286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2111 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2111  flagellar basal body rod protein FlgC  100 
 
 		 130 aa  266  7e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1330  flagellar basal body rod protein FlgC  63.85 
 
 		 128 aa  172  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2991  flagellar basal body rod protein FlgC  63.08 
 
 		 126 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4197  flagellar basal body rod protein FlgC  60.77 
 
 		 130 aa  164  5e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2601  flagellar basal body rod protein FlgC  59.23 
 
 		 126 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.773402  hitchhiker  0.000553357 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2964  flagellar basal body rod protein FlgC  57.69 
 
 		 130 aa  159  1e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.796607  normal  0.243642 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3248  flagellar basal body rod protein FlgC  49.23 
 
 		 130 aa  131  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.893989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0737  flagellar basal body rod protein FlgC  43.51 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0136  flagellar basal body rod protein FlgC  44.36 
 
 		 140 aa  103  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.06608  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4211  flagellar basal body rod protein FlgC  43.61 
 
 		 140 aa  103  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0152  flagellar basal body rod protein FlgC  43.61 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0597  flagellar basal body rod protein FlgC  41.67 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1937  flagellar basal body rod protein FlgC  40.88 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.123234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2571  flagellar basal body rod protein FlgC  39.85 
 
 		 139 aa  100  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0350  flagellar basal body rod protein FlgC  42.11 
 
 		 138 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.121375 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0318  flagellar basal body rod protein FlgC  40.46 
 
 		 138 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.783853  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2825  flagellar basal body rod protein FlgC  43.41 
 
 		 137 aa  98.2  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3674  flagellar basal body rod protein FlgC  41.01 
 
 		 138 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523112 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3655  flagellar basal body rod protein FlgC  39.42 
 
 		 138 aa  97.1  7e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.633505  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0256  flagellar basal body rod protein FlgC  42.11 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1095  flagellar basal body rod protein FlgC  38.17 
 
 		 139 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1691  flagellar basal body rod protein FlgC  40.88 
 
 		 138 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.132509  normal  0.0178 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0297  flagellar basal body rod protein FlgC  39.69 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0025  flagellar basal body rod protein FlgC  38.69 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1367  flagellar basal body rod protein FlgC  37.5 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0619  flagellar basal body rod protein FlgC  41.67 
 
 		 138 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.017127  normal  0.0984024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0630  flagellar basal body rod protein FlgC  41.67 
 
 		 138 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.652584  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5154  flagellar basal body rod protein FlgC  38.64 
 
 		 136 aa  87  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205426  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3438  flagellar basal body rod protein FlgC  37.01 
 
 		 135 aa  86.7  9e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1133  flagellar basal body rod protein FlgC  37.88 
 
 		 141 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.886301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5537  flagellar basal body rod protein FlgC  37.88 
 
 		 136 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132652  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1393  flagellar basal body rod protein FlgC  37.12 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0993913  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1518  flagellar basal body rod protein FlgC  38.58 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0198818  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5496  flagellar basal body rod protein FlgC  37.5 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1143  flagellar basal body rod protein FlgC  36.36 
 
 		 137 aa  83.6  9e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2607  flagellar basal body rod protein FlgC  38.64 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122012  normal  0.267532 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2830  flagellar basal body rod protein FlgC  38.64 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.172073  normal  0.232346 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2637  flagellar basal body rod protein FlgC  40.15 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.296466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3776  flagellar basal body rod protein FlgC  39.37 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0600625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4410  flagellar basal body rod protein FlgC  38.58 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.541352  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0364  flagellar basal body rod protein FlgC  32.32 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1694  flagellar basal body rod protein FlgC  37.01 
 
 		 141 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2133  flagellar basal body rod protein FlgC  34.65 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2053  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.39 
 
 		 147 aa  77.8  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1473  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.83 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0463  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.67 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2234  flagellar basal body rod protein FlgC  37.96 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2410  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.17 
 
 		 145 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1125  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.09 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3027  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.1 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2175  flagellar basal-body rod protein FlgC  30.99 
 
 		 145 aa  72.4  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.869204  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1685  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.25 
 
 		 140 aa  72  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149162  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2719  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.33 
 
 		 150 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.78537  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1464  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.57 
 
 		 140 aa  70.1  0.000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1418  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.57 
 
 		 140 aa  70.1  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1715  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.16 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000651347  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16910  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.91 
 
 		 145 aa  69.3  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1339  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.33 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00198862  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1695  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.41 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0947147  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0343  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.54 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.962617 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1673  flagellar basal-body rod protein FlgC  27.95 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0568  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.09 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0705  flagellar basal body rod protein FlgC  28.75 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0654  flagellar basal-body rod protein FlgC  29.5 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.294463  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0267  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.53 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2969  flagellar basal body rod protein FlgC  31.62 
 
 		 134 aa  67  0.00000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0068  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.84 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1066  flagellar basal body rod protein FlgC  29.19 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0552  flagellar basal body rod protein FlgC  30.63 
 
 		 164 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0631  flagellar basal body rod protein FlgC  29.81 
 
 		 164 aa  65.5  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.662451  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1287  flagellar basal body rod protein FlgC  31.01 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158589  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3650  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.07 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0927  flagellar basal-body rod protein FlgC  30.88 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0847  flagellar basal body rod protein  28.29 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2013  flagellar basal body rod protein FlgC  31.01 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2197  flagellar basal body rod protein FlgC  31.01 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000907371 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2733  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.26 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108424 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1272  flagellar basal body rod protein FlgC  31.01 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0147313 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1243  flagellar basal body rod protein FlgC  31.01 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2597  flagellar basal body rod protein FlgC  31.78 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5626  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.82 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4790  flagellar basal-body rod protein FlgC  30.47 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3713  flagellar basal-body rod protein FlgC  30.47 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.889388  normal  0.277072 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  31.78 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3840  flagellar basal-body rod protein FlgC  28.19 
 
 		 145 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2212  flagellar basal body rod protein FlgC  32.62 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  31.01 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.01 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  31.01 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2526  flagellar basal body rod protein FlgC  31.01 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310597  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  31.01 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  31.01 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  31.01 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  31.01 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1403  flagellar basal body rod protein FlgC  29.19 
 
 		 164 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.144667  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1977  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.17 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2054  flagellar basal body rod protein FlgC  31.01 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.224564 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24010  flagellar basal-body rod protein  34.4 
 
 		 135 aa  63.9  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1417  flagellar basal body rod protein FlgC  33.86 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0057  flagellar basal body rod protein FlgC  27.95 
 
 		 166 aa  63.5  0.0000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.223353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>