More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3840 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_3840  flagellar basal-body rod protein FlgC  100 
 
 
145 aa  297  4e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3924  flagellar basal-body rod protein FlgC  95.86 
 
 
145 aa  284  4e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0670476 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4215  flagellar basal-body rod protein FlgC  70.27 
 
 
146 aa  208  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3114  flagellar basal-body rod protein FlgC  69.86 
 
 
147 aa  206  7e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0408  flagellar basal-body rod protein FlgC  68.97 
 
 
146 aa  205  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3424  flagellar basal-body rod protein FlgC  66.67 
 
 
145 aa  201  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3306  flagellar basal-body rod protein FlgC  64.86 
 
 
145 aa  192  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1695  flagellar basal-body rod protein FlgC  54.11 
 
 
147 aa  163  9e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0947147  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0267  flagellar basal-body rod protein FlgC  52.41 
 
 
141 aa  160  5.0000000000000005e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3027  flagellar basal-body rod protein FlgC  51.7 
 
 
145 aa  158  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1194  flagellar basal-body rod protein FlgC  53.06 
 
 
143 aa  157  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2666  flagellar basal-body rod protein FlgC  53.06 
 
 
145 aa  155  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0355  flagellar basal-body rod protein FlgC  53.1 
 
 
146 aa  154  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0769  flagellar basal-body rod protein FlgC  55.1 
 
 
145 aa  153  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197549 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2285  flagellar basal-body rod protein FlgC  51.7 
 
 
145 aa  152  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1339  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.97 
 
 
139 aa  150  7e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00198862  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16910  flagellar basal-body rod protein FlgC  50.7 
 
 
145 aa  149  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0036  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.68 
 
 
149 aa  149  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584577  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2053  flagellar basal-body rod protein FlgC  49.66 
 
 
147 aa  149  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0463  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.68 
 
 
147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0364  flagellar basal body rod protein FlgC  46.06 
 
 
164 aa  142  2e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2175  flagellar basal-body rod protein FlgC  49.32 
 
 
145 aa  140  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.869204  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1575  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.95 
 
 
145 aa  139  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2719  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.68 
 
 
150 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.78537  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1955  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.85 
 
 
135 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1109  flagellar basal body rod protein FlgC  48.03 
 
 
150 aa  138  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151882  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1654  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.33 
 
 
145 aa  136  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105291  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1685  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.26 
 
 
140 aa  135  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149162  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0705  flagellar basal body rod protein FlgC  40.83 
 
 
164 aa  134  4e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0750  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.45 
 
 
137 aa  134  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0686  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.97 
 
 
140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0654  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.05 
 
 
142 aa  131  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.294463  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1644  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.85 
 
 
136 aa  131  3e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000317866  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2001  flagellar basal body rod protein FlgC  45.95 
 
 
150 aa  130  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1389  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.65 
 
 
146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.88372 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1673  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.72 
 
 
163 aa  130  6.999999999999999e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4152  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.57 
 
 
176 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0847  flagellar basal body rod protein  45.16 
 
 
155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0299  flagellar basal body rod protein FlgC  42.11 
 
 
152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1464  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.97 
 
 
140 aa  128  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1418  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.97 
 
 
140 aa  128  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0552  flagellar basal body rod protein FlgC  40.24 
 
 
164 aa  127  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1403  flagellar basal body rod protein FlgC  39.64 
 
 
164 aa  127  5.0000000000000004e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.144667  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2410  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.99 
 
 
145 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0631  flagellar basal body rod protein FlgC  39.64 
 
 
164 aa  127  6e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.662451  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1715  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.22 
 
 
138 aa  127  6e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000651347  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0057  flagellar basal body rod protein FlgC  41.36 
 
 
166 aa  125  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.223353  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1066  flagellar basal body rod protein FlgC  39.88 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2461  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.07 
 
 
140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0105073  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2557  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.07 
 
 
140 aa  124  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0110618  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1396  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.07 
 
 
140 aa  124  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00396064  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1125  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.97 
 
 
137 aa  124  6e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0692  flagellar basal body rod protein FlgC  39.29 
 
 
167 aa  122  1e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2046  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.45 
 
 
137 aa  122  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1387  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.45 
 
 
144 aa  121  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1322  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.97 
 
 
139 aa  120  7e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2949  flagellar basal body rod protein FlgC  41.26 
 
 
141 aa  120  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.741203  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0426  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.86 
 
 
139 aa  120  9e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.651344  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1767  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.21 
 
 
139 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.236631  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5626  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.96 
 
 
135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3735  flagellar basal body rod protein FlgC  41.96 
 
 
135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0241  flagellar basal body rod protein FlgC  39.86 
 
 
141 aa  117  7e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2969  flagellar basal body rod protein FlgC  43.36 
 
 
134 aa  117  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134298  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1554  flagellar basal body rod protein FlgC  44.06 
 
 
134 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1999  flagellar basal body rod protein FlgC  43.45 
 
 
134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2323  flagellar basal body rod protein FlgC  43.45 
 
 
134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24010  flagellar basal-body rod protein  42.66 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2424  flagellar basal body rod protein FlgC  43.45 
 
 
134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27738  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2013  flagellar basal body rod protein FlgC  45.45 
 
 
134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1243  flagellar basal body rod protein FlgC  45.45 
 
 
134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3072  flagellar basal body rod protein  38.46 
 
 
138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.103316 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1287  flagellar basal body rod protein FlgC  45.45 
 
 
134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158589  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1272  flagellar basal body rod protein FlgC  45.45 
 
 
134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0147313 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2197  flagellar basal body rod protein FlgC  45.45 
 
 
134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000907371 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2923  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.26 
 
 
134 aa  115  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0568  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.16 
 
 
134 aa  115  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0136  flagellar basal body rod protein FlgC  42.25 
 
 
140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.06608  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2597  flagellar basal body rod protein FlgC  44.06 
 
 
134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4211  flagellar basal body rod protein FlgC  41.55 
 
 
140 aa  113  6.9999999999999995e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1977  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.36 
 
 
135 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  43.36 
 
 
134 aa  113  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2934  flagellar basal body rod protein FlgC  39.16 
 
 
141 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.725751 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3069  flagellar basal body rod protein FlgC  39.16 
 
 
141 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0152  flagellar basal body rod protein FlgC  41.55 
 
 
140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3326  flagellar basal body rod protein FlgC  38.46 
 
 
141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0279  flagellar basal body rod protein FlgC  38.46 
 
 
141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0463  flagellar basal body rod protein FlgC  38.46 
 
 
141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6370  flagellar basal body rod protein FlgC  39.16 
 
 
141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130671  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0267  flagellar basal body rod protein FlgC  38.46 
 
 
141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191189  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3353  flagellar basal body rod protein FlgC  38.46 
 
 
141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3043  flagellar basal body rod protein FlgC  39.16 
 
 
141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2410  flagellar basal body rod protein FlgC  39.16 
 
 
141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642225  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3024  flagellar basal body rod protein FlgC  39.16 
 
 
141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0826465  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2995  flagellar basal body rod protein FlgC  38.46 
 
 
141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2098  flagellar basal body rod protein FlgC  38.46 
 
 
141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3713  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.67 
 
 
135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.889388  normal  0.277072 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4790  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.67 
 
 
135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3019  flagellar basal body rod protein FlgC  39.16 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1934  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.07 
 
 
146 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1588  flagellar basal body rod protein FlgC  41.26 
 
 
134 aa  111  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>