More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01287 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01287  flagellar basal body rod protein FlgC  100 
 
 		 137 aa  281  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004172  flagellar basal-body rod protein FlgC  97.81 
 
 		 137 aa  276  6e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1791  flagellar basal body rod protein FlgC  87.68 
 
 		 138 aa  243  6.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2337  flagellar basal body rod protein FlgC  82.61 
 
 		 138 aa  233  9e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2317  flagellar basal body rod protein FlgC  69.34 
 
 		 137 aa  199  7e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.870376  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1346  flagellar basal body rod protein FlgC  70.8 
 
 		 139 aa  197  3.9999999999999996e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1478  flagellar basal-body rod protein FlgC  68.31 
 
 		 143 aa  193  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1162  flagellar basal body rod protein FlgC  68.12 
 
 		 138 aa  192  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.509908  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1341  flagellar basal body rod protein FlgC  65.22 
 
 		 138 aa  188  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3086  flagellar basal body rod protein FlgC  63.77 
 
 		 138 aa  186  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1304  flagellar basal body rod protein FlgC  64.49 
 
 		 138 aa  184  4e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1598  flagellar basal body rod protein FlgC  63.77 
 
 		 139 aa  183  5e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2596  flagellar basal body rod protein FlgC  64.49 
 
 		 138 aa  183  7e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2946  flagellar basal body rod protein FlgC  64.49 
 
 		 138 aa  180  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3099  flagellar basal body rod protein FlgC  63.77 
 
 		 138 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1260  flagellar basal body rod protein FlgC  63.77 
 
 		 138 aa  179  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1330  flagellar basal body rod protein FlgC  63.77 
 
 		 138 aa  179  1e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1322  flagellar basal body rod protein FlgC  63.77 
 
 		 138 aa  179  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0795532 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2961  flagellar basal body rod protein FlgC  63.77 
 
 		 138 aa  179  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.211432  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3249  flagellar basal body rod protein FlgC  63.04 
 
 		 138 aa  177  2.9999999999999997e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1417  flagellar basal body rod protein FlgC  63.04 
 
 		 138 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3099  flagellar basal-body rod protein FlgC  60.87 
 
 		 140 aa  175  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329796  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2377  flagellar basal-body rod protein FlgC  60.28 
 
 		 137 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1218  flagellar basal-body rod protein FlgC  55.56 
 
 		 139 aa  166  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.181311  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02927  flagellar basal-body rod protein FlgC  61.6 
 
 		 127 aa  161  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.133491  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3582  flagellar basal-body rod protein FlgC  52.03 
 
 		 151 aa  159  9e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.122416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2212  flagellar basal body rod protein FlgC  53.47 
 
 		 144 aa  159  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2849  flagellar basal body rod protein FlgC  53.38 
 
 		 147 aa  157  6e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1473  flagellar basal-body rod protein FlgC  54.01 
 
 		 136 aa  156  8e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3951  flagellar basal body rod protein FlgC  51.7 
 
 		 147 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1955  flagellar basal-body rod protein FlgC  56.93 
 
 		 135 aa  152  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3731  flagellar basal body rod protein FlgC  51.02 
 
 		 147 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1465  flagellar basal body rod protein FlgC  51.68 
 
 		 147 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4390  flagellar basal body rod protein FlgC  51.68 
 
 		 147 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0794673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1775  flagellar basal-body rod protein FlgC  54.74 
 
 		 133 aa  150  7e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1934  flagellar basal-body rod protein FlgC  50 
 
 		 146 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3480  flagellar basal body rod protein FlgC  50 
 
 		 146 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.485481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4250  flagellar basal body rod protein FlgC  48.98 
 
 		 147 aa  146  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24010  flagellar basal-body rod protein  51.45 
 
 		 135 aa  146  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4299  flagellar basal body rod protein FlgC  50.68 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50470  flagellar basal body rod protein FlgC  50.68 
 
