262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1518 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1518  flagellar basal body rod protein FlgC  100 
 
 		 141 aa  285  1e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0198818  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4410  flagellar basal body rod protein FlgC  87.94 
 
 		 141 aa  254  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.541352  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1133  flagellar basal body rod protein FlgC  86.52 
 
 		 141 aa  253  7e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.886301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3776  flagellar basal body rod protein FlgC  86.52 
 
 		 141 aa  251  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0600625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1694  flagellar basal body rod protein FlgC  86.52 
 
 		 141 aa  251  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1393  flagellar basal body rod protein FlgC  85.82 
 
 		 141 aa  249  7e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0993913  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5496  flagellar basal body rod protein FlgC  85.71 
 
 		 141 aa  245  1e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2637  flagellar basal body rod protein FlgC  69.85 
 
 		 136 aa  199  8e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.296466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2830  flagellar basal body rod protein FlgC  69.12 
 
 		 136 aa  196  7.999999999999999e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.172073  normal  0.232346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2607  flagellar basal body rod protein FlgC  69.12 
 
 		 136 aa  196  7.999999999999999e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122012  normal  0.267532 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5537  flagellar basal body rod protein FlgC  70.37 
 
 		 136 aa  195  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132652  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5154  flagellar basal body rod protein FlgC  67.41 
 
 		 136 aa  188  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205426  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2234  flagellar basal body rod protein FlgC  62.96 
 
 		 135 aa  179  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2571  flagellar basal body rod protein FlgC  61.03 
 
 		 139 aa  175  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1937  flagellar basal body rod protein FlgC  59.09 
 
 		 137 aa  160  8.000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.123234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2825  flagellar basal body rod protein FlgC  55.56 
 
 		 137 aa  158  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0737  flagellar basal body rod protein FlgC  53.73 
 
 		 145 aa  152  1e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1691  flagellar basal body rod protein FlgC  58.27 
 
 		 138 aa  151  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.132509  normal  0.0178 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0318  flagellar basal body rod protein FlgC  54.48 
 
 		 138 aa  149  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.783853  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3674  flagellar basal body rod protein FlgC  52.99 
 
 		 138 aa  148  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523112 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1095  flagellar basal body rod protein FlgC  52.67 
 
 		 139 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0256  flagellar basal body rod protein FlgC  50.75 
 
 		 139 aa  149  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0025  flagellar basal body rod protein FlgC  54.2 
 
 		 140 aa  147  3e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1367  flagellar basal body rod protein FlgC  56.92 
 
 		 140 aa  147  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0350  flagellar basal body rod protein FlgC  53.73 
 
 		 138 aa  147  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.121375 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0597  flagellar basal body rod protein FlgC  54.69 
 
 		 138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3438  flagellar basal body rod protein FlgC  48.89 
 
 		 135 aa  143  9e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4211  flagellar basal body rod protein FlgC  51.15 
 
 		 140 aa  141  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1143  flagellar basal body rod protein FlgC  51.18 
 
 		 137 aa  140  5e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0297  flagellar basal body rod protein FlgC  50.75 
 
 		 139 aa  140  7e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0152  flagellar basal body rod protein FlgC  48.94 
 
 		 140 aa  138  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0136  flagellar basal body rod protein FlgC  48.94 
 
 		 140 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.06608  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3655  flagellar basal body rod protein FlgC  51.15 
 
 		 138 aa  138  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.633505  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2133  flagellar basal body rod protein FlgC  46.27 
 
 		 134 aa  134  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0630  flagellar basal body rod protein FlgC  56.25 
 
 		 138 aa  131  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.652584  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0619  flagellar basal body rod protein FlgC  56.25 
 
 		 138 aa  131  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.017127  normal  0.0984024 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2964  flagellar basal body rod protein FlgC  44.03 
 
 		 130 aa  115  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.796607  normal  0.243642 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3840  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.15 
 
 		 145 aa  110  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1125  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.56 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3924  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.78 
 
 		 145 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0670476 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1464  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.98 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1418  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.98 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1194  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.14 
 
 		 143 aa  104  5e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0267  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.71 
 
