More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3248 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3248  flagellar basal body rod protein FlgC  100 
 
 		 130 aa  266  7e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.893989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2964  flagellar basal body rod protein FlgC  61.54 
 
 		 130 aa  165  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.796607  normal  0.243642 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2991  flagellar basal body rod protein FlgC  60.77 
 
 		 126 aa  148  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1330  flagellar basal body rod protein FlgC  60 
 
 		 128 aa  148  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4197  flagellar basal body rod protein FlgC  57.25 
 
 		 130 aa  140  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2601  flagellar basal body rod protein FlgC  59.23 
 
 		 126 aa  140  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.773402  hitchhiker  0.000553357 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2111  flagellar basal body rod protein FlgC  49.23 
 
 		 130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2825  flagellar basal body rod protein FlgC  44.12 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0350  flagellar basal body rod protein FlgC  43.38 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.121375 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1937  flagellar basal body rod protein FlgC  42.34 
 
 		 137 aa  106  9.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.123234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3438  flagellar basal body rod protein FlgC  41.04 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0737  flagellar basal body rod protein FlgC  43.61 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2571  flagellar basal body rod protein FlgC  41.48 
 
 		 139 aa  103  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0318  flagellar basal body rod protein FlgC  42.65 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.783853  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3655  flagellar basal body rod protein FlgC  40.88 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.633505  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3776  flagellar basal body rod protein FlgC  42.96 
 
 		 141 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0600625  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0152  flagellar basal body rod protein FlgC  42.86 
 
 		 140 aa  99.4  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0136  flagellar basal body rod protein FlgC  42.11 
 
 		 140 aa  97.8  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.06608  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0256  flagellar basal body rod protein FlgC  41.18 
 
 		 139 aa  97.4  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2637  flagellar basal body rod protein FlgC  42.54 
 
 		 136 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.296466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1691  flagellar basal body rod protein FlgC  39.1 
 
 		 138 aa  97.1  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.132509  normal  0.0178 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1393  flagellar basal body rod protein FlgC  40.74 
 
 		 141 aa  96.7  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0993913  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4211  flagellar basal body rod protein FlgC  40.6 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4410  flagellar basal body rod protein FlgC  41.04 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.541352  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5496  flagellar basal body rod protein FlgC  40.3 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1694  flagellar basal body rod protein FlgC  40 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2133  flagellar basal body rod protein FlgC  41.09 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1133  flagellar basal body rod protein FlgC  39.26 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.886301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1095  flagellar basal body rod protein FlgC  38.35 
 
 		 139 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1518  flagellar basal body rod protein FlgC  41.04 
 
 		 141 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0198818  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0597  flagellar basal body rod protein FlgC  39.1 
 
 		 138 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2830  flagellar basal body rod protein FlgC  39.55 
 
 		 136 aa  92  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.172073  normal  0.232346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2607  flagellar basal body rod protein FlgC  39.55 
 
 		 136 aa  92  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122012  normal  0.267532 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1143  flagellar basal body rod protein FlgC  36.09 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2234  flagellar basal body rod protein FlgC  39.55 
 
 		 135 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1695  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.06 
 
 		 147 aa  90.9  6e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0947147  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5537  flagellar basal body rod protein FlgC  38.81 
 
 		 136 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132652  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0025  flagellar basal body rod protein FlgC  39.85 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5154  flagellar basal body rod protein FlgC  38.81 
 
 		 136 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205426  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0632  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.88 
 
 		 134 aa  88.6  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1389  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.11 
 
 		 146 aa  89  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.88372 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1125  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.43 
 
 		 137 aa  87.8  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16910  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.51 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3674  flagellar basal body rod protein FlgC  36.09 
 
 		 138 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523112 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2719  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.49 
 
 		 150 aa  85.5  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.78537  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0364  flagellar basal body rod protein FlgC  33.54 
 
 		 164 aa  85.1  3e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0036  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.69 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2053  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.78 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0267  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.96 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1109  flagellar basal body rod protein FlgC  35.81 
 
 		 150 aa  83.6  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151882  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1367  flagellar basal body rod protein FlgC  33.33 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1685  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.23 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149162  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0297  flagellar basal body rod protein FlgC  36.76 
 
 		 139 aa  83.2  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24010  flagellar basal-body rod protein  38.71 
 
 		 135 aa  82.4  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1715  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.21 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000651347  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1194  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.71 
 
 		 143 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1322  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.5 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0568  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.92 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1464  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.92 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3306  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.5 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1418  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.92 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0619  flagellar basal body rod protein FlgC  39.1 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.017127  normal  0.0984024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0630  flagellar basal body rod protein FlgC  39.1 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.652584  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3924  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.33 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0670476 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3424  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.5 
 
 		 145 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4421  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.1 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0769  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.1 
 
 		 145 aa  78.6  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197549 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2175  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.79 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.869204  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0170  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.11 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1304  flagellar basal body rod protein FlgC  36.03 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1473  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.6 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2733  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.85 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108424 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0705  flagellar basal body rod protein FlgC  32.5 
 
 		 164 aa  77  0.00000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0426  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.23 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.651344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0057  flagellar basal body rod protein FlgC  32.08 
 
 		 166 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.223353  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3019  flagellar basal body rod protein FlgC  34.53 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3713  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.88 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.889388  normal  0.277072 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4790  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.88 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0463  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.1 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1575  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.94 
 
 		 145 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6370  flagellar basal body rod protein FlgC  34.53 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0241  flagellar basal body rod protein FlgC  34.53 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1387  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.86 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2001  flagellar basal body rod protein FlgC  35.14 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3326  flagellar basal body rod protein FlgC  34.53 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0463  flagellar basal body rod protein FlgC  34.53 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2597  flagellar basal body rod protein FlgC  36.59 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1554  flagellar basal body rod protein FlgC  36.92 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2046  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.09 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3353  flagellar basal body rod protein FlgC  34.53 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0279  flagellar basal body rod protein FlgC  34.53 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  35.38 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0267  flagellar basal body rod protein FlgC  34.53 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191189  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2995  flagellar basal body rod protein FlgC  34.53 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2098  flagellar basal body rod protein FlgC  34.53 
 
 		 141 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0408  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.48 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0343  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.64 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.962617 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2410  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.36 
 
 		 145 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3828  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.68 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.368958 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3072  flagellar basal body rod protein  34.33 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.103316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>