More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1260 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1260  flagellar basal body rod protein FlgC  100 
 
 		 138 aa  282  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1330  flagellar basal body rod protein FlgC  100 
 
 		 138 aa  282  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3099  flagellar basal body rod protein FlgC  99.28 
 
 		 138 aa  281  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2961  flagellar basal body rod protein FlgC  99.28 
 
 		 138 aa  281  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.211432  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2946  flagellar basal body rod protein FlgC  98.55 
 
 		 138 aa  280  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1417  flagellar basal body rod protein FlgC  98.55 
 
 		 138 aa  280  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2596  flagellar basal body rod protein FlgC  97.83 
 
 		 138 aa  278  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1322  flagellar basal body rod protein FlgC  97.1 
 
 		 138 aa  259  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0795532 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3249  flagellar basal body rod protein FlgC  97.1 
 
 		 138 aa  257  3e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1162  flagellar basal body rod protein FlgC  88.41 
 
 		 138 aa  255  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.509908  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3086  flagellar basal body rod protein FlgC  88.41 
 
 		 138 aa  252  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2317  flagellar basal body rod protein FlgC  86.96 
 
 		 137 aa  248  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.870376  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1346  flagellar basal body rod protein FlgC  86.13 
 
 		 139 aa  247  4e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1304  flagellar basal body rod protein FlgC  83.33 
 
 		 138 aa  246  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1341  flagellar basal body rod protein FlgC  85.51 
 
 		 138 aa  244  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1598  flagellar basal body rod protein FlgC  89.13 
 
 		 139 aa  242  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1478  flagellar basal-body rod protein FlgC  71.13 
 
 		 143 aa  200  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2337  flagellar basal body rod protein FlgC  69.57 
 
 		 138 aa  198  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3099  flagellar basal-body rod protein FlgC  63.04 
 
 		 140 aa  191  3e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329796  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1791  flagellar basal body rod protein FlgC  64.49 
 
 		 138 aa  188  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004172  flagellar basal-body rod protein FlgC  64.49 
 
 		 137 aa  183  6e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01287  flagellar basal body rod protein FlgC  63.77 
 
 		 137 aa  181  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2849  flagellar basal body rod protein FlgC  57.14 
 
 		 147 aa  177  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3951  flagellar basal body rod protein FlgC  57.14 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1465  flagellar basal body rod protein FlgC  57.14 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4390  flagellar basal body rod protein FlgC  56.46 
 
 		 147 aa  174  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0794673  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1934  flagellar basal-body rod protein FlgC  56.85 
 
 		 146 aa  173  9e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3480  flagellar basal body rod protein FlgC  56.85 
 
 		 146 aa  173  9e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.485481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3731  flagellar basal body rod protein FlgC  55.78 
 
 		 147 aa  173  9e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2377  flagellar basal-body rod protein FlgC  58.7 
 
 		 137 aa  172  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4299  flagellar basal body rod protein FlgC  56.16 
 
 		 146 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50470  flagellar basal body rod protein FlgC  56.16 
 
 		 146 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0177426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4250  flagellar basal body rod protein FlgC  56.46 
 
 		 147 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2212  flagellar basal body rod protein FlgC  57.64 
 
 		 144 aa  168  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1103  flagellar basal body rod protein FlgC  56.76 
 
 		 149 aa  164  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02927  flagellar basal-body rod protein FlgC  60 
 
 		 127 aa  162  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.133491  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3582  flagellar basal-body rod protein FlgC  53.38 
 
 		 151 aa  160  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.122416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1473  flagellar basal-body rod protein FlgC  53.62 
 
 		 136 aa  159  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1955  flagellar basal-body rod protein FlgC  54.35 
 
 		 135 aa  149  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1218  flagellar basal-body rod protein FlgC  50.36 
 
 		 139 aa  142  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.181311  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0894  flagellar basal-body rod protein FlgC  49.33 
 
 		 151 aa  143  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0750  flagellar basal-body rod protein FlgC  53.96 
 
 		 137 aa  139  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1775  flagellar basal-body rod protein FlgC  49.28 
 
