  26.03 
 
 		 388 aa  94.4  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2553  extracellular ligand-binding receptor  26.98 
 
 		 386 aa  94.4  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4327  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.14 
 
 		 402 aa  94.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6057  extracellular ligand-binding receptor  27.01 
 
 		 384 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0393  Extracellular ligand-binding receptor  27.14 
 
 		 381 aa  94  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1583  extracellular ligand-binding receptor  28.06 
 
 		 450 aa  93.6  5e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0090  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.71 
 
 		 395 aa  93.6  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0960253  normal  0.350813 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1490  Extracellular ligand-binding receptor  27.11 
 
 		 397 aa  93.6  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1866  extracellular ligand-binding receptor  27.73 
 
 		 373 aa  93.2  6e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5783  extracellular ligand-binding receptor  26.15 
 
 		 384 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6148  extracellular ligand-binding receptor  26.15 
 
 		 384 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.392362 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2361  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  24.86 
 
 		 385 aa  93.2  7e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6407  Extracellular ligand-binding receptor  27.81 
 
 		 380 aa  92.8  8e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7692  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.51 
 
 		 384 aa  92.8  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.854568 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  26.09 
 
 		 378 aa  92.8  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4867  extracellular ligand-binding receptor  26.09 
 
 		 378 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0924005  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  25.69 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4923  extracellular ligand-binding receptor  26.09 
 
 		 378 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4745  extracellular ligand-binding receptor  26.09 
 
 		 378 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000119526 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5638  putative ABC transporter binding protein subunit  25.07 
 
 		 413 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  25.69 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0611  Extracellular ligand-binding receptor  25.73 
 
 		 371 aa  91.7  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2873  extracellular ligand-binding receptor  25.82 
 
 		 394 aa  91.3  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.716938  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2254  extracellular ligand-binding receptor  27.84 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6628  extracellular ligand-binding receptor  26.63 
 
 		 384 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.733405 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3170  Extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 		 381 aa  91.3  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3495  Extracellular ligand-binding receptor  24.52 
 
 		 381 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2114  Extracellular ligand-binding receptor  24.16 
 
 		 405 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.447818  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1306  Extracellular ligand-binding receptor  25.56 
 
 		 471 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0821  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.43 
 
 		 399 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>