More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_1418 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1464  flagellar basal-body rod protein FlgC  100 
 
 
140 aa  285  2e-76  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1418  flagellar basal-body rod protein FlgC  100 
 
 
140 aa  285  2e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1125  flagellar basal-body rod protein FlgC  72.46 
 
 
137 aa  214  5e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1715  flagellar basal-body rod protein FlgC  72.66 
 
 
138 aa  210  5.999999999999999e-54  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000651347  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1685  flagellar basal-body rod protein FlgC  58.52 
 
 
140 aa  173  8e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149162  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0463  flagellar basal-body rod protein FlgC  53.74 
 
 
147 aa  164  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16910  flagellar basal-body rod protein FlgC  56.25 
 
 
145 aa  160  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0769  flagellar basal-body rod protein FlgC  55.17 
 
 
145 aa  160  6e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197549 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1695  flagellar basal-body rod protein FlgC  55.1 
 
 
147 aa  160  7e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0947147  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2175  flagellar basal-body rod protein FlgC  52.74 
 
 
145 aa  156  9e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.869204  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1389  flagellar basal-body rod protein FlgC  51.03 
 
 
146 aa  154  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.88372 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1767  flagellar basal-body rod protein FlgC  55.4 
 
 
139 aa  153  8e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.236631  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1109  flagellar basal body rod protein FlgC  49.33 
 
 
150 aa  149  8.999999999999999e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151882  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2719  flagellar basal-body rod protein FlgC  53.33 
 
 
150 aa  149  1e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.78537  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2046  flagellar basal-body rod protein FlgC  52.17 
 
 
137 aa  144  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2053  flagellar basal-body rod protein FlgC  49.66 
 
 
147 aa  143  8.000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2001  flagellar basal body rod protein FlgC  47.68 
 
 
150 aa  142  1e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1644  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.89 
 
 
136 aa  139  9e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000317866  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1339  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.2 
 
 
139 aa  138  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00198862  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2410  flagellar basal-body rod protein FlgC  50 
 
 
145 aa  136  8.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0299  flagellar basal body rod protein FlgC  46.5 
 
 
152 aa  135  1e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4152  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.59 
 
 
176 aa  135  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0408  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.61 
 
 
146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0686  flagellar basal-body rod protein FlgC  49.29 
 
 
140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3114  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.31 
 
 
147 aa  130  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0267  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.41 
 
 
141 aa  130  6.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0654  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.53 
 
 
142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.294463  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1955  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.48 
 
 
135 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3840  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.97 
 
 
145 aa  128  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4215  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.9 
 
 
146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3424  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.21 
 
 
145 aa  127  6e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3099  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.73 
 
 
140 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329796  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2666  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.32 
 
 
145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3027  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.88 
 
 
145 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3924  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.3 
 
 
145 aa  124  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0670476 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1194  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.38 
 
 
143 aa  124  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0355  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.76 
 
 
146 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2557  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.57 
 
 
140 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0110618  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1396  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.57 
 
 
140 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00396064  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2461  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.57 
 
 
140 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0105073  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0036  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.3 
 
 
149 aa  122  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584577  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0364  flagellar basal body rod protein FlgC  45.68 
 
 
164 aa  122  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1387  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.76 
 
 
144 aa  122  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1554  flagellar basal body rod protein FlgC  46.38 
 
 
134 aa  120  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2285  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.45 
 
 
145 aa  120  7e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0750  flagellar basal-body rod protein FlgC  45 
 
 
137 aa  120  7e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24010  flagellar basal-body rod protein  42.45 
 
 
135 aa  119  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  46.38 
 
 
134 aa  119  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2597  flagellar basal body rod protein FlgC  46.38 
 
 
134 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3306  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.14 
 
 
145 aa  118  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1357  flagellar basal body rod protein FlgC  42.96 
 
 
137 aa  118  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0847  flagellar basal body rod protein  43.33 
 
 
155 aa  118  3e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0705  flagellar basal body rod protein FlgC  40.85 
 
 
164 aa  118  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2934  flagellar basal body rod protein FlgC  42.55 
 
 
141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.725751 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0241  flagellar basal body rod protein FlgC  42.55 
 
 
141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2969  flagellar basal body rod protein FlgC  43.88 
 
 
134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134298  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0057  flagellar basal body rod protein FlgC  40.24 
 
 
166 aa  117  3.9999999999999996e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.223353  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3069  flagellar basal body rod protein FlgC  42.55 
 
 
141 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3326  flagellar basal body rod protein FlgC  41.67 
 
 
141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0463  flagellar basal body rod protein FlgC  41.67 
 
 
141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2424  flagellar basal body rod protein FlgC  43.48 
 
 
134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27738  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0267  flagellar basal body rod protein FlgC  41.67 
 
 
141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191189  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2098  flagellar basal body rod protein FlgC  41.67 
 
 
141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1999  flagellar basal body rod protein FlgC  43.48 
 
 
134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3353  flagellar basal body rod protein FlgC  41.67 
 
 
141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0279  flagellar basal body rod protein FlgC  41.67 
 
 
141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2323  flagellar basal body rod protein FlgC  43.48 
 
 
134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2995  flagellar basal body rod protein FlgC  41.67 
 
 
141 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1213  flagellar basal body rod protein FlgC  45.39 
 
 
151 aa  117  6e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3735  flagellar basal body rod protein FlgC  42.03 
 
 
135 aa  117  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2410  flagellar basal body rod protein FlgC  42.55 
 
 
141 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642225  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3024  flagellar basal body rod protein FlgC  42.55 
 
 
141 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0826465  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3043  flagellar basal body rod protein FlgC  42.55 
 
 
141 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4198  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.88 
 
 
138 aa  117  6e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1322  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.01 
 
 
139 aa  116  7.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3019  flagellar basal body rod protein FlgC  42.55 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6370  flagellar basal body rod protein FlgC  41.84 
 
 
141 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130671  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1673  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.1 
 
 
163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0692  flagellar basal body rod protein FlgC  40.61 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1636  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.83 
 
 
134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0426  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.6 
 
 
139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.651344  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2949  flagellar basal body rod protein FlgC  41.13 
 
 
141 aa  114  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.741203  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0568  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.3 
 
 
134 aa  113  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50470  flagellar basal body rod protein FlgC  41.1 
 
 
146 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0177426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4299  flagellar basal body rod protein FlgC  41.1 
 
 
146 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1066  flagellar basal body rod protein FlgC  42.07 
 
 
164 aa  113  7.999999999999999e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1465  flagellar basal body rod protein FlgC  40.14 
 
 
147 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2733  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.73 
 
 
136 aa  113  7.999999999999999e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108424 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3951  flagellar basal body rod protein FlgC  40.14 
 
 
147 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2849  flagellar basal body rod protein FlgC  40.82 
 
 
147 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4390  flagellar basal body rod protein FlgC  40.14 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0794673  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1526  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.75 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0631  flagellar basal body rod protein FlgC  41.46 
 
 
164 aa  111  3e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.662451  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1575  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.46 
 
 
145 aa  111  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4250  flagellar basal body rod protein FlgC  39.46 
 
 
147 aa  111  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1162  flagellar basal body rod protein FlgC  39.13 
 
 
138 aa  111  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.509908  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0552  flagellar basal body rod protein FlgC  41.46 
 
 
164 aa  111  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5626  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.3 
 
 
135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3731  flagellar basal body rod protein FlgC  40.14 
 
 
147 aa  110  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321201  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2212  flagellar basal body rod protein FlgC  40.28 
 
 
144 aa  110  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>