139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0299 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0299  glycosyl transferase family 9  100 
 
 		 463 aa  924    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.155014 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1615  glycosyl transferase family protein  60.76 
 
 		 411 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.395155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2022  heptosyltransferase family protein  50.99 
 
 		 432 aa  430  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.259554  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0962  heptosyltransferase family protein  45.06 
 
 		 429 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.858852  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1747  glycosyl transferase family 9  44.24 
 
 		 420 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0690  glycosyl transferase family 9  36.82 
 
 		 511 aa  92.8  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.379313  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0312  glycosyl transferase family 9  37.41 
 
 		 574 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2523  glycosyl transferase family protein  45.92 
 
 		 549 aa  75.1  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0027494  normal  0.0392835 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3025  heptosyltransferase family protein  27.67 
 
 		 517 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1547  glycosyl transferase family 9  46.99 
 
 		 585 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.796165 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1411  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.01 
 
 		 299 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0320  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.61 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1258  glycosyl transferase family 9  31.88 
 
 		 471 aa  63.9  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0149  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.09 
 
 		 341 aa  63.2  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1714  heptosyltransferase family protein  33.11 
 
 		 473 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1571  glycosyl transferase family 9  35.56 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0153093 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1796  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.06 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0153252 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0508  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  34.43 
 
 		 317 aa  58.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.104736  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1633  glycosyl transferase family protein  30.56 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0100  glycosyl transferase family 9  30.71 
 
 		 462 aa  58.9  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0375  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  31.54 
 
 		 362 aa  57  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.66681 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3215  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 		 347 aa  57  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2792  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.97 
 
 		 362 aa  56.6  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0445733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0479  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1226  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  25.21 
 
 		 304 aa  55.8  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.56987e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0565  heptosyltransferase family protein  36.36 
 
 		 543 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.432833  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1805  glycosyl transferase family 9  27.41 
 
 		 308 aa  55.8  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1237  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.21 
 
 		 314 aa  55.5  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2642  family 9 glycosyl transferase  33.77 
 
 		 343 aa  55.1  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0205  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  33.33 
 
 		 331 aa  55.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0684  putative ADP-heptose--LPS heptosyltransferaseii  27.03 
 
 		 341 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1263  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  28.17 
 
 		 343 aa  53.9  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4336  glycosyl transferase family protein  30.71 
 
 		 347 aa  53.9  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0454  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.03 
 
 		 341 aa  53.9  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.788826  normal  0.709845 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0772  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  31.93 
 
 		 359 aa  53.9  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0715  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 		 344 aa  53.5  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0294212  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18890  Three-deoxy-D-manno-octulosonic-acid transferase domain protein  33.94 
 
 		 779 aa  53.5  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000185158  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3282  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.35 
 
 		 341 aa  53.9  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0357  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  32.09 
 
 		 324 aa  53.5  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0363758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3770  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  35.42 
 
 		 351 aa  53.5  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.242011  normal  0.536434 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0009  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  37.65 
 
 		 349 aa  53.1  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2100  glycosyl transferase family protein  34.65 
 
 		 361 aa  53.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II- LPS biosynthesis, waaF  29.5 
 
 		 349 aa  53.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.57864  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3897  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 		 347 aa  52.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0249  glycosyl transferase family 9  36.78 
 
 		 521 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0328352 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0062  glycosyl transferase family protein  29.79 
 
 		 354 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.982764  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0552  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.1 
 
 		 516 aa  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0106  glycosyl transferase family 9  24.24 
 
 		 332 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00331411  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4735  glycosyl transferase family protein  33.65 
 
 		 404 aa  51.6  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.96684 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1955  glycosyl transferase family 9  31.31 
 
 		 354 aa  51.6  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0112  heptosyltransferase  25.97 
 
 		 335 aa  51.2  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0828  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.35 
 
 		 346 aa  50.8  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4281  glycosyl transferase family 9  29.79 
 
 		 347 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000734262 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0860  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  37.78 
 
 		 339 aa  50.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0585  glycosyl transferase family protein  28.46 
 
 		 406 aa  50.1  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0582  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  23.41 
 
 		 325 aa  49.7  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000000000638797  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0145  glycosyl transferase family 9  26.92 
 
 		 334 aa  49.3  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0787699  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2256  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II, putative  30.11 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.253661  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0341  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.83 
 
 		 349 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.455159  normal  0.818708 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4678  heptosyl transferase glycosyltransferase family 9 protein  33.91 
 
 		 347 aa  48.9  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0520  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 		 344 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0851  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.39 
 
 		 346 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0147  glycosyl transferase family 9  29.37 
 
 		 361 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1629  heptosyltransferase family protein  33.71 
 
 		 341 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2231  glycosyl transferase family 9  35.23 
 
 		 371 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00858313 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2616  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  24.65 
 
 		 346 aa  48.9  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00680  ADP-heptose-LPS heptosyltransferase II  24.41 
 
 		 352 aa  49.3  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4476  glycosyl transferase family protein  29.08 
 
 		 347 aa  48.9  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.647779 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0369  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  24.83 
 
 		 349 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.489126 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0800  lipopolysaccharide heptosyltransferase I  26.83 
 
 		 353 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3136  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  40.24 
 
 		 344 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0658  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.35 
 
 		 346 aa  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0567  glycosyl transferase family 9  36.36 
 
 		 362 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00062  putative ADP-heptose:LPS heptosyltransferase  28.17 
 
 		 334 aa  47.8  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0990  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.35 
 
 		 346 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.916286  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5964  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.03 
 
 		 329 aa  48.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.262349 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0832  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.35 
 
 		 346 aa  48.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0032  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.35 
 
 		 376 aa  47.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2214  glycosyl transferase family 9  36.08 
 
 		 362 aa  47.8  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001794  ADP-heptose--lipooligosaccharide heptosyltransferase II  23.66 
 
 		 352 aa  48.1  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.578647  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4862  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  26.5 
 
 		 349 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.470567 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0291  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.35 
 
 		 346 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0768  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  28.99 
 
 		 346 aa  47.8  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0059313 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3611  glycosyl transferase family protein  37.11 
 
 		 348 aa  47.4  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0586  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.35 
 
 		 346 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2419  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  26.35 
 
 		 346 aa  47.8  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2662  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.03 
 
 		 329 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.879845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2553  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.03 
 
 		 345 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.760433  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5003  ADP-heptose--LPS heptosyltransferase II  29.46 
 
 		 344 aa  47.4  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2022  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.03 
 
 		 345 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2680  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.03 
 
 		 329 aa  47.4  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.196159  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2633  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.03 
 
 		 345 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609317  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0565  ADP-heptose--lipopolysaccharide heptosyltransferase II protein  36.47 
 
 		 341 aa  47  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.995222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0473  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  36.47 
 
 		 341 aa  47  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.84327 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1989  glycosyl transferase family 9  34.09 
 
 		 357 aa  47  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1964  glycosyl transferase family 9  27.78 
 
 		 354 aa  47  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0172789  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0486  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  36.47 
 
 		 341 aa  47  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.109958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18880  lipopolysaccharide heptosyltransferase III, putative  29.69 
 
 		 348 aa  46.6  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0347069  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0665  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  27.03 
 
 		 345 aa  47  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.927439 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0545  lipopolysaccharide heptosyltransferase II  36.05 
 
 		 340 aa  46.6  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0086605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>