More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0528 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0528  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  100 
 
 
341 aa  671    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1204  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  76.56 
 
 
339 aa  513  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.109569 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0750  FMN-dependent family dehydrogenase  70.21 
 
 
340 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1976  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  66.18 
 
 
338 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0157  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  63.91 
 
 
336 aa  420  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1257  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  51.48 
 
 
340 aa  353  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1075  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  52.89 
 
 
339 aa  344  1e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2132  FMN-dependent dehydrogenase  49.85 
 
 
340 aa  336  3.9999999999999995e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1844  hydroxyacid oxidase 2  49.26 
 
 
340 aa  333  2e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3545  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  47.21 
 
 
407 aa  303  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0421614  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2031  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.94 
 
 
336 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.268129 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2319  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  42.94 
 
 
337 aa  261  1e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2255  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  39.05 
 
 
343 aa  256  5e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1817  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  33.02 
 
 
349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.466899 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1462  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  31.1 
 
 
352 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0238326  normal  0.034718 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4676  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  56.15 
 
 
363 aa  127  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00322368  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2999  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  35.03 
 
 
366 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0804  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  52.85 
 
 
389 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4638  L-lactate dehydrogenase  53.12 
 
 
384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.76191  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0378  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  34.04 
 
 
371 aa  119  4.9999999999999996e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2360  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  30.41 
 
 
379 aa  119  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0702  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  53.91 
 
 
369 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.494173 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0859  hypothetical protein  28.81 
 
 
308 aa  117  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12350  L-lactate dehydrogenase/FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  32.45 
 
 
371 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.205767  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1864  L-lactate dehydrogenase (FMN-dependent) related alpha-hydroxy acid dehydrogenase  31.02 
 
 
417 aa  117  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.213677  hitchhiker  0.000000000554071 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4736  L-lactate dehydrogenase  52.34 
 
 
381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000909372 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4737  L-lactate dehydrogenase  51.94 
 
 
381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4602  L-lactate dehydrogenase  52.34 
 
 
381 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0515412  normal  0.0177303 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4132  L-lactate dehydrogenase  29.86 
 
 
386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0695  L-lactate dehydrogenase  53.12 
 
 
381 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000139507 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13410  alpha-hydroxyacid dehydrogenase, FMN-dependent L-lactate dehydrogenase  32.21 
 
 
388 aa  116  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4251  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  51.88 
 
 
348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.731612  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0254  L-lactate dehydrogenase  49.61 
 
 
378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3083  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  52.67 
 
 
395 aa  114  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.796124  normal  0.594065 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0404  L-lactate dehydrogenase  47.66 
 
 
392 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4413  L-lactate dehydrogenase  29.32 
 
 
386 aa  113  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4469  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  30.6 
 
 
395 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0508385 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03463  L-lactate dehydrogenase  49.22 
 
 
388 aa  112  8.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0123  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  30.23 
 
 
295 aa  112  9e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.895789  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2344  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  29.41 
 
 
300 aa  112  9e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3635  L-lactate dehydrogenase  50.4 
 
 
379 aa  112  9e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2344  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  48.84 
 
 
395 aa  112  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03414  hypothetical protein  46.09 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03463  L-lactate dehydrogenase, FMN-linked  46.09 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0100  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  46.09 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4978  L-lactate dehydrogenase  46.09 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0103  L-lactate dehydrogenase  46.09 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0130  L-lactate dehydrogenase  46.09 
 
 
395 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3817  L-lactate dehydrogenase  46.09 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3973  L-lactate dehydrogenase  47.58 
 
 
396 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.749794 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4109  L-lactate dehydrogenase  46.09 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1074  Lactate 2-monooxygenase  31.83 
 
 
393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3942  L-lactate dehydrogenase  46.09 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5491  L-lactate dehydrogenase  47.24 
 
 
381 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.316989  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3895  L-lactate dehydrogenase  47.58 
 
 
396 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.479872 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4031  L-lactate dehydrogenase  46.09 
 
 
396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001223  L-lactate dehydrogenase  48.84 
 
 
379 aa  111  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3911  L-lactate dehydrogenase  47.58 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2810  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  53.23 
 
 
382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.954761  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1696  L-lactate dehydrogenase  47.66 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0334813 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3487  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  53.23 
 
 
383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.323095  normal  0.958366 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2506  L-lactate dehydrogenase  47.66 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2409  L-lactate dehydrogenase  47.66 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2407  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  43.24 
 
 
406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.463668  normal  0.0231198 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4080  L-lactate dehydrogenase  47.58 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4018  L-lactate dehydrogenase  47.58 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63090  L-lactate dehydrogenase  47.24 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0242094  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5156  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  43.61 
 
 
415 aa  110  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.309178  normal  0.804479 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1029  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  46.58 
 
 
397 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.918253  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1002  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  46.58 
 
 
397 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3929  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  44.27 
 
 
388 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0176319  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1019  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  46.58 
 
 
397 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.26668  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1050  L-lactate dehydrogenase  45.04 
 
 
381 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3368  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50 
 
 
406 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000428393  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2560  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  32.16 
 
 
396 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00607749 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3608  L-lactate dehydrogenase  50 
 
 
380 aa  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.236817  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2463  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  54.03 
 
 
348 aa  106  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.283428  normal  0.44924 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6013  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  46.15 
 
 
397 aa  106  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0169115 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3519  L-lactate dehydrogenase  47.15 
 
 
378 aa  106  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578811 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0360  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.73 
 
 
370 aa  106  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.123404  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2829  L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  47.73 
 
 
388 aa  106  7e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1430  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  48.48 
 
 
366 aa  105  9e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0230431  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1297  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  43.14 
 
 
391 aa  105  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0902031 
 
 
-
 
NC_006686  CND02080  hypothetical protein  45.59 
 
 
370 aa  105  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0579  FMN-dependent dehydrogenase  49.61 
 
 
412 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3151  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  44.3 
 
 
400 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0698274  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3045  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  43.28 
 
 
374 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2398  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  31.52 
 
 
359 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.940863  normal  0.750352 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2444  FMN-dependent dehydrogenase  46.88 
 
 
412 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0283  FMN-dependent dehydrogenase  46.88 
 
 
412 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.130627  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1816  putative L-lactate dehydrogenase (cytochrome)  45.74 
 
 
378 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0882  FMN-dependent dehydrogenase  46.88 
 
 
412 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.726266  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1660  FMN-dependent dehydrogenase  46.88 
 
 
440 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.599587  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2580  L-lactate dehydrogenase  46.88 
 
 
412 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3777  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  43.71 
 
 
407 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0315  FMN-dependent dehydrogenase  46.88 
 
 
440 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0990352  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1463  FMN-dependent dehydrogenase  46.88 
 
 
440 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.675409  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0107  putative FMN-dependent dehydrogenase  43.06 
 
 
420 aa  104  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4598  FMN-dependent alpha-hydroxy acid dehydrogenase  31.64 
 
 
376 aa  104  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3346  L-lactate dehydrogenase  45.16 
 
 
379 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.551416 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>