More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1934 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1934  flagellar basal-body rod protein FlgC  100 
 
 		 146 aa  300  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3480  flagellar basal body rod protein FlgC  100 
 
 		 146 aa  300  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.485481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3731  flagellar basal body rod protein FlgC  85.03 
 
 		 147 aa  257  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3951  flagellar basal body rod protein FlgC  84.35 
 
 		 147 aa  256  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1465  flagellar basal body rod protein FlgC  83.67 
 
 		 147 aa  254  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4390  flagellar basal body rod protein FlgC  82.99 
 
 		 147 aa  252  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0794673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4250  flagellar basal body rod protein FlgC  84.35 
 
 		 147 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4299  flagellar basal body rod protein FlgC  78.77 
 
 		 146 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50470  flagellar basal body rod protein FlgC  78.77 
 
 		 146 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0177426 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2849  flagellar basal body rod protein FlgC  76.19 
 
 		 147 aa  229  8.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1103  flagellar basal body rod protein FlgC  64.9 
 
 		 149 aa  197  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3582  flagellar basal-body rod protein FlgC  63.51 
 
 		 151 aa  192  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.122416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2212  flagellar basal body rod protein FlgC  64 
 
 		 144 aa  186  8e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1478  flagellar basal-body rod protein FlgC  60.67 
 
 		 143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2596  flagellar basal body rod protein FlgC  56.16 
 
 		 138 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2317  flagellar basal body rod protein FlgC  55.48 
 
 		 137 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.870376  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1162  flagellar basal body rod protein FlgC  56.16 
 
 		 138 aa  167  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.509908  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1346  flagellar basal body rod protein FlgC  55.86 
 
 		 139 aa  167  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3086  flagellar basal body rod protein FlgC  54.79 
 
 		 138 aa  167  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3099  flagellar basal-body rod protein FlgC  56.85 
 
 		 140 aa  166  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329796  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1598  flagellar basal body rod protein FlgC  56.16 
 
 		 139 aa  166  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1341  flagellar basal body rod protein FlgC  55.48 
 
 		 138 aa  165  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2377  flagellar basal-body rod protein FlgC  54.79 
 
 		 137 aa  164  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1304  flagellar basal body rod protein FlgC  52.74 
 
 		 138 aa  164  5e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1322  flagellar basal body rod protein FlgC  56.85 
 
 		 138 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0795532 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2946  flagellar basal body rod protein FlgC  56.85 
 
 		 138 aa  163  8e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3099  flagellar basal body rod protein FlgC  56.16 
 
 		 138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1260  flagellar basal body rod protein FlgC  56.16 
 
 		 138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1330  flagellar basal body rod protein FlgC  56.16 
 
 		 138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2961  flagellar basal body rod protein FlgC  56.16 
 
 		 138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.211432  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1417  flagellar basal body rod protein FlgC  56.16 
 
 		 138 aa  161  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3249  flagellar basal body rod protein FlgC  56.16 
 
 		 138 aa  161  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1955  flagellar basal-body rod protein FlgC  55.48 
 
 		 135 aa  152  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0074  flagellar basal-body rod protein FlgC  53.1 
 
 		 139 aa  152  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02927  flagellar basal-body rod protein FlgC  54.89 
 
 		 127 aa  152  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.133491  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2337  flagellar basal body rod protein FlgC  52.74 
 
 		 138 aa  152  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3650  flagellar basal-body rod protein FlgC  53.1 
 
 		 139 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0750  flagellar basal-body rod protein FlgC  51.37 
 
 		 137 aa  150  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0640  flagellar basal body rod protein FlgC  52.05 
 
 		 141 aa  150  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004172  flagellar basal-body rod protein FlgC  50 
 
 		 137 aa  150  8e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01287  flagellar basal body rod protein FlgC  50 
 
 		 137 aa  149  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1322  flagellar basal-body rod protein FlgC  51.35 
 
 		 139 aa  147  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4198  flagellar basal-body rod protein FlgC  51.41 
 
 		 138 aa  147  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3970  flagellar basal-body rod protein FlgC  50.34 
 
 		 138 aa  146  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04910  flagellar basal body rod protein FlgC  48.63 
 
 		 144 aa  145  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2923  flagellar basal-body rod protein FlgC  51.37 
 
