261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_1694 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_1694  flagellar basal body rod protein FlgC  100 
 
 		 141 aa  284  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3776  flagellar basal body rod protein FlgC  93.62 
 
 		 141 aa  269  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0600625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4410  flagellar basal body rod protein FlgC  90.07 
 
 		 141 aa  259  6.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.541352  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1518  flagellar basal body rod protein FlgC  86.52 
 
 		 141 aa  251  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0198818  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1393  flagellar basal body rod protein FlgC  81.56 
 
 		 141 aa  246  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0993913  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5496  flagellar basal body rod protein FlgC  80.71 
 
 		 141 aa  240  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1133  flagellar basal body rod protein FlgC  80.14 
 
 		 141 aa  239  1e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.886301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2607  flagellar basal body rod protein FlgC  68.15 
 
 		 136 aa  194  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122012  normal  0.267532 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2830  flagellar basal body rod protein FlgC  68.15 
 
 		 136 aa  194  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.172073  normal  0.232346 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2637  flagellar basal body rod protein FlgC  67.41 
 
 		 136 aa  193  8.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.296466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5537  flagellar basal body rod protein FlgC  67.91 
 
 		 136 aa  191  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132652  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5154  flagellar basal body rod protein FlgC  66.42 
 
 		 136 aa  186  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205426  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2234  flagellar basal body rod protein FlgC  63.43 
 
 		 135 aa  178  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2571  flagellar basal body rod protein FlgC  61.03 
 
 		 139 aa  174  3e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2825  flagellar basal body rod protein FlgC  55.56 
 
 		 137 aa  155  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1937  flagellar basal body rod protein FlgC  54.07 
 
 		 137 aa  153  8e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.123234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1691  flagellar basal body rod protein FlgC  56.39 
 
 		 138 aa  149  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.132509  normal  0.0178 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1367  flagellar basal body rod protein FlgC  55.38 
 
 		 140 aa  147  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4211  flagellar basal body rod protein FlgC  52.67 
 
 		 140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0136  flagellar basal body rod protein FlgC  52.67 
 
 		 140 aa  143  8.000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.06608  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0152  flagellar basal body rod protein FlgC  52.67 
 
 		 140 aa  142  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0350  flagellar basal body rod protein FlgC  50.75 
 
 		 138 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.121375 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3674  flagellar basal body rod protein FlgC  52.34 
 
 		 138 aa  141  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523112 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0318  flagellar basal body rod protein FlgC  50.75 
 
 		 138 aa  141  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.783853  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0737  flagellar basal body rod protein FlgC  50.75 
 
 		 145 aa  140  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1095  flagellar basal body rod protein FlgC  50 
 
 		 139 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0597  flagellar basal body rod protein FlgC  51.56 
 
 		 138 aa  138  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3438  flagellar basal body rod protein FlgC  45.52 
 
 		 135 aa  137  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1143  flagellar basal body rod protein FlgC  51.18 
 
 		 137 aa  136  8.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0025  flagellar basal body rod protein FlgC  49.62 
 
 		 140 aa  136  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3655  flagellar basal body rod protein FlgC  51.91 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.633505  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0256  flagellar basal body rod protein FlgC  48.85 
 
 		 139 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2133  flagellar basal body rod protein FlgC  44.7 
 
 		 134 aa  130  6.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0297  flagellar basal body rod protein FlgC  49.22 
 
 		 139 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0630  flagellar basal body rod protein FlgC  52.34 
 
 		 138 aa  124  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.652584  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0619  flagellar basal body rod protein FlgC  52.34 
 
 		 138 aa  124  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.017127  normal  0.0984024 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1125  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.85 
 
 		 137 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1715  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.85 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000651347  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3840  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.76 
 
 		 145 aa  110  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1418  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.51 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1464  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.51 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3924  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.07 
 
 		 145 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0670476 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2964  flagellar basal body rod protein FlgC  42.54 
 
 		 130 aa  108  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.796607  normal  0.243642 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0267  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.73 
 
 		 141 aa  103  9e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1644  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.31 
 
 		 136 aa  101  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000317866  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1685  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.11 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149162  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0944  flagellar basal body rod protein FlgC  40.16 
 
 		 136 aa  101  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.255907  normal  0.801291 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2175  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.36 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.869204  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1695  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.71 
 
 		 147 aa  97.1  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0947147  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0408  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.96 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16910  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.29 
 
 		 145 aa  95.9  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1767  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.86 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.236631  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3248  flagellar basal body rod protein FlgC  40 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.893989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3114  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.97 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0355  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.31 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1389  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.85 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.88372 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3027  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.93 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4215  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.58 
 
 		 146 aa  94  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1330  flagellar basal body rod protein FlgC  40.3 
 
 		 128 aa  93.6  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2991  flagellar basal body rod protein FlgC  40.3 
 
 		 126 aa  93.6  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1109  flagellar basal body rod protein FlgC  37.67 
 
 		 150 aa  93.6  9e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151882  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3424  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.93 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4075  protein of unknown function DUF1078 domain protein  42.24 
 
 		 113 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.402367 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1673  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.95 
 
 		 163 aa  92.4  2e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1194  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.88 
 
 		 143 aa  92.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0769  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.36 
 
 		 145 aa  92  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197549 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4197  flagellar basal body rod protein FlgC  38.81 
 
 		 130 aa  92  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2666  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.31 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0705  flagellar basal body rod protein FlgC  33.33 
 
 		 164 aa  90.9  5e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0686  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.37 
 
 		 140 aa  90.9  6e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4198  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.6 
 
 		 138 aa  90.9  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2053  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.16 
 
 		 147 aa  90.1  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0299  flagellar basal body rod protein FlgC  38.93 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2719  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.24 
 
 		 150 aa  88.6  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.78537  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0552  flagellar basal body rod protein FlgC  35.8 
 
 		 164 aa  88.6  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0631  flagellar basal body rod protein FlgC  35.19 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.662451  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2601  flagellar basal body rod protein FlgC  40.65 
 
 		 126 aa  88.2  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.773402  hitchhiker  0.000553357 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0463  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.5 
 
 		 147 aa  88.2  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1403  flagellar basal body rod protein FlgC  35.19 
 
 		 164 aa  87.4  6e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.144667  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1066  flagellar basal body rod protein FlgC  33.95 
 
 		 164 aa  86.7  9e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0036  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.62 
 
 		 149 aa  86.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1575  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.1 
 
 		 145 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2046  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.14 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2285  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.55 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2410  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.85 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0654  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.24 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.294463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2934  flagellar basal body rod protein FlgC  40 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.725751 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2212  flagellar basal body rod protein FlgC  37.78 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1955  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.3 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2849  flagellar basal body rod protein FlgC  36.81 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1339  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.86 
 
 		 139 aa  85.9  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00198862  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3069  flagellar basal body rod protein FlgC  40 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2001  flagellar basal body rod protein FlgC  37.67 
 
 		 150 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3306  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.31 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0847  flagellar basal body rod protein  36.42 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50470  flagellar basal body rod protein FlgC  35.42 
 
 		 146 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0177426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4299  flagellar basal body rod protein FlgC  35.42 
 
 		 146 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0750  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.58 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4250  flagellar basal body rod protein FlgC  36.96 
 
 		 147 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3735  flagellar basal body rod protein FlgC  41.27 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>