37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1251 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1251  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 294 aa  563  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0738172  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2557  hypothetical protein  98.64 
 
 		 294 aa  555  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.209114  hitchhiker  0.00319477 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2745  hypothetical protein  73.17 
 
 		 291 aa  391  1e-108  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.097  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2007  hypothetical protein  69.23 
 
 		 291 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28787  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2752  protein of unknown function DUF6 transmembrane  68.04 
 
 		 309 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2138  hypothetical protein  71.33 
 
 		 280 aa  373  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00025642  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2430  hypothetical protein  69.23 
 
 		 291 aa  343  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.814942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1917  hypothetical protein  59.66 
 
 		 297 aa  309  2.9999999999999997e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.208195 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1705  hypothetical protein  58.27 
 
 		 305 aa  289  5.0000000000000004e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1060  hypothetical protein  29.76 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2581  hypothetical protein  29.62 
 
 		 295 aa  82  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0869086  normal  0.0298393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2506  hypothetical protein  29.41 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2687  hypothetical protein  30.07 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.42391  normal  0.0677006 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4489  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.8 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.974207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6434  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.3 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00443844 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2425  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.59 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.425846  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.59 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15861  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4912  membrane protein  24.9 
 
 		 298 aa  59.3  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0340  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.88 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.129691  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0809  hypothetical protein  25.12 
 
 		 300 aa  57  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.817612 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1435  hypothetical protein  28.46 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  23.37 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0907  hypothetical protein  25.7 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  25.24 
 
 		 317 aa  53.1  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  34.86 
 
 		 283 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3544  hypothetical protein  30.1 
 
 		 334 aa  50.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.298443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0464  membrane protein  29.95 
 
 		 293 aa  49.7  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1259  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.83 
 
 		 295 aa  48.9  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.33673 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.28 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  43.21 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.27 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1274  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.63 
 
 		 277 aa  47.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.320478  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.7 
 
 		 300 aa  46.6  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.91 
 
 		 293 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.815288  normal  0.766233 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2032  hypothetical protein  21.14 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0029442  normal  0.0470657 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.67 
 
 		 317 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  26.39 
 
 		 308 aa  42.4  0.009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>