More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0876 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0876  recombinase A  100 
 
 		 357 aa  724    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395015 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1905  recombinase A  90.03 
 
 		 357 aa  627  1e-179  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.954739 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2373  recombinase A  84.87 
 
 		 351 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00420891  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0291  recombinase A  81.71 
 
 		 359 aa  579  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000893894  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0310  recombinase A  77.15 
 
 		 355 aa  556  1e-157  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3180  recombinase A  76.42 
 
 		 353 aa  535  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5903  recA protein  66.87 
 
 		 379 aa  454  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  66.36 
 
 		 336 aa  451  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  65.64 
 
 		 341 aa  449  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1616  recA protein  62.43 
 
 		 348 aa  444  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.445296  normal  0.968936 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  64.86 
 
 		 355 aa  443  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  65.94 
 
 		 348 aa  443  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  65.94 
 
 		 348 aa  443  1e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  64.62 
 
 		 390 aa  443  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  64 
 
 		 357 aa  440  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0456  recA protein  64.07 
 
 		 358 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  63.58 
 
 		 363 aa  439  9.999999999999999e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  63.31 
 
 		 350 aa  439  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  63.86 
 
 		 362 aa  438  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0881  recombinase A  66.67 
 
 		 343 aa  435  1e-121  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.115374  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0988  recombinase A  66.67 
 
 		 343 aa  435  1e-121  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  63.06 
 
 		 343 aa  437  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  61.98 
 
 		 347 aa  435  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  61.67 
 
 		 362 aa  437  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  63.96 
 
 		 342 aa  435  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  64.53 
 
 		 365 aa  437  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  61.99 
 
 		 343 aa  436  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  61.81 
 
 		 366 aa  435  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  62.06 
 
 		 364 aa  434  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  63.01 
 
 		 347 aa  435  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  63.25 
 
 		 362 aa  436  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  62.18 
 
 		 365 aa  437  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  62.65 
 
 		 361 aa  435  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  63.28 
 
 		 362 aa  435  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2528  recA protein  64.91 
 
 		 343 aa  435  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  65.2 
 
 		 338 aa  433  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0440  recombinase A  64.05 
 
 		 358 aa  433  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  60.3 
 
 		 341 aa  432  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  60.29 
 
 		 418 aa  433  1e-120  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1747  recombinase A  61.54 
 
 		 351 aa  432  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000101073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3964  RecA protein  62.54 
 
 		 358 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.122144  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  62.95 
 
 		 363 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  61.76 
 
 		 363 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  61.96 
 
 		 362 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1230  recombinase A  62.43 
 
 		 357 aa  432  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.460816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  61.36 
 
 		 360 aa  434  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2041  recombinase A  63.39 
 
 		 356 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.461458  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  60.93 
 
 		 360 aa  432  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  65.2 
 
 		 338 aa  434  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  63.64 
 
 		 357 aa  431  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2652  recombinase A  63.39 
 
 		 356 aa  431  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  61.18 
 
 		 363 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  61.68 
 
 		 350 aa  432  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  62.91 
 
 		 350 aa  429  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  62.69 
 
 		 383 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  62.46 
 
 		 378 aa  430  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4075  recA protein  61.36 
 
 		 358 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0386592  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0616  recombinase A  64.04 
 
 		 364 aa  429  1e-119  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0814  recombinase A  63.39 
 
 		 356 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  61.66 
 
 		 379 aa  428  1e-119  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0272  recombinase A  63.39 
 
 		 356 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1050  recA protein  66.56 
 
 		 345 aa  431  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0444945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  63.58 
 
 		 347 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0971  recombinase A  63.39 
 
 		 356 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0017  recombinase A  63.39 
 
 		 356 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0643  recombinase A  63.1 
 
 		 356 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.940587  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  63.72 
 
 		 345 aa  429  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  63.32 
 
 		 356 aa  428  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  64.38 
 
 		 357 aa  428  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2236  recA protein  62.73 
 
 		 347 aa  429  1e-119  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0810  recombinase A  63.39 
 
 		 356 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1267  recA protein  62.77 
 
 		 358 aa  430  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165392  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  63.58 
 
 		 347 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2681  recombinase A  63.1 
 
 		 356 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  62.28 
 
 		 347 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0932  recA protein  66.56 
 
 		 345 aa  431  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  62.21 
 
 		 364 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  63.5 
 
 		 359 aa  430  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  63.47 
 
 		 345 aa  428  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2404  recombinase A  63.39 
 
 		 356 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  62.83 
 
 		 347 aa  430  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2672  recombinase A  63.39 
 
 		 356 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.996925  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  60.79 
 
 		 355 aa  430  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  60.23 
 
 		 361 aa  429  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  63.58 
 
 		 347 aa  429  1e-119  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  62.91 
 
 		 350 aa  431  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4108  recA protein  61.36 
 
 		 358 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.633837  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  64 
 
 		 350 aa  430  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0711  recombinase A  64.44 
 
 		 345 aa  424  1e-118  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0198  recombinase A  66.97 
 
 		 339 aa  425  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0327556 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  63.08 
 
 		 359 aa  426  1e-118  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  63.16 
 
 		 358 aa  427  1e-118  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3015  recombinase A  61.35 
 
 		 347 aa  426  1e-118  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.514179  hitchhiker  0.000000000000973321 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  65.71 
 
 		 358 aa  427  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  63.08 
 
 		 352 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2573  recombinase A  64.89 
 
 		 359 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.803783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  63.11 
 
 		 345 aa  424  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2699  recombinase A  64.89 
 
 		 359 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  63.3 
 
 		 345 aa  424  1e-118  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3179  recombinase A  66.87 
 
 		 340 aa  426  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>