 		 146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0177426 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1103  flagellar basal body rod protein FlgC  50.34 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0750  flagellar basal-body rod protein FlgC  55.8 
 
 		 137 aa  144  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0927  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.89 
 
 		 139 aa  143  6e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0894  flagellar basal-body rod protein FlgC  48 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2923  flagellar basal-body rod protein FlgC  51.09 
 
 		 134 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1322  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.61 
 
 		 139 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5626  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.91 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3101  flagellar basal-body rod protein FlgC  50 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.653799  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3828  flagellar basal-body rod protein FlgC  50 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.368958 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4421  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.91 
 
 		 134 aa  130  7.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3072  flagellar basal body rod protein  47.83 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.103316 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2597  flagellar basal body rod protein FlgC  46.72 
 
 		 134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2733  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.18 
 
 		 136 aa  127  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108424 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  45.99 
 
 		 134 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2949  flagellar basal body rod protein FlgC  45.65 
 
 		 141 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.741203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3735  flagellar basal body rod protein FlgC  45.99 
 
 		 135 aa  127  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  46.72 
 
 		 134 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.72 
 
 		 134 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  46.72 
 
 		 134 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  46.72 
 
 		 134 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4198  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.27 
 
 		 138 aa  127  7.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2526  flagellar basal body rod protein FlgC  46.72 
 
 		 134 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310597  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1554  flagellar basal body rod protein FlgC  47.45 
 
 		 134 aa  127  7.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  46.72 
 
 		 134 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  46.72 
 
 		 134 aa  127  7.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  46.72 
 
 		 134 aa  127  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2969  flagellar basal body rod protein FlgC  46.72 
 
 		 134 aa  125  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2054  flagellar basal body rod protein FlgC  45.99 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.224564 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0241  flagellar basal body rod protein FlgC  44.93 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1588  flagellar basal body rod protein FlgC  45.99 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0632  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.99 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1636  flagellar basal-body rod protein FlgC  52.03 
 
 		 134 aa  125  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3715  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.59 
 
 		 134 aa  125  3e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1287  flagellar basal body rod protein FlgC  45.99 
 
 		 134 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158589  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2197  flagellar basal body rod protein FlgC  45.99 
 
 		 134 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000907371 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1272  flagellar basal body rod protein FlgC  45.99 
 
 		 134 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0147313 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1243  flagellar basal body rod protein FlgC  45.99 
 
 		 134 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2013  flagellar basal body rod protein FlgC  45.99 
 
 		 134 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0568  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.53 
 
 		 134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1999  flagellar basal body rod protein FlgC  45.99 
 
 		 134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0519  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.51 
 
 		 189 aa  124  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.6169  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2323  flagellar basal body rod protein FlgC  45.99 
 
 		 134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2424  flagellar basal body rod protein FlgC  45.99 
 
 		 134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27738  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2995  flagellar basal body rod protein FlgC  44.93 
 
 		 141 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3326  flagellar basal body rod protein FlgC  44.93 
 
 		 141 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2098  flagellar basal body rod protein FlgC  44.93 
 
 		 141 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0463  flagellar basal body rod protein FlgC  44.93 
 
 		 141 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3353  flagellar basal body rod protein FlgC  44.93 
 
 		 141 aa  124  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0279  flagellar basal body rod protein FlgC  44.93 
 
 		 141 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0267  flagellar basal body rod protein FlgC  44.93 
 
 		 141 aa  124  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191189  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3019  flagellar basal body rod protein FlgC  43.48 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1225  flagellar basal body rod protein FlgC  42.14 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0226  flagellar basal body rod protein FlgC  44.68 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.893505 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0720  flagellar basal body rod protein FlgC  44.68 
 
 		 141 aa  121  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1225  flagellar basal body rod protein FlgC  41.43 
 
 		 140 aa  120  6e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0238  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.38 
 
 		 138 aa  120  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6370  flagellar basal body rod protein FlgC  42.75 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0640  flagellar basal body rod protein FlgC  43.97 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0185  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.65 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>