More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1225 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl1225  flagellar basal body rod protein FlgC  100 
 
 
140 aa  290  4e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1225  flagellar basal body rod protein FlgC  98.57 
 
 
140 aa  287  3e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2212  flagellar basal body rod protein FlgC  50.34 
 
 
144 aa  150  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1103  flagellar basal body rod protein FlgC  50 
 
 
149 aa  147  6e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1218  flagellar basal-body rod protein FlgC  49.63 
 
 
139 aa  139  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.181311  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1934  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.95 
 
 
146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3480  flagellar basal body rod protein FlgC  47.95 
 
 
146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.485481  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3086  flagellar basal body rod protein FlgC  46.43 
 
 
138 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1775  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.43 
 
 
133 aa  135  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1346  flagellar basal body rod protein FlgC  46.04 
 
 
139 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2596  flagellar basal body rod protein FlgC  45 
 
 
138 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2317  flagellar basal body rod protein FlgC  45 
 
 
137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.870376  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3582  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.59 
 
 
151 aa  134  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.122416  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2946  flagellar basal body rod protein FlgC  45.71 
 
 
138 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2377  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.43 
 
 
137 aa  133  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3951  flagellar basal body rod protein FlgC  45.95 
 
 
147 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3731  flagellar basal body rod protein FlgC  45.95 
 
 
147 aa  133  8e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321201  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1465  flagellar basal body rod protein FlgC  44.22 
 
 
147 aa  133  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1473  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.14 
 
 
136 aa  133  8e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4390  flagellar basal body rod protein FlgC  44.22 
 
 
147 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0794673  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1162  flagellar basal body rod protein FlgC  45 
 
 
138 aa  133  9e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.509908  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1598  flagellar basal body rod protein FlgC  45.71 
 
 
139 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2961  flagellar basal body rod protein FlgC  45 
 
 
138 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.211432  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3099  flagellar basal body rod protein FlgC  45 
 
 
138 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0927  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.41 
 
 
139 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1260  flagellar basal body rod protein FlgC  45 
 
 
138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1330  flagellar basal body rod protein FlgC  45 
 
 
138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1417  flagellar basal body rod protein FlgC  45 
 
 
138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1478  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.07 
 
 
143 aa  131  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1341  flagellar basal body rod protein FlgC  44.29 
 
 
138 aa  130  6e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50470  flagellar basal body rod protein FlgC  44.52 
 
 
146 aa  130  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0177426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4299  flagellar basal body rod protein FlgC  44.52 
 
 
146 aa  130  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2849  flagellar basal body rod protein FlgC  42.86 
 
 
147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1304  flagellar basal body rod protein FlgC  43.26 
 
 
138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1322  flagellar basal body rod protein FlgC  44.29 
 
 
138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0795532 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0894  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.33 
 
 
151 aa  129  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3249  flagellar basal body rod protein FlgC  43.57 
 
 
138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4250  flagellar basal body rod protein FlgC  44.22 
 
 
147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02927  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.44 
 
 
127 aa  125  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.133491  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3099  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.86 
 
 
140 aa  124  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329796  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3101  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.57 
 
 
134 aa  123  9e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.653799  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3828  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.57 
 
 
134 aa  123  9e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.368958 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0632  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.86 
 
 
134 aa  122  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2733  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.52 
 
 
136 aa  122  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108424 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004172  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.14 
 
 
137 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01287  flagellar basal body rod protein FlgC  42.14 
 
 
137 aa  122  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4421  flagellar basal-body rod protein FlgC  45 
 
 
134 aa  121  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0074  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.45 
 
 
139 aa  120  8e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1791  flagellar basal body rod protein FlgC  41.43 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2337  flagellar basal body rod protein FlgC  41.43 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1905  flagellar basal body rod protein FlgC  42.14 
 
 
135 aa  117  6e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.127075 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0568  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.43 
 
 
134 aa  114  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1526  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.57 
 
 
134 aa  114  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3072  flagellar basal body rod protein  43.97 
 
 
138 aa  114  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.103316 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01012  flagellar basal body rod protein FlgC  40.71 
 
 
135 aa  113  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.392549  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06154  flagellar basal body rod protein FlgC  40.71 
 
 
135 aa  113  6.9999999999999995e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000293747  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3467  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.85 
 
 
138 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0750  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.97 
 
 
137 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1977  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.14 
 
 
135 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2969  flagellar basal body rod protein FlgC  45 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134298  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3970  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.85 
 
 
138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0241  flagellar basal body rod protein FlgC  41.73 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1955  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.86 
 
 
135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0267  flagellar basal body rod protein FlgC  41.73 
 
 
141 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191189  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3326  flagellar basal body rod protein FlgC  41.73 
 
 
141 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3353  flagellar basal body rod protein FlgC  41.73 
 
 
141 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0279  flagellar basal body rod protein FlgC  41.73 
 
 
141 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0463  flagellar basal body rod protein FlgC  41.73 
 
 
141 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2098  flagellar basal body rod protein FlgC  41.73 
 
 
141 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2995  flagellar basal body rod protein FlgC  41.73 
 
 
141 aa  111  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1270  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.91 
 
 
134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261409  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1272  flagellar basal body rod protein FlgC  44.29 
 
 
134 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0147313 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1243  flagellar basal body rod protein FlgC  44.29 
 
 
134 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0640  flagellar basal body rod protein FlgC  41.84 
 
 
141 aa  110  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1287  flagellar basal body rod protein FlgC  44.29 
 
 
134 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158589  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4198  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.7 
 
 
138 aa  110  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2013  flagellar basal body rod protein FlgC  44.29 
 
 
134 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2197  flagellar basal body rod protein FlgC  44.29 
 
 
134 aa  110  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000907371 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04910  flagellar basal body rod protein FlgC  38.03 
 
 
144 aa  110  6e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0068  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.73 
 
 
139 aa  110  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0226  flagellar basal body rod protein FlgC  42.96 
 
 
141 aa  110  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.893505 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0519  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.51 
 
 
189 aa  110  6e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.6169  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0720  flagellar basal body rod protein FlgC  42.96 
 
 
141 aa  110  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4790  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.13 
 
 
135 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3713  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.13 
 
 
135 aa  110  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.889388  normal  0.277072 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1588  flagellar basal body rod protein FlgC  43.57 
 
 
134 aa  110  8.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3650  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.01 
 
 
139 aa  110  9e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  44.29 
 
 
134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.29 
 
 
134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  44.29 
 
 
134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  44.29 
 
 
134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  44.29 
 
 
134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2526  flagellar basal body rod protein FlgC  44.29 
 
 
134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310597  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  44.29 
 
 
134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2054  flagellar basal body rod protein FlgC  44.29 
 
 
134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.224564 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  44.29 
 
 
134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2949  flagellar basal body rod protein FlgC  42.45 
 
 
141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.741203  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1322  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.43 
 
 
139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0207  flagellar basal body rod protein FlgC  40.43 
 
 
142 aa  108  3e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.662374 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2424  flagellar basal body rod protein FlgC  45.39 
 
 
134 aa  108  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>