More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1696 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_1696  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
402 aa  822    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0238  phosphoglycerate mutase  72.39 
 
 
402 aa  611  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0511  6-phosphofructo-2-kinase  65.68 
 
 
410 aa  551  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0350  Phosphoglycerate mutase  56.11 
 
 
405 aa  464  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0204  Phosphoglycerate mutase  49.24 
 
 
408 aa  377  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10844  hypothetical protein similar to fructose-2,6-bisphosphatase (Eurofung)  35.7 
 
 
443 aa  196  6e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_68318  fructose-2,6-bisphosphatase (FBP26)  31.74 
 
 
456 aa  192  9e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.995791  normal  0.428172 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03630  6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2, 6-bisphosphatase bifunctional enzyme, putative  33.75 
 
 
658 aa  188  1e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17495  bifunctional 6-phosphofructo-2-kinase  32.3 
 
 
540 aa  177  4e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85029  6-phosphofructose-2-kinase  27.66 
 
 
892 aa  151  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00430923  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40330  predicted protein  30.3 
 
 
506 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05144  hypothetical protein similar to 6-phosphofructo-2-kinase (Eurofung)  28.76 
 
 
700 aa  137  4e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8706  predicted protein  26.03 
 
 
398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.866499  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA05980  cytoplasm protein, putative  25.79 
 
 
605 aa  96.7  6e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.023684  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_3092  predicted protein  29.71 
 
 
240 aa  89.7  7e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.760801  normal  0.0555608 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 
214 aa  87  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1007  Phosphoglycerate mutase  29.14 
 
 
204 aa  85.9  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.628079 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  29.81 
 
 
208 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 
241 aa  84  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  34.52 
 
 
197 aa  84  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1859  phosphatase PhoE  30.95 
 
 
203 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.324195  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  33.5 
 
 
591 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2076  phosphatase PhoE  30.95 
 
 
205 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 
200 aa  81.6  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3671  phosphoglycerate mutase  34.36 
 
 
207 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.786994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1897  phosphatase PhoE  30.95 
 
 
203 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  32.92 
 
 
200 aa  80.9  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1414  phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10824  6-phosphofructo-2-kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G05100)  22.77 
 
 
559 aa  79  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2145  phosphatase PhoE  30.77 
 
 
203 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2113  phosphatase PhoE  30.77 
 
 
203 aa  79  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0276195  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  26.51 
 
 
209 aa  78.6  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  33.9 
 
 
223 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  34.59 
 
 
214 aa  78.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  32.3 
 
 
200 aa  77.8  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  32.3 
 
 
200 aa  77.8  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1849  phosphatase PhoE  30.18 
 
 
203 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2034  phosphatase PhoE  30.36 
 
 
203 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  33.74 
 
 
235 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1697  alpha-ribazole phosphatase  31.21 
 
 
196 aa  77.4  0.0000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3275  phosphatase PhoE  30.36 
 
 
203 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  32.28 
 
 
221 aa  75.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  32.52 
 
 
201 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2790  Phosphoglycerate mutase  29.7 
 
 
215 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3311  Phosphoglycerate mutase  29.7 
 
 
215 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.16526  normal  0.76051 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 
214 aa  74.7  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  31.06 
 
 
214 aa  73.9  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119918  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  27.42 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  27.42 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  27.42 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  27.42 
 
 
203 aa  73.6  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  27.42 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  31.96 
 
 
198 aa  73.2  0.000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  35.42 
 
 
220 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 
210 aa  72.4  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  31.06 
 
 
214 aa  72.4  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000000442989  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  26.88 
 
 
203 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  31.71 
 
 
209 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  27.42 
 
 
203 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  30.06 
 
 
214 aa  71.6  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66347  6-phosphofructo-2-kinase  26.29 
 
 
374 aa  72  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.283395  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  33.95 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1894  phosphatase PhoE  28.57 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00837019  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  23.6 
 
 
442 aa  70.9  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2989  Phosphoglycerate mutase  28.16 
 
 
217 aa  70.5  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.30555e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0356  Phosphoglycerate mutase  28.74 
 
 
205 aa  70.1  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3403  aminotransferase class I and II  33.85 
 
 
188 aa  69.7  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0624643  normal  0.192224 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.79 
 
 
442 aa  69.7  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  25.81 
 
 
203 aa  68.9  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1513  phosphoribosyltransferase, putative/phosphoglycerate mutase family protein  29.27 
 
 
438 aa  69.3  0.0000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000537342 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  29.75 
 
 
213 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2273  Phosphoglycerate mutase  30.94 
 
 
208 aa  69.3  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  31.87 
 
 
217 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  31.68 
 
 
213 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0420  phosphoglycerate mutase  33.76 
 
 
224 aa  68.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104537 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  31.15 
 
 
253 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  38.84 
 
 
440 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  33.7 
 
 
197 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  29.35 
 
 
209 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.47 
 
 
442 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  31.48 
 
 
198 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  29.31 
 
 
445 aa  67.4  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  36.16 
 
 
198 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  32.73 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.41 
 
 
442 aa  67.4  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  31.48 
 
 
198 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  39.53 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  24.62 
 
 
442 aa  67.4  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  33.82 
 
 
208 aa  67  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  26.38 
 
 
442 aa  66.6  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  31.29 
 
 
202 aa  66.6  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09371  putative phosphoglycerate mutase family protein  28.22 
 
 
196 aa  66.6  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.161361 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0290  phosphoglycerate mutase  33.81 
 
 
220 aa  66.2  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.438239  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  28.88 
 
 
193 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1484  phosphoglycerate mutase  34.16 
 
 
230 aa  65.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0686  alpha-ribazole phosphatase  31.29 
 
 
213 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000115234  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0746  alpha-ribazole phosphatase  31.29 
 
 
202 aa  65.5  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000196602  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  35.53 
 
 
213 aa  65.1  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>