More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4197 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_4197  flagellar basal body rod protein FlgC  100 
 
 
130 aa  266  7e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2964  flagellar basal body rod protein FlgC  68.46 
 
 
130 aa  186  9e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.796607  normal  0.243642 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1330  flagellar basal body rod protein FlgC  63.85 
 
 
128 aa  165  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2991  flagellar basal body rod protein FlgC  63.85 
 
 
126 aa  165  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2111  flagellar basal body rod protein FlgC  60.77 
 
 
130 aa  164  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2601  flagellar basal body rod protein FlgC  64.62 
 
 
126 aa  159  9e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.773402  hitchhiker  0.000553357 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3248  flagellar basal body rod protein FlgC  57.25 
 
 
130 aa  140  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.893989  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0152  flagellar basal body rod protein FlgC  48.15 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4211  flagellar basal body rod protein FlgC  47.41 
 
 
140 aa  106  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0136  flagellar basal body rod protein FlgC  47.41 
 
 
140 aa  105  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.06608  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0256  flagellar basal body rod protein FlgC  48.57 
 
 
139 aa  101  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0318  flagellar basal body rod protein FlgC  45.65 
 
 
138 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.783853  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1095  flagellar basal body rod protein FlgC  41.54 
 
 
139 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0297  flagellar basal body rod protein FlgC  41.91 
 
 
139 aa  100  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0350  flagellar basal body rod protein FlgC  43.38 
 
 
138 aa  98.2  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.121375 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2825  flagellar basal body rod protein FlgC  38.24 
 
 
137 aa  96.7  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0737  flagellar basal body rod protein FlgC  42.11 
 
 
145 aa  96.3  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0025  flagellar basal body rod protein FlgC  45.38 
 
 
140 aa  96.3  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1937  flagellar basal body rod protein FlgC  40.15 
 
 
137 aa  96.7  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.123234  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2571  flagellar basal body rod protein FlgC  40.74 
 
 
139 aa  95.5  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5496  flagellar basal body rod protein FlgC  40.15 
 
 
141 aa  95.5  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839426  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5154  flagellar basal body rod protein FlgC  41.91 
 
 
136 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205426  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0597  flagellar basal body rod protein FlgC  40.94 
 
 
138 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3776  flagellar basal body rod protein FlgC  39.55 
 
 
141 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0600625  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1518  flagellar basal body rod protein FlgC  40.44 
 
 
141 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0198818  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3655  flagellar basal body rod protein FlgC  40 
 
 
138 aa  92.8  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.633505  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5537  flagellar basal body rod protein FlgC  41.18 
 
 
136 aa  92  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132652  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1691  flagellar basal body rod protein FlgC  40.94 
 
 
138 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.132509  normal  0.0178 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4410  flagellar basal body rod protein FlgC  38.81 
 
 
141 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.541352  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1694  flagellar basal body rod protein FlgC  38.81 
 
 
141 aa  92  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1393  flagellar basal body rod protein FlgC  39.71 
 
 
141 aa  92  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0993913  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2637  flagellar basal body rod protein FlgC  42.65 
 
 
136 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.296466  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3674  flagellar basal body rod protein FlgC  40.94 
 
 
138 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00523112 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3438  flagellar basal body rod protein FlgC  36.57 
 
 
135 aa  89.4  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1133  flagellar basal body rod protein FlgC  38.97 
 
 
141 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.886301  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1143  flagellar basal body rod protein FlgC  38.58 
 
 
137 aa  85.9  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2830  flagellar basal body rod protein FlgC  39.55 
 
 
136 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.172073  normal  0.232346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2607  flagellar basal body rod protein FlgC  39.55 
 
 
136 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122012  normal  0.267532 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2234  flagellar basal body rod protein FlgC  38.41 
 
 
135 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0619  flagellar basal body rod protein FlgC  40.94 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.017127  normal  0.0984024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0630  flagellar basal body rod protein FlgC  40.94 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.652584  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2133  flagellar basal body rod protein FlgC  38.1 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1125  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.07 
 
 
137 aa  77.4  0.00000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1367  flagellar basal body rod protein FlgC  33.85 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2175  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.34 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.869204  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  32.79 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.79 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2054  flagellar basal body rod protein FlgC  32.79 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.224564 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2526  flagellar basal body rod protein FlgC  32.79 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310597  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  32.79 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  32.79 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  32.79 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1588  flagellar basal body rod protein FlgC  32.79 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  32.79 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1109  flagellar basal body rod protein FlgC  34.56 
 
 
150 aa  72  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151882  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  32.79 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2053  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.07 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1272  flagellar basal body rod protein FlgC  31.15 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0147313 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4198  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.71 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1322  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.13 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2013  flagellar basal body rod protein FlgC  31.15 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2197  flagellar basal body rod protein FlgC  31.15 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000907371 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1287  flagellar basal body rod protein FlgC  31.15 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158589  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1243  flagellar basal body rod protein FlgC  31.15 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0426  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.15 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.651344  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1418  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.58 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1464  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.58 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0068  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.09 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2719  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.04 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.78537  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1715  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.87 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000651347  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2410  flagellar basal-body rod protein FlgC  29.55 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1554  flagellar basal body rod protein FlgC  31.4 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  32.23 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2597  flagellar basal body rod protein FlgC  32.23 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2969  flagellar basal body rod protein FlgC  32.23 
 
 
134 aa  65.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134298  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1695  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.61 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0947147  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1389  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.41 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.88372 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0463  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.88 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1685  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.39 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149162  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3650  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.58 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0267  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.08 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0036  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.1 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584577  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3424  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.29 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1473  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.52 
 
 
136 aa  63.5  0.0000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0170  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.54 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2733  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.43 
 
 
136 aa  62.8  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108424 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1636  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.9 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0241  flagellar basal body rod protein FlgC  33.33 
 
 
141 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24010  flagellar basal-body rod protein  35.25 
 
 
135 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2317  flagellar basal body rod protein FlgC  34.4 
 
 
137 aa  63.5  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.870376  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0640  flagellar basal body rod protein FlgC  30 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0267  flagellar basal body rod protein FlgC  33.33 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191189  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3326  flagellar basal body rod protein FlgC  33.33 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0463  flagellar basal body rod protein FlgC  33.33 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3353  flagellar basal body rod protein FlgC  33.33 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0279  flagellar basal body rod protein FlgC  33.33 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3099  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.54 
 
 
140 aa  62.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329796  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2949  flagellar basal body rod protein FlgC  34.09 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.741203  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2995  flagellar basal body rod protein FlgC  33.33 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2098  flagellar basal body rod protein FlgC  33.33 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>