261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5496 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5496  flagellar basal body rod protein FlgC  100 
 
 		 141 aa  284  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1393  flagellar basal body rod protein FlgC  86.52 
 
 		 141 aa  249  8.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0993913  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1133  flagellar basal body rod protein FlgC  85.82 
 
 		 141 aa  248  1e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.886301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1518  flagellar basal body rod protein FlgC  85.71 
 
 		 141 aa  245  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0198818  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4410  flagellar basal body rod protein FlgC  82.86 
 
 		 141 aa  243  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.541352  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1694  flagellar basal body rod protein FlgC  80.71 
 
 		 141 aa  240  6e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3776  flagellar basal body rod protein FlgC  81.43 
 
 		 141 aa  239  7e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0600625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5537  flagellar basal body rod protein FlgC  69.63 
 
 		 136 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132652  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5154  flagellar basal body rod protein FlgC  67.41 
 
 		 136 aa  191  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205426  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2607  flagellar basal body rod protein FlgC  67.16 
 
 		 136 aa  190  6e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122012  normal  0.267532 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2830  flagellar basal body rod protein FlgC  67.16 
 
 		 136 aa  190  6e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.172073  normal  0.232346 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2637  flagellar basal body rod protein FlgC  66.42 
 
 		 136 aa  188  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.296466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2571  flagellar basal body rod protein FlgC  61.94 
 
 		 139 aa  177  2.9999999999999997e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2234  flagellar basal body rod protein FlgC  60.45 
 
 		 135 aa  175  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1937  flagellar basal body rod protein FlgC  60.77 
 
 		 137 aa  166  8e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.123234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2825  flagellar basal body rod protein FlgC  57.04 
 
 		 137 aa  163  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1367  flagellar basal body rod protein FlgC  57.78 
 
 		 140 aa  150  4e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1691  flagellar basal body rod protein FlgC  56.92 
 
 		 138 aa  149  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.132509  normal  0.0178 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0737  flagellar basal body rod protein FlgC  53.28 
 
 		 145 aa  148  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0318  flagellar basal body rod protein FlgC  55.73 
 
 		 138 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.783853  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0597  flagellar basal body rod protein FlgC  55.47 
 
 		 138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3674  flagellar basal body rod protein FlgC  51.91 
 
 		 138 aa  143  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523112 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0350  flagellar basal body rod protein FlgC  54.96 
 
 		 138 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.121375 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1095  flagellar basal body rod protein FlgC  51.54 
 
 		 139 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0025  flagellar basal body rod protein FlgC  51.91 
 
 		 140 aa  141  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4211  flagellar basal body rod protein FlgC  50.72 
 
 		 140 aa  141  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0136  flagellar basal body rod protein FlgC  52.17 
 
 		 140 aa  141  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.06608  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0152  flagellar basal body rod protein FlgC  52.17 
 
 		 140 aa  141  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0256  flagellar basal body rod protein FlgC  50 
 
 		 139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3438  flagellar basal body rod protein FlgC  47.76 
 
 		 135 aa  137  3.9999999999999997e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3655  flagellar basal body rod protein FlgC  51.15 
 
 		 138 aa  137  6e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.633505  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1143  flagellar basal body rod protein FlgC  48.03 
 
 		 137 aa  132  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0297  flagellar basal body rod protein FlgC  49.62 
 
 		 139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2133  flagellar basal body rod protein FlgC  46.21 
 
 		 134 aa  130  6e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0630  flagellar basal body rod protein FlgC  55.47 
 
 		 138 aa  127  6e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.652584  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0619  flagellar basal body rod protein FlgC  55.47 
 
 		 138 aa  127  6e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.017127  normal  0.0984024 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2964  flagellar basal body rod protein FlgC  42.96 
 
 		 130 aa  115  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.796607  normal  0.243642 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1125  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.15 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1715  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.56 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000651347  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1109  flagellar basal body rod protein FlgC  41.78 
 
 		 150 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151882  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1464  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.75 
 
