More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1991 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1544  helicase c2  57.65 
 
 		 635 aa  783    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0592026  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1991  helicase c2  100 
 
 		 657 aa  1351    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0246396  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2382  helicase c2  37.9 
 
 		 653 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1902  helicase c2  36.49 
 
 		 646 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1486  helicase c2  36.18 
 
 		 645 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.530371  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1442  ATP-dependent helicase DinG  36.31 
 
 		 645 aa  403  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1656  hypothetical protein  36.31 
 
 		 645 aa  403  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.10694 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3725  hypothetical protein  36.31 
 
 		 645 aa  403  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0167806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1300  helicase c2  35.39 
 
 		 645 aa  402  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1692  hypothetical protein  36.15 
 
 		 645 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1470  hypothetical protein  36.15 
 
 		 645 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.36032  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1443  ATP-dependent helicase DinG  36.31 
 
 		 645 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1586  hypothetical protein  36.15 
 
 		 645 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1619  hypothetical protein  36.15 
 
 		 645 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68003  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1731  hypothetical protein  36.15 
 
 		 645 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000833443  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  30.9 
 
 		 729 aa  252  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1412  helicase c2  30.21 
 
 		 658 aa  243  6e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.102914  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  30.29 
 
 		 653 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07920  helicase c2  28 
 
 		 822 aa  230  5e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1921  helicase c2  31.48 
 
 		 725 aa  230  6e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.782434  normal  0.028244 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1106  helicase c2  29.74 
 
 		 636 aa  229  1e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.243566 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1886  hypothetical protein  29.86 
 
 		 652 aa  227  5.0000000000000005e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1593  helicase c2  30.78 
 
 		 725 aa  226  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601772  normal  0.0255754 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1897  hypothetical protein  30.02 
 
 		 652 aa  225  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1626  ATP-dependent DNA helicase-related protein  30.38 
 
 		 713 aa  221  3e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1269  helicase c2  30.38 
 
 		 636 aa  219  1e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1342  helicase c2  29.4 
 
 		 754 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1235  helicase c2  29.09 
 
 		 743 aa  218  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895293  normal  0.149585 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  28.63 
 
 		 843 aa  217  5e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000977416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3854  helicase c2  28.78 
 
 		 830 aa  217  5.9999999999999996e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000920192 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  29.28 
 
 		 659 aa  217  7e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3621  helicase c2  29.63 
 
 		 838 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  28.37 
 
 		 643 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0411  helicase c2  29.01 
 
 		 646 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3770  helicase c2  29.23 
 
 		 830 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17400  DNA helicase, Rad3  28.51 
 
 		 765 aa  211  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0589917  normal  0.041503 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  28.68 
 
 		 640 aa  209  1e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  29.3 
 
 		 660 aa  209  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2677  helicase c2  28.99 
 
 		 646 aa  207  7e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1779  helicase c2:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  27.7 
 
 		 641 aa  206  8e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  28.57 
 
 		 876 aa  205  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4323  helicase c2  28.36 
 
 		 631 aa  204  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1899  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.1 
 
 		 956 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589249 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01597  ATP-dependent helicase  29.63 
 
 		 675 aa  202  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.1 
 
 		 927 aa  202  9.999999999999999e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0820  helicase c2  29.4 
 
 		 650 aa  202  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  28.41 
 
 		 633 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1403  helicase c2  29.42 
 
 		 757 aa  201  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127709  hitchhiker  0.000000348035 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  26.98 
 
 		 647 aa  200  5e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2524  helicase c2  28.81 
 
 		 755 aa  200  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00188741  decreased coverage  0.000000000263353 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  28.1 
 
 		 668 aa  200  7.999999999999999e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4459  helicase c2  28.41 
 
 		 633 aa  200  7.999999999999999e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157065  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  28.9 
 
 		 646 aa  200  7.999999999999999e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  26.32 
 
 		 832 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.86 
 
 		 960 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1612  putative ATP-dependent helicase  28.52 
 
 		 751 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100383  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  28.3 
 
 		 661 aa  198  2.0000000000000003e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  28.76 
 
 		 650 aa  198  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2013  helicase c2  29.68 
 
 		 639 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.479282  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  25.9 
 
 		 709 aa  196  9e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0363  ATP-dependent helicase DinG  28.88 
 
 		 840 aa  196  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.01237  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  27.24 
 
 		 640 aa  196  1e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0562  DNA polymerase III, epsilon subunit  30.19 
 
 		 921 aa  196  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2251  ATP-dependent helicase, putative  28.7 
 
 		 755 aa  195  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.247338  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2877  helicase c2  27.85 
 
 		 658 aa  195  3e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.679539 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.79 
 
 		 929 aa  194  3e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1504  helicase c2  26.64 
 
 		 672 aa  194  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.328202  normal  0.416282 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.17 
 
 		 934 aa  194  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0509  helicase c2  27.57 
 
 		 843 aa  193  7e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  27.66 
 
 		 646 aa  193  8e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4468  helicase c2  28.1 
 
 		 635 aa  193  9e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.261313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.17 
 
 		 934 aa  192  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1901  helicase c2  29.1 
 
 		 675 aa  192  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1967  ATP-dependent helicase  29.1 
 
 		 675 aa  192  1e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  27.5 
 
 		 644 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3093  helicase c2  28.69 
 
 		 681 aa  191  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.649657 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.14 
 
 		 934 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.14 
 
 		 934 aa  190  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.29 
 
 		 934 aa  190  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.29 
 
 		 934 aa  190  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0023  Rad3-related DNA helicases  25.83 
 
 		 851 aa  190  8e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000466591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  27.27 
 
 		 929 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1727  helicase c2  27.82 
 
 		 641 aa  189  1e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  27.99 
 
 		 636 aa  188  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  27.3 
 
 		 636 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3841  helicase c2  27.45 
 
 		 665 aa  189  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478709  normal  0.0359375 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.91 
 
 		 934 aa  189  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  27.3 
 
 		 636 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  27.3 
 
 		 636 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3855  helicase c2  27.45 
 
 		 665 aa  189  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210682  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  27.39 
 
 		 707 aa  189  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3929  helicase c2  27.45 
 
 		 665 aa  189  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0336304  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3345  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.56 
 
 		 694 aa  188  2e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.127637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2005  putative ATP-dependent DNA helicase-related protein  28.86 
 
 		 666 aa  188  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.349435 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2207  putative ATP-dependent helicase  28.88 
 
 		 749 aa  188  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  27.3 
 
 		 636 aa  188  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  27.03 
 
 		 636 aa  187  4e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  27.62 
 
 		 641 aa  187  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  27.62 
 
 		 641 aa  187  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  27.84 
 
 		 636 aa  186  8e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>