259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1575 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1575  flagellar basal-body rod protein FlgC  100 
 
 		 145 aa  296  5e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0355  flagellar basal-body rod protein FlgC  68.28 
 
 		 146 aa  215  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2666  flagellar basal-body rod protein FlgC  70.34 
 
 		 145 aa  215  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2285  flagellar basal-body rod protein FlgC  67.59 
 
 		 145 aa  212  9.999999999999999e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3027  flagellar basal-body rod protein FlgC  64.14 
 
 		 145 aa  193  7e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0463  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.62 
 
 		 147 aa  148  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1194  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.97 
 
 		 143 aa  147  7e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2053  flagellar basal-body rod protein FlgC  51.02 
 
 		 147 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3424  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.97 
 
 		 145 aa  144  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0267  flagellar basal-body rod protein FlgC  50.34 
 
 		 141 aa  143  8.000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0408  flagellar basal-body rod protein FlgC  50 
 
 		 146 aa  140  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3840  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.95 
 
 		 145 aa  139  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3924  flagellar basal-body rod protein FlgC  49.66 
 
 		 145 aa  138  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0670476 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0654  flagellar basal-body rod protein FlgC  50.69 
 
 		 142 aa  137  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.294463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3114  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.97 
 
 		 147 aa  137  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4215  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.63 
 
 		 146 aa  136  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3306  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.28 
 
 		 145 aa  135  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1695  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.21 
 
 		 147 aa  134  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0947147  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1685  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.48 
 
 		 140 aa  133  8e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149162  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0769  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.59 
 
 		 145 aa  130  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197549 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1396  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.9 
 
 		 140 aa  130  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00396064  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2557  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.9 
 
 		 140 aa  130  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0110618  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2461  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.9 
 
 		 140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0105073  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16910  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.52 
 
 		 145 aa  125  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1389  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.83 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.88372 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2175  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.66 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.869204  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2719  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.33 
 
 		 150 aa  121  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.78537  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1109  flagellar basal body rod protein FlgC  43.42 
 
 		 150 aa  120  5e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151882  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0036  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.89 
 
 		 149 aa  120  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2046  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.89 
 
 		 137 aa  120  8e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0847  flagellar basal body rod protein  41.29 
 
 		 155 aa  120  8e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2001  flagellar basal body rod protein FlgC  44.08 
 
 		 150 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0364  flagellar basal body rod protein FlgC  40.62 
 
 		 164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1387  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.97 
 
 		 144 aa  117  7.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1673  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.36 
 
 		 163 aa  116  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1339  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.76 
 
 		 139 aa  115  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00198862  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0705  flagellar basal body rod protein FlgC  39.26 
 
 		 164 aa  114  3.9999999999999997e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0686  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.62 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1464  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.46 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2197  flagellar basal body rod protein FlgC  42.07 
 
 		 134 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000907371 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1287  flagellar basal body rod protein FlgC  42.07 
 
 		 134 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158589  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2013  flagellar basal body rod protein FlgC  42.07 
 
 		 134 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1418  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.46 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1272  flagellar basal body rod protein FlgC  42.07 
 
 		 134 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0147313 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1243  flagellar basal body rod protein FlgC  42.07 
 
 		 134 aa  111  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0426  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.1 
 
 		 139 aa  110  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.651344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0299  flagellar basal body rod protein FlgC  38 
 
 		 152 aa  110  7.000000000000001e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0057  flagellar basal body rod protein FlgC  39.13 
 
 		 166 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.223353  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1125  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.07 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  40.69 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.69 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1554  flagellar basal body rod protein FlgC  41.38 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  40.69 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  40.69 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  40.69 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4198  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.14 
 
 		 138 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2526  flagellar basal body rod protein FlgC  40.69 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310597  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  40.69 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  40.69 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2212  flagellar basal body rod protein FlgC  39.04 
 
 		 144 aa  107  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2054  flagellar basal body rod protein FlgC  40.69 
 
 		 134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.224564 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3069  flagellar basal body rod protein FlgC  40.14 
 
 		 141 aa  107  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2934  flagellar basal body rod protein FlgC  40.14 
 
 		 141 aa  107  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.725751 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2849  flagellar basal body rod protein FlgC  39.6 
 
 		 147 aa  107  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3019  flagellar basal body rod protein FlgC  40.14 
 
 		 141 aa  107  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1654  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.1 
 
 		 145 aa  107  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3043  flagellar basal body rod protein FlgC  40.14 
 
 		 141 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2949  flagellar basal body rod protein FlgC  38.36 
 
 		 141 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.741203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2410  flagellar basal body rod protein FlgC  40.14 
 
 		 141 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642225  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3024  flagellar basal body rod protein FlgC  40.14 
 
 		 141 aa  106  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0826465  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0631  flagellar basal body rod protein FlgC  40.24 
 
 		 164 aa  106  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.662451  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1715  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.73 
 
 		 138 aa  106  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000651347  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1767  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.54 
 
 		 139 aa  106  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.236631  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0568  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.48 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6370  flagellar basal body rod protein FlgC  39.44 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1588  flagellar basal body rod protein FlgC  40.69 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2597  flagellar basal body rod protein FlgC  40 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2969  flagellar basal body rod protein FlgC  39.31 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0552  flagellar basal body rod protein FlgC  39.75 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  40 
 
 		 134 aa  105  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3072  flagellar basal body rod protein  35.86 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.103316 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3326  flagellar basal body rod protein FlgC  38.03 
 
 		 141 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0463  flagellar basal body rod protein FlgC  38.03 
 
 		 141 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4250  flagellar basal body rod protein FlgC  36.84 
 
 		 147 aa  104  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0241  flagellar basal body rod protein FlgC  38.03 
 
 		 141 aa  104  5e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2995  flagellar basal body rod protein FlgC  38.03 
 
 		 141 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2098  flagellar basal body rod protein FlgC  38.03 
 
 		 141 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0267  flagellar basal body rod protein FlgC  38.03 
 
 		 141 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191189  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0279  flagellar basal body rod protein FlgC  38.03 
 
 		 141 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3353  flagellar basal body rod protein FlgC  38.03 
 
 		 141 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0750  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.93 
 
 		 137 aa  102  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1403  flagellar basal body rod protein FlgC  39.02 
 
 		 164 aa  102  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.144667  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4152  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.86 
 
 		 176 aa  102  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0927  flagellar basal-body rod protein FlgC  40 
 
 		 139 aa  102  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1213  flagellar basal body rod protein FlgC  36.36 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1357  flagellar basal body rod protein FlgC  42.86 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0632  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.48 
 
 		 134 aa  101  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2733  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.17 
 
 		 136 aa  101  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108424 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1465  flagellar basal body rod protein FlgC  36.05 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2424  flagellar basal body rod protein FlgC  37.24 
 
 		 134 aa  101  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>