 		 140 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1418  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.75 
 
 		 140 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1685  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.96 
 
 		 140 aa  107  6e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149162  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3924  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.38 
 
 		 145 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0670476 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1644  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.24 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000317866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3840  flagellar basal-body rod protein FlgC  40 
 
 		 145 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1673  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.19 
 
 		 163 aa  100  5e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3424  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.69 
 
 		 145 aa  100  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0267  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.57 
 
 		 141 aa  100  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1695  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.97 
 
 		 147 aa  100  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0947147  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4075  protein of unknown function DUF1078 domain protein  44.83 
 
 		 113 aa  100  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.402367 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2175  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.56 
 
 		 145 aa  100  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.869204  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0408  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.66 
 
 		 146 aa  99.4  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3114  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.28 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0769  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.76 
 
 		 145 aa  98.6  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197549 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2001  flagellar basal body rod protein FlgC  41.22 
 
 		 150 aa  98.2  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0036  flagellar basal-body rod protein FlgC  40 
 
 		 149 aa  97.8  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0944  flagellar basal body rod protein FlgC  40.16 
 
 		 136 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.255907  normal  0.801291 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4197  flagellar basal body rod protein FlgC  40.15 
 
 		 130 aa  95.5  2e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2046  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.55 
 
 		 137 aa  95.9  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3248  flagellar basal body rod protein FlgC  40.3 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.893989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1955  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.62 
 
 		 135 aa  95.1  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0705  flagellar basal body rod protein FlgC  33.33 
 
 		 164 aa  95.1  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4215  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.28 
 
 		 146 aa  94.4  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1767  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.74 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.236631  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2991  flagellar basal body rod protein FlgC  40 
 
 		 126 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0631  flagellar basal body rod protein FlgC  35.19 
 
 		 164 aa  94  6e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.662451  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1330  flagellar basal body rod protein FlgC  40 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1194  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.59 
 
 		 143 aa  94  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0552  flagellar basal body rod protein FlgC  35.19 
 
 		 164 aa  94  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16910  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.57 
 
 		 145 aa  92.8  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2666  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.76 
 
 		 145 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2601  flagellar basal body rod protein FlgC  43.09 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.773402  hitchhiker  0.000553357 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1403  flagellar basal body rod protein FlgC  34.57 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.144667  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0686  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.1 
 
 		 140 aa  92  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4198  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.16 
 
 		 138 aa  92.4  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3027  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.76 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3326  flagellar basal body rod protein FlgC  40.46 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0750  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.73 
 
 		 137 aa  92  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0463  flagellar basal body rod protein FlgC  40.46 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4299  flagellar basal body rod protein FlgC  37.68 
 
 		 146 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3306  flagellar basal-body rod protein FlgC  40 
 
 		 145 aa  91.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1389  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.14 
 
 		 146 aa  91.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.88372 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50470  flagellar basal body rod protein FlgC  37.68 
 
 		 146 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0177426 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2995  flagellar basal body rod protein FlgC  40.46 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2098  flagellar basal body rod protein FlgC  40.46 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0267  flagellar basal body rod protein FlgC  40.46 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191189  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0279  flagellar basal body rod protein FlgC  40.46 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3353  flagellar basal body rod protein FlgC  40.46 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0057  flagellar basal body rod protein FlgC  33.54 
 
 		 166 aa  91.3  4e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.223353  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0355  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.06 
 
 		 146 aa  91.7  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1066  flagellar basal body rod protein FlgC  33.95 
 
 		 164 aa  91.3  4e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0463  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.19 
 
 		 147 aa  91.7  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2053  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.16 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3735  flagellar basal body rod protein FlgC  41.27 
 
 		 135 aa  90.9  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0364  flagellar basal body rod protein FlgC  33.54 
 
 		 164 aa  90.5  7e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  39.2 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2719  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.62 
 
 		 150 aa  89.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.78537  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0241  flagellar basal body rod protein FlgC  39.69 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3019  flagellar basal body rod protein FlgC  39.85 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>