More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3419 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3419  amidase  100 
 
 		 441 aa  887    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3870  2-alkenal reductase  53.69 
 
 		 454 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.80719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3015  amidase  53.09 
 
 		 452 aa  364  1e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3369  Asp-tRNA Asn/Glu-tRNA Gln amidotransferase subunit A  53.09 
 
 		 452 aa  364  2e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0343  amidase  48.08 
 
 		 450 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.605191  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2453  amidase  42.56 
 
 		 467 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.205936  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1032  amidase  38.94 
 
 		 436 aa  250  4e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.516301  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3331  amidase  41.01 
 
 		 428 aa  247  3e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0916  amidase  41.55 
 
 		 413 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2779  Amidase  44.78 
 
 		 425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1179  amidase  36.85 
 
 		 433 aa  241  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0877  Amidase  41.1 
 
 		 411 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.192565 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11219  amidase family protein (AFU_orthologue; AFUA_6G14410)  41.32 
 
 		 442 aa  237  3e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.016892  normal  0.194738 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0852  Amidase  41.16 
 
 		 434 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.766519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0309  putative amidase (amiD)  43.67 
 
 		 448 aa  233  6e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.613123  normal  0.504798 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2263  amidase  41.61 
 
 		 410 aa  230  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.241532  normal  0.548827 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4589  Amidase  44.72 
 
 		 414 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.608166  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6302  amidase  39.33 
 
 		 457 aa  226  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.393449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7127  hypothetical protein  36.93 
 
 		 436 aa  223  7e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4799  amidase  42.56 
 
 		 414 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.637603  hitchhiker  0.00105547 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3290  amidase  39.76 
 
 		 431 aa  217  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.715129 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1832  amidase  34.54 
 
 		 429 aa  206  9e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119712  normal  0.725364 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1323  amidase  39.86 
 
 		 421 aa  205  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3603  malonamidase E2  41.88 
 
 		 433 aa  196  6e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.226472 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13411  amidase amiD (acylamidase)  32.47 
 
 		 475 aa  193  6e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1306  putative amidase  36.68 
 
 		 438 aa  188  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.902626 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2499  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.99 
 
 		 491 aa  178  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5904  amidase  37.53 
 
 		 427 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424342  normal  0.115898 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1360  amidase  31.9 
 
 		 466 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000267228  hitchhiker  0.0000102639 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0184  amidase  35.57 
 
 		 480 aa  173  5.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0559  Amidase  34.94 
 
 		 461 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2860  amidase  31.33 
 
 		 477 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1335  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.25 
 
 		 486 aa  167  4e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1117  Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit and amidase  29.05 
 
 		 486 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0417  Amidase  30.66 
 
 		 481 aa  166  6.9999999999999995e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1350  amidase  29.04 
 
 		 446 aa  166  6.9999999999999995e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.149618  normal  0.0776826 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1839  Amidase  36.38 
 
 		 436 aa  166  9e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0721  glutamyl-tRNA, putative  31.15 
 
 		 534 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0765  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.41 
 
 		 485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00375757  normal  0.450194 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1251  amidase  31.05 
 
 		 466 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.406774  normal  0.371454 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0487  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.6 
 
 		 485 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6070  Amidase  33.33 
 
 		 458 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1146  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.05 
 
 		 486 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1628  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  31.43 
 
 		 484 aa  162  9e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.013729  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0230  amidase  36.17 
 
 		 498 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.817663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.83 
 
 		 480 aa  162  1e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0352  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.84 
 
 		 498 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0507  amidase  33.86 
 
 		 481 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.371136 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0464  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  30.84 
 
 		 491 aa  161  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0616  amidase  37.22 
 
 		 547 aa  162  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0346122  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2615  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.33 
 
 		 482 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4296  amidase  34.38 
 
 		 474 aa  160  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.516839  normal  0.581919 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2243  amidase  33.18 
 
 		 463 aa  160  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00714372 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2854  amidase  32.4 
 
 		 596 aa  160  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2535  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.9 
 
 		 482 aa  159  7e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3083  amidase  35.45 
 
 		 463 aa  159  7e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269706 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3674  amidase  32.83 
 
 		 464 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4797  putative amidase  33.69 
 
 		 498 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.199104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0682  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  32.43 
 
 		 485 aa  158  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3501  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.9 
 
 		 482 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2569  amidase family protein  31.32 
 
 		 507 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111289  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3866  Amidase  31.28 
 
 		 480 aa  157  5.0000000000000005e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1458  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.42 
 
 		 488 aa  156  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1254  amidase  31.55 
 
 		 472 aa  156  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4083  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase, A subunit  44.64 
 
 		 512 aa  156  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2117  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.49 
 
 		 479 aa  156  8e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.893835  normal  0.399688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2905  Amidase  32.82 
 
 		 463 aa  156  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2012  amidase  33.18 
 
 		 471 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0494879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5054  amidase  33.33 
 
 		 458 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.903998 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4623  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.3 
 
 		 491 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0887  amidase  32.13 
 
 		 452 aa  155  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.837099 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4802  Amidase  33.57 
 
 		 468 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.271791  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4364  amidase  34.68 
 
 		 471 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000480403  normal  0.468217 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0238  amidase  31.39 
 
 		 475 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3928  amidase  34.44 
 
 		 491 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0519913  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1541  aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A  29.14 
 
 		 486 aa  154  4e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.859243  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1500  glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase A subunit  32.61 
 
 		 476 aa  154  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0473179 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2536  Amidase  31.75 
 
 		 473 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1655  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  29.89 
 
 		 475 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4427  amidase  32.95 
 
 		 470 aa  152  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1157  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.43 
 
 		 491 aa  152  8.999999999999999e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0758245  normal  0.786366 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3821  amidase  32.54 
 
 		 467 aa  152  8.999999999999999e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4393  amidase  31.77 
 
 		 450 aa  152  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.281674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  30.45 
 
 		 485 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3345  Amidase  30.82 
 
 		 526 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0644396 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0798  Amidase  33.82 
 
 		 424 aa  152  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15821  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  33.19 
 
 		 486 aa  152  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4068  Amidase  33.41 
 
 		 491 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0786  amidase  42.02 
 
 		 540 aa  151  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0562402  normal  0.05783 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4036  Amidase  32.96 
 
 		 491 aa  151  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0697  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  45.78 
 
 		 505 aa  150  4e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04870  amidase, Asp-tRNAAsn/Glu-tRNAGln amidotransferase A subunit  31.82 
 
 		 461 aa  150  4e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3846  Amidase  39.3 
 
 		 540 aa  150  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3660  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.25 
 
 		 493 aa  150  5e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0458  Amidase  27.98 
 
 		 549 aa  150  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1430  amidase  31.13 
 
 		 466 aa  150  6e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.904351 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2154  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  32.14 
 
 		 486 aa  149  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0559  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  31.56 
 
 		 493 aa  149  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5415  Amidase  32.97 
 
 		 467 aa  149  8e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0883  aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit A  28.84 
 
 		 475 aa  149  9e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>