More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1125 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1125  flagellar basal-body rod protein FlgC  100 
 
 
137 aa  280  6.000000000000001e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1715  flagellar basal-body rod protein FlgC  80.88 
 
 
138 aa  234  4e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000651347  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1464  flagellar basal-body rod protein FlgC  72.46 
 
 
140 aa  214  5e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1418  flagellar basal-body rod protein FlgC  72.46 
 
 
140 aa  214  5e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1685  flagellar basal-body rod protein FlgC  62.22 
 
 
140 aa  174  4e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149162  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1695  flagellar basal-body rod protein FlgC  56.85 
 
 
147 aa  167  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0947147  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0769  flagellar basal-body rod protein FlgC  57.24 
 
 
145 aa  167  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197549 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0463  flagellar basal-body rod protein FlgC  53.74 
 
 
147 aa  163  9e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2175  flagellar basal-body rod protein FlgC  54.86 
 
 
145 aa  159  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.869204  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16910  flagellar basal-body rod protein FlgC  55.24 
 
 
145 aa  155  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1389  flagellar basal-body rod protein FlgC  50.34 
 
 
146 aa  152  2e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.88372 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2046  flagellar basal-body rod protein FlgC  56.59 
 
 
137 aa  150  8e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1109  flagellar basal body rod protein FlgC  50.33 
 
 
150 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151882  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2719  flagellar basal-body rod protein FlgC  50 
 
 
150 aa  145  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.78537  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2053  flagellar basal-body rod protein FlgC  49.66 
 
 
147 aa  145  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2001  flagellar basal body rod protein FlgC  48 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1644  flagellar basal-body rod protein FlgC  52.24 
 
 
136 aa  144  3e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000317866  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0299  flagellar basal body rod protein FlgC  50.34 
 
 
152 aa  142  1e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1767  flagellar basal-body rod protein FlgC  50.72 
 
 
139 aa  142  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.236631  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0686  flagellar basal-body rod protein FlgC  52.42 
 
 
140 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3114  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.59 
 
 
147 aa  138  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1339  flagellar basal-body rod protein FlgC  50.72 
 
 
139 aa  135  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00198862  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4215  flagellar basal-body rod protein FlgC  49.32 
 
 
146 aa  136  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3424  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.62 
 
 
145 aa  135  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0408  flagellar basal-body rod protein FlgC  49.31 
 
 
146 aa  134  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0036  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.31 
 
 
149 aa  133  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584577  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4152  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.71 
 
 
176 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1955  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.99 
 
 
135 aa  131  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2410  flagellar basal-body rod protein FlgC  49.66 
 
 
145 aa  131  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1194  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.15 
 
 
143 aa  130  7.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0654  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.23 
 
 
142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.294463  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0267  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.68 
 
 
141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1322  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.6 
 
 
139 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3924  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.64 
 
 
145 aa  127  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0670476 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3027  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.14 
 
 
145 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2666  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.84 
 
 
145 aa  126  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24010  flagellar basal-body rod protein  47.06 
 
 
135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0847  flagellar basal body rod protein  45.86 
 
 
155 aa  124  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3840  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.97 
 
 
145 aa  124  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4198  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.44 
 
 
138 aa  124  6e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2461  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.86 
 
 
140 aa  123  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0105073  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0750  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.53 
 
 
137 aa  123  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1396  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.86 
 
 
140 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00396064  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2285  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.76 
 
 
145 aa  122  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1387  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.23 
 
 
144 aa  122  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2557  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.86 
 
 
140 aa  122  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0110618  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0355  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.15 
 
 
146 aa  122  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1473  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.61 
 
 
136 aa  122  2e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3735  flagellar basal body rod protein FlgC  43.8 
 
 
135 aa  122  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0705  flagellar basal body rod protein FlgC  41.83 
 
 
164 aa  120  6e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0364  flagellar basal body rod protein FlgC  40.62 
 
 
164 aa  120  9e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3099  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.75 
 
 
140 aa  120  9e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329796  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0057  flagellar basal body rod protein FlgC  39.13 
 
 
166 aa  119  9.999999999999999e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.223353  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2323  flagellar basal body rod protein FlgC  44.53 
 
 
134 aa  118  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  45.26 
 
 
134 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2424  flagellar basal body rod protein FlgC  44.53 
 
 
134 aa  118  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1999  flagellar basal body rod protein FlgC  44.53 
 
 
134 aa  118  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2597  flagellar basal body rod protein FlgC  45.26 
 
 
134 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3306  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.83 
 
 
145 aa  117  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0267  flagellar basal body rod protein FlgC  43.07 
 
 
141 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191189  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3326  flagellar basal body rod protein FlgC  43.07 
 
 
141 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0463  flagellar basal body rod protein FlgC  43.07 
 
 
141 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3353  flagellar basal body rod protein FlgC  43.07 
 
 
141 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2098  flagellar basal body rod protein FlgC  43.07 
 
 
141 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2995  flagellar basal body rod protein FlgC  43.07 
 
 
141 aa  117  7e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0279  flagellar basal body rod protein FlgC  43.07 
 
 
141 aa  117  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  43.07 
 
 
134 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.07 
 
 
134 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  43.07 
 
 
134 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  43.07 
 
 
134 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  43.07 
 
 
134 aa  116  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  43.07 
 
 
134 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  43.07 
 
 
134 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2526  flagellar basal body rod protein FlgC  43.07 
 
 
134 aa  116  7.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310597  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2197  flagellar basal body rod protein FlgC  43.07 
 
 
134 aa  116  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000907371 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0241  flagellar basal body rod protein FlgC  42.75 
 
 
141 aa  116  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2013  flagellar basal body rod protein FlgC  43.07 
 
 
134 aa  116  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2054  flagellar basal body rod protein FlgC  43.07 
 
 
134 aa  116  9e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.224564 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1272  flagellar basal body rod protein FlgC  43.07 
 
 
134 aa  116  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0147313 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1287  flagellar basal body rod protein FlgC  43.07 
 
 
134 aa  116  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158589  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1243  flagellar basal body rod protein FlgC  43.07 
 
 
134 aa  116  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4299  flagellar basal body rod protein FlgC  40.41 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5626  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.07 
 
 
135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1465  flagellar basal body rod protein FlgC  40.82 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50470  flagellar basal body rod protein FlgC  40.41 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0177426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3951  flagellar basal body rod protein FlgC  40.82 
 
 
147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1213  flagellar basal body rod protein FlgC  43.71 
 
 
151 aa  114  3e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2733  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.61 
 
 
136 aa  114  3e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108424 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2969  flagellar basal body rod protein FlgC  42.34 
 
 
134 aa  115  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134298  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1673  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.52 
 
 
163 aa  115  3e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1554  flagellar basal body rod protein FlgC  43.8 
 
 
134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6370  flagellar basal body rod protein FlgC  42.34 
 
 
141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130671  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3069  flagellar basal body rod protein FlgC  42.34 
 
 
141 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2934  flagellar basal body rod protein FlgC  42.34 
 
 
141 aa  114  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.725751 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4390  flagellar basal body rod protein FlgC  40.82 
 
 
147 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0794673  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3043  flagellar basal body rod protein FlgC  42.34 
 
 
141 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1694  flagellar basal body rod protein FlgC  48.85 
 
 
141 aa  113  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1588  flagellar basal body rod protein FlgC  41.61 
 
 
134 aa  113  6.9999999999999995e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2410  flagellar basal body rod protein FlgC  42.34 
 
 
141 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642225  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3024  flagellar basal body rod protein FlgC  42.34 
 
 
141 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0826465  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>