135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3841 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_3841  Methyltransferase type 11  100 
 
 
243 aa  501  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  38.83 
 
 
203 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  32.17 
 
 
244 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1439  methyltransferase  27.27 
 
 
212 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00779237  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
242 aa  53.9  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  25.93 
 
 
207 aa  52.8  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1296  hypothetical protein  30.83 
 
 
248 aa  52  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0615608  normal  0.430138 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.35 
 
 
345 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1068  methyltransferase type 11  29.75 
 
 
417 aa  51.6  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  31.93 
 
 
353 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.18 
 
 
254 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  31.93 
 
 
353 aa  51.6  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  31.4 
 
 
220 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  31.4 
 
 
220 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  31.4 
 
 
220 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  31.4 
 
 
220 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  31.4 
 
 
220 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  31.4 
 
 
220 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  31.4 
 
 
220 aa  50.4  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0607  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.81 
 
 
253 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.18812  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1317  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  30.17 
 
 
387 aa  49.3  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.875361  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0474  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.85 
 
 
257 aa  49.3  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1198  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  30.17 
 
 
387 aa  49.3  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0546  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase, putative  30.17 
 
 
387 aa  49.3  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0530  putative methylase  33.03 
 
 
269 aa  49.3  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0515  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.67 
 
 
254 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0440194 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  25.86 
 
 
513 aa  48.9  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  27.27 
 
 
239 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0381  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  21.98 
 
 
261 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.111253  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2735  hypothetical protein  29.13 
 
 
210 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.87 
 
 
262 aa  48.5  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  29.75 
 
 
314 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  26.36 
 
 
241 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0100  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.88 
 
 
253 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0327  putative methyltransferase  24.46 
 
 
253 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.554638  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  29.13 
 
 
300 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.96 
 
 
1291 aa  47.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3819  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25 
 
 
248 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.7 
 
 
205 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  25.45 
 
 
2490 aa  46.6  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9984  predicted protein  32.08 
 
 
249 aa  46.6  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0507609  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00659  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- benzoquinol methylase  28.7 
 
 
250 aa  46.6  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  28.89 
 
 
262 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  29.46 
 
 
1312 aa  46.2  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35268  predicted protein  31.9 
 
 
394 aa  46.2  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0796669  normal  0.0661795 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.77 
 
 
232 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  24.52 
 
 
256 aa  46.2  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  29.44 
 
 
209 aa  46.2  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0079  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.88 
 
 
253 aa  45.8  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0762202 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.85 
 
 
276 aa  45.8  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  27.54 
 
 
278 aa  45.8  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  30.36 
 
 
253 aa  45.8  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  27.41 
 
 
209 aa  45.4  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  26.57 
 
 
257 aa  45.4  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.06 
 
 
232 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1872  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.01 
 
 
248 aa  44.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.466783  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.06 
 
 
230 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4822  Methyltransferase type 11  26.28 
 
 
233 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.06 
 
 
232 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2162  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.09 
 
 
325 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.305045 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  24.14 
 
 
263 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1561  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.88 
 
 
256 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.676344 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1803  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.01 
 
 
248 aa  44.7  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0795517  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.06 
 
 
232 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  24.79 
 
 
261 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  26.52 
 
 
196 aa  44.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4499  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  27.52 
 
 
266 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000152328 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2066  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.04 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.10278  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  24.79 
 
 
261 aa  45.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  24.79 
 
 
261 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.22 
 
 
252 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.204476  normal  0.816598 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  27.87 
 
 
214 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.72 
 
 
264 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2559  methyltransferase type 11  27.66 
 
 
228 aa  43.9  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  25.96 
 
 
297 aa  44.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0855  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 
240 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5517  methyltransferase type 11  29.81 
 
 
228 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.550452  normal  0.719059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3579  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase protein  26.14 
 
 
280 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.0849156 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  27.05 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1948  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  25.49 
 
 
262 aa  44.3  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.767246  normal  0.0132888 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  26.19 
 
 
247 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  28.4 
 
 
203 aa  44.3  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2714  Methyltransferase type 11  23.08 
 
 
274 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4696  methyltransferase type 11  26.09 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.219462 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.06 
 
 
232 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.1 
 
 
239 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0549  hypothetical protein  26.5 
 
 
226 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.06 
 
 
230 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2009  hypothetical protein  24.06 
 
 
255 aa  43.5  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.271087  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  28.43 
 
 
263 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1864  hypothetical protein  25.26 
 
 
221 aa  43.5  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0369  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.1 
 
 
248 aa  43.5  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3858  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  24.5 
 
 
260 aa  43.5  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.21 
 
 
234 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 
212 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0947  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.83 
 
 
252 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2792  hypothetical protein  24.62 
 
 
250 aa  43.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  28.81 
 
 
207 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5548  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 
211 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>