263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2571 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2571  flagellar basal body rod protein FlgC  100 
 
 		 139 aa  284  2e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2637  flagellar basal body rod protein FlgC  64.44 
 
 		 136 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.296466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2607  flagellar basal body rod protein FlgC  64.44 
 
 		 136 aa  186  1e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122012  normal  0.267532 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2830  flagellar basal body rod protein FlgC  64.44 
 
 		 136 aa  186  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.172073  normal  0.232346 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5537  flagellar basal body rod protein FlgC  62.96 
 
 		 136 aa  179  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132652  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5496  flagellar basal body rod protein FlgC  61.94 
 
 		 141 aa  177  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3776  flagellar basal body rod protein FlgC  63.24 
 
 		 141 aa  177  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0600625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1393  flagellar basal body rod protein FlgC  61.94 
 
 		 141 aa  176  7e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0993913  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1518  flagellar basal body rod protein FlgC  61.03 
 
 		 141 aa  175  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0198818  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1694  flagellar basal body rod protein FlgC  61.03 
 
 		 141 aa  174  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1133  flagellar basal body rod protein FlgC  60.45 
 
 		 141 aa  174  4e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.886301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2234  flagellar basal body rod protein FlgC  61.48 
 
 		 135 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5154  flagellar basal body rod protein FlgC  61.48 
 
 		 136 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205426  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4410  flagellar basal body rod protein FlgC  59.7 
 
 		 141 aa  168  3e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.541352  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1937  flagellar basal body rod protein FlgC  55.73 
 
 		 137 aa  158  2e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.123234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1367  flagellar basal body rod protein FlgC  58.78 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2825  flagellar basal body rod protein FlgC  55.97 
 
 		 137 aa  155  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0297  flagellar basal body rod protein FlgC  57.14 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1095  flagellar basal body rod protein FlgC  51.88 
 
 		 139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3438  flagellar basal body rod protein FlgC  52.59 
 
 		 135 aa  150  5e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4211  flagellar basal body rod protein FlgC  52.9 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0256  flagellar basal body rod protein FlgC  51.88 
 
 		 139 aa  147  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1143  flagellar basal body rod protein FlgC  55.91 
 
 		 137 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0136  flagellar basal body rod protein FlgC  52.9 
 
 		 140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.06608  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0152  flagellar basal body rod protein FlgC  52.17 
 
 		 140 aa  143  6e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0318  flagellar basal body rod protein FlgC  50.38 
 
 		 138 aa  142  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.783853  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0350  flagellar basal body rod protein FlgC  50.38 
 
 		 138 aa  140  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.121375 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0737  flagellar basal body rod protein FlgC  47.37 
 
 		 145 aa  140  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1691  flagellar basal body rod protein FlgC  52.63 
 
 		 138 aa  140  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.132509  normal  0.0178 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3655  flagellar basal body rod protein FlgC  51.13 
 
 		 138 aa  140  7e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.633505  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0025  flagellar basal body rod protein FlgC  49.62 
 
 		 140 aa  138  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3674  flagellar basal body rod protein FlgC  49.62 
 
 		 138 aa  136  8.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523112 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0597  flagellar basal body rod protein FlgC  50.38 
 
 		 138 aa  133  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2133  flagellar basal body rod protein FlgC  43.28 
 
 		 134 aa  131  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0619  flagellar basal body rod protein FlgC  48.87 
 
 		 138 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.017127  normal  0.0984024 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2964  flagellar basal body rod protein FlgC  44.44 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.796607  normal  0.243642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0630  flagellar basal body rod protein FlgC  48.87 
 
 		 138 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.652584  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2991  flagellar basal body rod protein FlgC  42.96 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1330  flagellar basal body rod protein FlgC  42.96 
 
 		 128 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0267  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.96 
 
 		 141 aa  107  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2175  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.97 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.869204  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2053  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.41 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1194  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.28 
 