 		 134 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0226  flagellar basal body rod protein FlgC  50.68 
 
 		 141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.893505 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0720  flagellar basal body rod protein FlgC  50.68 
 
 		 141 aa  146  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3326  flagellar basal body rod protein FlgC  50 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3072  flagellar basal body rod protein  51.35 
 
 		 138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.103316 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2098  flagellar basal body rod protein FlgC  50 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0279  flagellar basal body rod protein FlgC  50 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0463  flagellar basal body rod protein FlgC  50 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0267  flagellar basal body rod protein FlgC  50 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191189  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3353  flagellar basal body rod protein FlgC  50 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0894  flagellar basal-body rod protein FlgC  51.33 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2995  flagellar basal body rod protein FlgC  50 
 
 		 141 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3467  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.97 
 
 		 138 aa  144  3e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2949  flagellar basal body rod protein FlgC  50.69 
 
 		 141 aa  144  5e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.741203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1473  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.21 
 
 		 136 aa  144  5e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0241  flagellar basal body rod protein FlgC  50 
 
 		 141 aa  144  6e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0068  flagellar basal-body rod protein FlgC  49.66 
 
 		 139 aa  142  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1218  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.22 
 
 		 139 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.181311  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24010  flagellar basal-body rod protein  47.95 
 
 		 135 aa  141  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0185  flagellar basal-body rod protein FlgC  49.66 
 
 		 138 aa  141  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1791  flagellar basal body rod protein FlgC  48.63 
 
 		 138 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0238  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.98 
 
 		 138 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1775  flagellar basal-body rod protein FlgC  49.32 
 
 		 133 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1225  flagellar basal body rod protein FlgC  47.95 
 
 		 140 aa  139  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5626  flagellar basal-body rod protein FlgC  50 
 
 		 135 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0927  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.83 
 
 		 139 aa  138  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2733  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.95 
 
 		 136 aa  138  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108424 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1225  flagellar basal body rod protein FlgC  47.26 
 
 		 140 aa  137  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3370  flagellar basal body rod protein FlgC  48.63 
 
 		 143 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0264  flagellar basal body rod protein FlgC  48.63 
 
 		 143 aa  137  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.998059 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0519  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.27 
 
 		 189 aa  137  6e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.6169  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2934  flagellar basal body rod protein FlgC  47.92 
 
 		 141 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.725751 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3069  flagellar basal body rod protein FlgC  47.92 
 
 		 141 aa  136  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2323  flagellar basal body rod protein FlgC  49.32 
 
 		 134 aa  135  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1999  flagellar basal body rod protein FlgC  49.32 
 
 		 134 aa  135  1e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2424  flagellar basal body rod protein FlgC  49.32 
 
 		 134 aa  135  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27738  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2597  flagellar basal body rod protein FlgC  50 
 
 		 134 aa  135  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3043  flagellar basal body rod protein FlgC  47.22 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6370  flagellar basal body rod protein FlgC  47.22 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  50 
 
 		 134 aa  135  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3735  flagellar basal body rod protein FlgC  47.95 
 
 		 135 aa  135  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3019  flagellar basal body rod protein FlgC  47.92 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2410  flagellar basal body rod protein FlgC  47.22 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642225  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3024  flagellar basal body rod protein FlgC  47.22 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0826465  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2969  flagellar basal body rod protein FlgC  49.32 
 
 		 134 aa  135  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1554  flagellar basal body rod protein FlgC  48.63 
 
 		 134 aa  135  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000739  flagellar basal-body rod protein FlgC  49.62 
 
 		 131 aa  134  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1272  flagellar basal body rod protein FlgC  48.63 
 
 		 134 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0147313 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1287  flagellar basal body rod protein FlgC  48.63 
 
 		 134 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158589  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1243  flagellar basal body rod protein FlgC  48.63 
 
 		 134 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2013  flagellar basal body rod protein FlgC  48.63 
 
 		 134 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2197  flagellar basal body rod protein FlgC  48.63 
 
 		 134 aa  134  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000907371 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1526  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.58 
 
 		 134 aa  133  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4672  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.63 
 
 		 132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0133607 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1588  flagellar basal body rod protein FlgC  47.95 
 
 		 134 aa  130  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>