114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1984 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_2833  hypothetical protein  86.51 
 
 
415 aa  648    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.260143  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1984  protein of unknown function DUF81  100 
 
 
415 aa  808    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0357  protein of unknown function DUF81  81.67 
 
 
420 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0644  hypothetical protein  77.64 
 
 
417 aa  593  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  60.24 
 
 
426 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1427  hypothetical protein  59.08 
 
 
428 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000425148  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1353  hypothetical protein  56.24 
 
 
427 aa  455  1e-127  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000251364  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0315  protein of unknown function DUF81  56.83 
 
 
415 aa  457  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24542  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3160  protein of unknown function DUF81  58.35 
 
 
443 aa  441  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2103  protein of unknown function DUF81  33.89 
 
 
352 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2673  protein of unknown function DUF81  32.9 
 
 
349 aa  138  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.970315  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1799  protein of unknown function DUF81  32.93 
 
 
356 aa  139  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1011  protein of unknown function DUF81  33.55 
 
 
362 aa  136  8e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0652909 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0095  hypothetical protein  31.83 
 
 
356 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.571557  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1512  hypothetical protein  31.58 
 
 
360 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.864681  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0264  protein of unknown function DUF81  29.32 
 
 
345 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2613  hypothetical protein  28.15 
 
 
361 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.303309 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0285  protein of unknown function DUF81  31.32 
 
 
350 aa  113  8.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0253252 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4296  protein of unknown function DUF81  31.97 
 
 
346 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  30.53 
 
 
305 aa  108  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0703  protein of unknown function DUF81  34.09 
 
 
312 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.619223 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  30.5 
 
 
296 aa  107  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1975  hypothetical protein  33.21 
 
 
394 aa  104  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  30.74 
 
 
307 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  30.39 
 
 
307 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  31.23 
 
 
305 aa  100  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  29.58 
 
 
308 aa  99.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  35.25 
 
 
303 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  29.6 
 
 
307 aa  99  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  31.82 
 
 
310 aa  96.7  8e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2342  protein of unknown function DUF81  31.66 
 
 
350 aa  96.3  9e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2818  hypothetical protein  31.44 
 
 
350 aa  96.3  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0626  hypothetical protein  31.84 
 
 
356 aa  94.4  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  31.9 
 
 
306 aa  94  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  29.55 
 
 
306 aa  90.9  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1316  hypothetical protein  32.28 
 
 
339 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.919916  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  29.15 
 
 
306 aa  89  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4256  protein of unknown function DUF81  31.27 
 
 
330 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0638  hypothetical protein  28.88 
 
 
355 aa  87.4  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.328833  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1641  protein of unknown function DUF81  29.26 
 
 
354 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.407514  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  29.48 
 
 
320 aa  86.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  28.32 
 
 
343 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  29.69 
 
 
307 aa  84.3  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  33.18 
 
 
307 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  31.17 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1032  protein of unknown function DUF81  31.66 
 
 
329 aa  82  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  27.34 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  28.68 
 
 
307 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  28.08 
 
 
316 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  26.16 
 
 
308 aa  79  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  28.79 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  30.49 
 
 
330 aa  76.6  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  27.74 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  27.56 
 
 
315 aa  76.6  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  27.66 
 
 
308 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  27.17 
 
 
306 aa  72.4  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  27.14 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  31.94 
 
 
2798 aa  67  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1044  protein of unknown function DUF81  30.16 
 
 
349 aa  67  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.161703  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2487  hypothetical protein  30.85 
 
 
307 aa  66.6  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.741718 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0529  protein of unknown function DUF81  31.27 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.639681  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1793  protein of unknown function DUF81  27.73 
 
 
348 aa  65.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3721  protein of unknown function DUF81  29.44 
 
 
346 aa  65.1  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.766072  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2732  hypothetical protein  27.92 
 
 
307 aa  62  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.990455  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  26.33 
 
 
309 aa  60.8  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  26.47 
 
 
304 aa  60.5  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3097  hypothetical protein  25.46 
 
 
307 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0521383  normal  0.0206179 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1504  hypothetical protein  25.44 
 
 
255 aa  57  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00278101  normal  0.358981 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  26.32 
 
 
313 aa  56.2  0.000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18800  predicted permease  27.76 
 
 
323 aa  54.7  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  27.63 
 
 
300 aa  54.3  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5288  protein of unknown function DUF81  27.02 
 
 
307 aa  53.5  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000586578  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0245  hypothetical protein  28.87 
 
 
308 aa  52  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.176673  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0031  permease  25.38 
 
 
257 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00380  predicted permease  27.92 
 
 
277 aa  51.2  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1020  protein of unknown function DUF81  26.43 
 
 
325 aa  50.1  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  36.17 
 
 
262 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  36.17 
 
 
262 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2342  hypothetical protein  26.72 
 
 
253 aa  49.7  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0230503 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  33.33 
 
 
260 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  29.92 
 
 
260 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1480  hypothetical protein  39.73 
 
 
264 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0480  protein of unknown function DUF81  41.1 
 
 
119 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.441073  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1543  hypothetical protein  36.17 
 
 
139 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000133691 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  35.56 
 
 
266 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  36.36 
 
 
266 aa  47.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  32 
 
 
267 aa  47.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  33.33 
 
 
267 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  33.33 
 
 
269 aa  46.6  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2185  hypothetical protein  24.11 
 
 
257 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000204592  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  28.57 
 
 
255 aa  46.2  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  23.13 
 
 
251 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  23.13 
 
 
251 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  34.74 
 
 
260 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  34.74 
 
 
260 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1540  hypothetical protein  36.92 
 
 
305 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.472601 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  43.66 
 
 
260 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  34.74 
 
 
260 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0758  protein of unknown function DUF81  24.73 
 
 
342 aa  45.4  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.154844  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  34.74 
 
 
260 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>