270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0170 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0170  flagellar basal-body rod protein FlgC  100 
 
 
136 aa  281  2.0000000000000002e-75  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2053  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.17 
 
 
147 aa  115  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16910  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.88 
 
 
145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1125  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.6 
 
 
137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1644  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.96 
 
 
136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000317866  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3114  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.55 
 
 
147 aa  106  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1695  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.46 
 
 
147 aa  105  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0947147  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1418  flagellar basal-body rod protein FlgC  40 
 
 
140 aa  104  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1464  flagellar basal-body rod protein FlgC  40 
 
 
140 aa  104  4e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3424  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.34 
 
 
145 aa  104  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0408  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.96 
 
 
146 aa  103  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3306  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.72 
 
 
145 aa  103  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1389  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.04 
 
 
146 aa  102  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.88372 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4215  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.36 
 
 
146 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0267  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.35 
 
 
141 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3924  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.84 
 
 
145 aa  101  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0670476 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3840  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.13 
 
 
145 aa  101  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2719  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.58 
 
 
150 aa  101  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.78537  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0769  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.88 
 
 
145 aa  100  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197549 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0705  flagellar basal body rod protein FlgC  39.87 
 
 
164 aa  100  5e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0057  flagellar basal body rod protein FlgC  37.82 
 
 
166 aa  100  7e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.223353  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0631  flagellar basal body rod protein FlgC  38.96 
 
 
164 aa  100  9e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.662451  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1715  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.48 
 
 
138 aa  99.4  1e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000651347  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1194  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.34 
 
 
143 aa  99.4  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0036  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.43 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584577  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0552  flagellar basal body rod protein FlgC  38.96 
 
 
164 aa  99.4  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0750  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.79 
 
 
137 aa  99  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1685  flagellar basal-body rod protein FlgC  40 
 
 
140 aa  99  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149162  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1066  flagellar basal body rod protein FlgC  38.31 
 
 
164 aa  99  2e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0463  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.97 
 
 
147 aa  99  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1403  flagellar basal body rod protein FlgC  38.31 
 
 
164 aa  98.2  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.144667  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0847  flagellar basal body rod protein  36.73 
 
 
155 aa  98.2  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1322  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.74 
 
 
139 aa  97.4  5e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0692  flagellar basal body rod protein FlgC  39.1 
 
 
167 aa  97.4  6e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0654  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.81 
 
 
142 aa  97.4  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.294463  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4198  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.75 
 
 
138 aa  97.1  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2923  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.35 
 
 
134 aa  96.7  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2557  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.24 
 
 
140 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0110618  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1673  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.34 
 
 
163 aa  95.5  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1473  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.59 
 
 
136 aa  95.9  2e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0364  flagellar basal body rod protein FlgC  36.25 
 
 
164 aa  95.9  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1396  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.24 
 
 
140 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00396064  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1999  flagellar basal body rod protein FlgC  39.85 
 
 
134 aa  94.7  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2323  flagellar basal body rod protein FlgC  39.85 
 
 
134 aa  94.7  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2424  flagellar basal body rod protein FlgC  39.85 
 
 
134 aa  94.7  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27738  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2461  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.24 
 
 
140 aa  94.7  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0105073  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1304  flagellar basal body rod protein FlgC  41.48 
 
 
138 aa  94.7  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1775  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.35 
 
 
133 aa  94.4  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1575  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.24 
 
 
145 aa  94  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1636  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.7 
 
 
134 aa  93.6  9e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3326  flagellar basal body rod protein FlgC  40.88 
 
 
141 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0463  flagellar basal body rod protein FlgC  40.88 
 
 
141 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3353  flagellar basal body rod protein FlgC  40.88 
 
 
141 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0279  flagellar basal body rod protein FlgC  40.88 
 
 
141 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1218  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.76 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.181311  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2175  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.24 
 
 
145 aa  92.8  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.869204  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2046  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.12 
 
 
137 aa  92.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2995  flagellar basal body rod protein FlgC  40.88 
 
 
141 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2098  flagellar basal body rod protein FlgC  40.88 
 
 
141 aa  92.8  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0267  flagellar basal body rod protein FlgC  40.88 
 
 
141 aa  92.8  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191189  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  37.12 
 
 
134 aa  92  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.12 
 
 
134 aa  92  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  37.12 
 
 
134 aa  92  3e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2054  flagellar basal body rod protein FlgC  37.12 
 
 
134 aa  92  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.224564 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2526  flagellar basal body rod protein FlgC  37.12 
 
 
134 aa  92  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310597  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  37.12 
 
 
134 aa  92  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  37.12 
 
 
134 aa  92  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1109  flagellar basal body rod protein FlgC  36.11 
 
 
150 aa  91.7  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151882  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  37.12 
 
 
134 aa  92  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  37.12 
 
 
134 aa  92  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  37.88 
 
 
134 aa  91.3  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1287  flagellar basal body rod protein FlgC  37.59 
 
 
134 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158589  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0241  flagellar basal body rod protein FlgC  40.15 
 
 
141 aa  91.3  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1243  flagellar basal body rod protein FlgC  37.59 
 
 
134 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2410  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.03 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1272  flagellar basal body rod protein FlgC  37.59 
 
 
134 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0147313 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2013  flagellar basal body rod protein FlgC  37.59 
 
 
134 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2197  flagellar basal body rod protein FlgC  37.59 
 
 
134 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000907371 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2597  flagellar basal body rod protein FlgC  37.88 
 
 
134 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2001  flagellar basal body rod protein FlgC  37.06 
 
 
150 aa  90.9  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06154  flagellar basal body rod protein FlgC  39.37 
 
 
135 aa  90.5  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000293747  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01012  flagellar basal body rod protein FlgC  39.37 
 
 
135 aa  90.5  7e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.392549  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0632  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.84 
 
 
134 aa  90.1  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0720  flagellar basal body rod protein FlgC  40.94 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1955  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.19 
 
 
135 aa  89.7  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2969  flagellar basal body rod protein FlgC  36.84 
 
 
134 aa  89.7  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134298  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2317  flagellar basal body rod protein FlgC  38.06 
 
 
137 aa  89.7  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.870376  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2133  flagellar basal body rod protein FlgC  40.16 
 
 
134 aa  89.7  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0226  flagellar basal body rod protein FlgC  40.94 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.893505 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01287  flagellar basal body rod protein FlgC  37.59 
 
 
137 aa  89.4  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1554  flagellar basal body rod protein FlgC  37.88 
 
 
134 aa  89  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1588  flagellar basal body rod protein FlgC  36.84 
 
 
134 aa  88.6  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4421  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.06 
 
 
134 aa  89.4  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3713  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.23 
 
 
135 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.889388  normal  0.277072 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0343  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.23 
 
 
135 aa  88.6  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.962617 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1339  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.92 
 
 
139 aa  88.6  3e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00198862  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4790  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.23 
 
 
135 aa  88.6  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004172  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.84 
 
 
137 aa  88.2  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1598  flagellar basal body rod protein FlgC  38.24 
 
 
139 aa  88.2  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1162  flagellar basal body rod protein FlgC  40 
 
 
138 aa  88.6  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.509908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>