 		 141 aa  104  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4075  protein of unknown function DUF1078 domain protein  46.55 
 
 		 113 aa  103  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.402367 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1715  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.56 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000651347  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1330  flagellar basal body rod protein FlgC  43.28 
 
 		 128 aa  100  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2991  flagellar basal body rod protein FlgC  43.28 
 
 		 126 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1644  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.81 
 
 		 136 aa  100  8e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000317866  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0355  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.41 
 
 		 146 aa  99  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1695  flagellar basal-body rod protein FlgC  40 
 
 		 147 aa  99.4  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0947147  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1685  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.35 
 
 		 140 aa  97.8  4e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149162  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3027  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.89 
 
 		 145 aa  97.8  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3424  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.73 
 
 		 145 aa  96.7  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1109  flagellar basal body rod protein FlgC  38.67 
 
 		 150 aa  96.3  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151882  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16910  flagellar basal-body rod protein FlgC  40 
 
 		 145 aa  96.7  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2601  flagellar basal body rod protein FlgC  43.9 
 
 		 126 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.773402  hitchhiker  0.000553357 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0769  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.5 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197549 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0944  flagellar basal body rod protein FlgC  39.34 
 
 		 136 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.255907  normal  0.801291 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1575  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.54 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1673  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.54 
 
 		 163 aa  94.7  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2175  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.86 
 
 		 145 aa  94.4  5e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.869204  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1767  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.34 
 
 		 139 aa  94.4  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.236631  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3248  flagellar basal body rod protein FlgC  41.04 
 
 		 130 aa  93.2  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.893989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4197  flagellar basal body rod protein FlgC  40.44 
 
 		 130 aa  92.8  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2666  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.19 
 
 		 145 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0408  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.97 
 
 		 146 aa  91.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1389  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.14 
 
 		 146 aa  91.7  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.88372 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0036  flagellar basal-body rod protein FlgC  36 
 
 		 149 aa  90.9  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  40.8 
 
 		 134 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0299  flagellar basal body rod protein FlgC  37.01 
 
 		 152 aa  90.5  7e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2053  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.84 
 
 		 147 aa  90.5  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2597  flagellar basal body rod protein FlgC  40.8 
 
 		 134 aa  90.1  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0631  flagellar basal body rod protein FlgC  34.55 
 
 		 164 aa  90.1  9e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.662451  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3114  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.62 
 
 		 147 aa  90.1  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4198  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.8 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4250  flagellar basal body rod protein FlgC  36.99 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2001  flagellar basal body rod protein FlgC  38.67 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4215  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.62 
 
 		 146 aa  88.6  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2212  flagellar basal body rod protein FlgC  36.11 
 
 		 144 aa  88.6  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1654  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.43 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1554  flagellar basal body rod protein FlgC  40 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3019  flagellar basal body rod protein FlgC  40 
 
 		 141 aa  88.2  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0705  flagellar basal body rod protein FlgC  30.91 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3306  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.73 
 
 		 145 aa  88.2  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0552  flagellar basal body rod protein FlgC  33.94 
 
 		 164 aa  88.2  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0463  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.99 
 
 		 147 aa  88.2  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0654  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.88 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.294463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3043  flagellar basal body rod protein FlgC  40 
 
 		 141 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4299  flagellar basal body rod protein FlgC  35.62 
 
 		 146 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2410  flagellar basal body rod protein FlgC  40 
 
 		 141 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642225  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50470  flagellar basal body rod protein FlgC  35.62 
 
 		 146 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0177426 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3024  flagellar basal body rod protein FlgC  40 
 
 		 141 aa  87.8  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0826465  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2949  flagellar basal body rod protein FlgC  39.1 
 
 		 141 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.741203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1339  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.46 
 
 		 139 aa  87.8  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00198862  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2323  flagellar basal body rod protein FlgC  40 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2046  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.69 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1999  flagellar basal body rod protein FlgC  40 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2424  flagellar basal body rod protein FlgC  40 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27738  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2934  flagellar basal body rod protein FlgC  39.26 
 
 		 141 aa  87  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.725751 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>