More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0659 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0659  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  488  1e-137  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3674  two component transcriptional regulator  47.95 
 
 		 263 aa  195  6e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03339  Response regulator consisting of a CheY-like receiver domain and a winged-helix DNA-binding domain  45.21 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0130  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.34 
 
 		 224 aa  187  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00147609  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.36 
 
 		 224 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000226454  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0451  DNA-binding response regulator  44.64 
 
 		 224 aa  185  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.91 
 
 		 224 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3081  two component signal transduction response regulator  46.12 
 
 		 223 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  45.09 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  44.55 
 
 		 224 aa  182  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 243 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 243 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 243 aa  180  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  45.45 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0419  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 229 aa  179  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0016  two component transcriptional regulator  47.49 
 
 		 262 aa  178  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0461  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 248 aa  178  8e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.735267  normal  0.697364 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0944  two component transcriptional regulator  44 
 
 		 225 aa  177  9e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.091613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0191  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 244 aa  177  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  42.02 
 
 		 246 aa  177  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1407  two component transcriptional regulator  44.95 
 
 		 265 aa  177  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0902  two component transcriptional regulator  45.91 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375579  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.7 
 
 		 226 aa  177  2e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 240 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2337  two component heavy metal response transcriptional regulator  43.81 
 
 		 227 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27810  putative two-component response regulator  43.44 
 
 		 226 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5178  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.22 
 
 		 225 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.341313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3106  two component heavy metal response transcriptional regulator  45.45 
 
 		 225 aa  175  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3888  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 223 aa  175  6e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.130623  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1727  two component transcriptional regulator  45.7 
 
 		 228 aa  175  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.284746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2348  putative two-component response regulator  43.44 
 
 		 228 aa  174  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.804247  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0451  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.44 
 
 		 230 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4428  DNA-binding response regulator  42.92 
 
 		 225 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0275  two component transcriptional regulator  44.34 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2666  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.128945  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0998  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.73 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5481  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.34 
 
 		 228 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.537932  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0281  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000001543 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3740  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.026682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0282  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 225 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.919503  hitchhiker  0.00000025705 
 
 
-
 
NC_004310  BR0612  DNA-binding response regulator  43.44 
 
 		 235 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.688885  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0611  DNA-binding response regulator  43.44 
 
 		 235 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 231 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  43.3 
 
 		 231 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2141  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 241 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.316028  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2157  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.84 
 
 		 226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.05 
 
 		 238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5099  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0773075 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3099  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 		 235 aa  172  3.9999999999999995e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.663462 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0450  two component transcriptional regulator  45.05 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3517  two component transcriptional regulator  45 
 
 		 238 aa  172  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0423488  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0286  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 225 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0298  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 225 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.77813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2913  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 227 aa  172  5e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0379396  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2950  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.58 
 
 		 258 aa  172  5e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0307025  normal  0.153934 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0397  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 225 aa  172  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0638  two component transcriptional regulator  44.8 
 
 		 233 aa  172  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.403787  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0293  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 225 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.973428  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.73 
 
 		 225 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0019  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.73 
 
 		 225 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.593373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2957  two component transcriptional regulator  41.82 
 
 		 223 aa  172  5.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000406961  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0017  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.73 
 
 		 225 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468746 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4516  two component transcriptional regulator  43.18 
 
 		 225 aa  172  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0294  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 225 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1841  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  42.99 
 
 		 228 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.99331  hitchhiker  0.00000222676 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3985  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  45 
 
 		 226 aa  171  7.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1196  two-component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 238 aa  171  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2012  winged helix family two component transcriptional regulator  42.53 
 
 		 241 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  0.606644 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  43.44 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  43.44 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2236  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.214459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  43.44 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4392  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0025821  decreased coverage  0.00000564878 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  43.95 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4798  two component transcriptional regulator  44.3 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.358461 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4783  two component transcriptional regulator  43.38 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000784885  unclonable  0.00000000984925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2474  heavy metal response regulator  43.38 
 
 		 223 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0435  DNA-binding response regulator  41.78 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1718  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.348336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1377  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.41 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000301655 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1780  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal  0.826624 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3484  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.524014  normal  0.179131 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1241  two component transcriptional regulator  42.47 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5335  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  43.44 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.970872 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2757  response regulator receiver  41.89 
 
 		 225 aa  169  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1236  two component heavy metal response transcriptional regulator  44.29 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3078  two component transcriptional regulator  42.53 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0224  two component transcriptional regulator  44.55 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.175792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3442  two component transcriptional regulator  41.52 
 
 		 241 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.297648  normal  0.0871248 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.79 
 
 		 219 aa  169  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4110  two component transcriptional regulator  42.92 
 
 		 225 aa  168  5e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.27 
 
 		 225 aa  168  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1442  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 230 aa  168  6e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1330  response regulator receiver  45.21 
 
 		 219 aa  168  8e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4055  two component heavy metal response transcriptional regulator, winged helix family  44.55 
 
 		 226 aa  168  9e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1699  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.99 
 
 		 226 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419772 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3584  two component heavy metal response transcriptional regulator  42.99 
 
 		 226 aa  168  9e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>