More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2022 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2022  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 227 aa  462  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.203611  normal  0.416027 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0154  two component transcriptional regulator  44.07 
 
 		 238 aa  202  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.644268  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0644  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.21 
 
 		 236 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  44.25 
 
 		 235 aa  192  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  44.25 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  44.25 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  44.25 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  44.25 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  44.25 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  44.25 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  44.25 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  44.25 
 
 		 235 aa  192  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 		 235 aa  191  8e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0588  two component transcriptional regulator  44.64 
 
 		 227 aa  190  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 235 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 235 aa  190  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0444  DNA-binding response regulator  43.48 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 		 223 aa  189  4e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2903  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.65 
 
 		 234 aa  187  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.11 
 
 		 236 aa  187  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2180  DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 223 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0299585  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1891  DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 223 aa  186  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1897  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 227 aa  185  5e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.151466  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3538  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.36 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.95 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2497  DNA-binding response regulator  41.41 
 
 		 228 aa  182  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  40.81 
 
 		 228 aa  181  6e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2811  DNA-binding response regulator  40.87 
 
 		 228 aa  181  7e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0719  DNA-binding response regulator  40.77 
 
 		 236 aa  181  9.000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0951718  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 231 aa  181  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1950  DNA-binding response regulator  41.74 
 
 		 235 aa  180  1e-44  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.100456  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.85 
 
 		 229 aa  180  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2306  two component transcriptional regulator  43.14 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.97 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1351  DNA-binding response regulator  43.44 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.36 
 
 		 240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1191  response regulator  43.44 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1413  DNA-binding response regulator  42.99 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1453  DNA-binding response regulator  42.99 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1193  response regulator  42.99 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3993  DNA-binding response regulator  43.44 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.910988 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0064  DNA-binding response regulator  42.22 
 
 		 235 aa  179  4e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.611294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1389  DNA-binding response regulator  42.99 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.34 
 
 		 230 aa  178  4.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1215  two component transcriptional regulator  42.34 
 
 		 223 aa  178  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533573  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3429  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 233 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0608192  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 224 aa  178  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13280  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.27 
 
 		 227 aa  178  5.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000536961  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1021  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 223 aa  178  7e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0399  two component transcriptional regulator  43.95 
 
 		 272 aa  178  7e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.802217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0997  response regulator receiver  40.09 
 
 		 228 aa  177  9e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.94 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1213  DNA-binding response regulator  42.53 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.203275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1312  DNA-binding response regulator  42.53 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0916  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.39 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0276045  hitchhiker  9.727110000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 224 aa  177  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3739  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.05 
 
 		 230 aa  177  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000466515  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1549  two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 241 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1580  response regulator receiver  41.3 
 
 		 241 aa  177  2e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0105  DNA-binding response regulator  41.99 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1116  DNA-binding response regulator  40.52 
 
 		 235 aa  176  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.310768  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0018  two component transcriptional regulator  40.69 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.70243  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0018  response regulator receiver  40.69 
 
 		 233 aa  176  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1200  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 		 238 aa  176  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.08 
 
 		 231 aa  175  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 231 aa  175  6e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2534  DNA-binding response regulator YycF  40.35 
 
 		 233 aa  174  8e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.14 
 
 		 233 aa  174  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0435  transcriptional regulator PhoB  40.89 
 
 		 229 aa  174  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  41.55 
 
 		 236 aa  174  8e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3286  phosphate regulon transcriptional regulatory protein  40 
 
 		 230 aa  174  9e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0413143 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1055  DNA-binding response regulator SrrA  41.3 
 
 		 241 aa  174  9e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2990  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 230 aa  174  9e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1053  two component transcriptional regulator  40.97 
 
 		 229 aa  174  9e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1215  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.54 
 
 		 237 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3136  phosphate regulon transcriptional regulatory protein PhoB  40 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3276  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1008  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  40 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0402  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.56 
 
 		 241 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3302  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  40 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1041  two component transcriptional regulator  39.56 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.194422 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  42.34 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3106  two component transcriptional regulator PhoB, winged helix family  39.56 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  40.27 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  38.64 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0867  transcriptional regulator PhoB  42.04 
 
 		 229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.437737  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1208  phosphate regulon response regulator PhoB  40.95 
 
 		 233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1986  two component transcriptional regulator  36.68 
 
 		 240 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.29 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1658  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.21 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.515101  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0483  two component transcriptional regulator  42.22 
 
 		 229 aa  173  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.2 
 
 		 237 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>