 		 133 aa  138  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0927  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.06 
 
 		 139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24010  flagellar basal-body rod protein  49.28 
 
 		 135 aa  137  6e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1322  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.92 
 
 		 139 aa  137  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1225  flagellar basal body rod protein FlgC  45 
 
 		 140 aa  134  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3735  flagellar basal body rod protein FlgC  50.72 
 
 		 135 aa  133  7.000000000000001e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06154  flagellar basal body rod protein FlgC  48.92 
 
 		 135 aa  133  8e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000293747  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01012  flagellar basal body rod protein FlgC  48.92 
 
 		 135 aa  133  8e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.392549  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1225  flagellar basal body rod protein FlgC  44.29 
 
 		 140 aa  133  9e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5626  flagellar basal-body rod protein FlgC  50.72 
 
 		 135 aa  132  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2923  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.83 
 
 		 134 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4198  flagellar basal-body rod protein FlgC  49.63 
 
 		 138 aa  130  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3101  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.55 
 
 		 134 aa  129  9e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.653799  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3828  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.55 
 
 		 134 aa  129  9e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.368958 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2197  flagellar basal body rod protein FlgC  45.65 
 
 		 134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000907371 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0068  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.99 
 
 		 139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1243  flagellar basal body rod protein FlgC  45.65 
 
 		 134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1554  flagellar basal body rod protein FlgC  47.83 
 
 		 134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1977  flagellar basal-body rod protein FlgC  51.8 
 
 		 135 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1272  flagellar basal body rod protein FlgC  45.65 
 
 		 134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0147313 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2013  flagellar basal body rod protein FlgC  45.65 
 
 		 134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1287  flagellar basal body rod protein FlgC  45.65 
 
 		 134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158589  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3072  flagellar basal body rod protein  46.38 
 
 		 138 aa  128  3e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.103316 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0074  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.26 
 
 		 139 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  45.65 
 
 		 134 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3353  flagellar basal body rod protein FlgC  47.1 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3326  flagellar basal body rod protein FlgC  47.1 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0463  flagellar basal body rod protein FlgC  47.1 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2597  flagellar basal body rod protein FlgC  45.65 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2969  flagellar basal body rod protein FlgC  47.1 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0185  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.1 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2098  flagellar basal body rod protein FlgC  47.1 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0238  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.1 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0279  flagellar basal body rod protein FlgC  47.1 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0267  flagellar basal body rod protein FlgC  47.1 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191189  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2949  flagellar basal body rod protein FlgC  46.76 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.741203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1588  flagellar basal body rod protein FlgC  45.65 
 
 		 134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2995  flagellar basal body rod protein FlgC  47.1 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  45.65 
 
 		 134 aa  124  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.65 
 
 		 134 aa  124  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2526  flagellar basal body rod protein FlgC  45.65 
 
 		 134 aa  124  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310597  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  45.65 
 
 		 134 aa  124  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  45.65 
 
 		 134 aa  124  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  45.65 
 
 		 134 aa  124  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1905  flagellar basal body rod protein FlgC  44.93 
 
 		 135 aa  125  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127075 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  45.65 
 
 		 134 aa  124  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  45.65 
 
 		 134 aa  124  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0343  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.32 
 
 		 135 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.962617 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2733  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.65 
 
 		 136 aa  124  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108424 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0241  flagellar basal body rod protein FlgC  47.1 
 
 		 141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2054  flagellar basal body rod protein FlgC  44.93 
 
 		 134 aa  123  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.224564 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0640  flagellar basal body rod protein FlgC  46.1 
 
 		 141 aa  123  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3715  flagellar basal-body rod protein FlgC  51.45 
 
 		 134 aa  123  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2323  flagellar basal body rod protein FlgC  46.38 
 
 		 134 aa  122  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3713  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.6 
 
 		 135 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.889388  normal  0.277072 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4790  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.6 
 
 		 135 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1999  flagellar basal body rod protein FlgC  46.38 
 
 		 134 aa  122  1e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4421  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.1 
 
 		 134 aa  123  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>