 		 143 aa  105  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1715  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.11 
 
 		 138 aa  104  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000651347  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1695  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.57 
 
 		 147 aa  103  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0947147  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1464  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.57 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3248  flagellar basal body rod protein FlgC  41.48 
 
 		 130 aa  103  1e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.893989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1418  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.57 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0036  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.67 
 
 		 149 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3924  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.73 
 
 		 145 aa  101  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0670476 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3840  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.73 
 
 		 145 aa  101  4e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1685  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.01 
 
 		 140 aa  100  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149162  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2111  flagellar basal body rod protein FlgC  39.85 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16910  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.16 
 
 		 145 aa  100  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1125  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.58 
 
 		 137 aa  100  6e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0463  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.54 
 
 		 147 aa  100  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1673  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.76 
 
 		 163 aa  99.4  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2001  flagellar basal body rod protein FlgC  40.54 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1109  flagellar basal body rod protein FlgC  37.84 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151882  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0705  flagellar basal body rod protein FlgC  33.54 
 
 		 164 aa  98.2  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2601  flagellar basal body rod protein FlgC  41.94 
 
 		 126 aa  96.7  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.773402  hitchhiker  0.000553357 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4197  flagellar basal body rod protein FlgC  40.74 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4075  protein of unknown function DUF1078 domain protein  47.01 
 
 		 113 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.402367 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3114  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.55 
 
 		 147 aa  95.1  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0769  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.24 
 
 		 145 aa  94.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197549 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0944  flagellar basal body rod protein FlgC  39.52 
 
 		 136 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.255907  normal  0.801291 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0299  flagellar basal body rod protein FlgC  39.47 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0426  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.41 
 
 		 139 aa  94.4  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.651344  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0408  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.31 
 
 		 146 aa  94.4  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2719  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.24 
 
 		 150 aa  94.4  5e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.78537  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1955  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.55 
 
 		 135 aa  94.4  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4215  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.78 
 
 		 146 aa  93.6  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1066  flagellar basal body rod protein FlgC  34.15 
 
 		 164 aa  93.2  1e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3424  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.67 
 
 		 145 aa  92.8  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3027  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.58 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0654  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.3 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.294463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2597  flagellar basal body rod protein FlgC  39.26 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  39.26 
 
 		 134 aa  91.3  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1644  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.3 
 
 		 136 aa  90.9  5e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000317866  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0552  flagellar basal body rod protein FlgC  35.37 
 
 		 164 aa  90.9  5e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0057  flagellar basal body rod protein FlgC  34.97 
 
 		 166 aa  90.9  6e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.223353  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1554  flagellar basal body rod protein FlgC  38.35 
 
 		 134 aa  90.5  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0631  flagellar basal body rod protein FlgC  35.37 
 
 		 164 aa  90.1  9e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.662451  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1403  flagellar basal body rod protein FlgC  34.76 
 
 		 164 aa  89.7  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.144667  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1339  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.69 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00198862  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1322  flagellar basal-body rod protein FlgC  35 
 
 		 139 aa  88.2  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3306  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.81 
 
 		 145 aa  87.8  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0343  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.3 
 
 		 135 aa  87.4  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.962617 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1389  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.1 
 
 		 146 aa  87.4  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.88372 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2046  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.88 
 
 		 137 aa  87  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  41.61 
 
 		 134 aa  87  8e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.61 
 
 		 134 aa  87  8e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  41.61 
 
 		 134 aa  87  8e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  41.61 
 
 		 134 aa  87  8e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  41.61 
 
 		 134 aa  87  8e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  41.61 
 
 		 134 aa  87  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2526  flagellar basal body rod protein FlgC  41.61 
 
 		 134 aa  87  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310597  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  41.61 
 
 		 134 aa  87  8e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4790  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.3 
 
 		 135 aa  87  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3713  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.3 
 
 		 135 aa  87  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.889388  normal  0.277072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>