More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4198 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4198  flagellar basal-body rod protein FlgC  100 
 
 		 138 aa  280  6.000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1554  flagellar basal body rod protein FlgC  73.28 
 
 		 134 aa  199  8e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3735  flagellar basal body rod protein FlgC  72.93 
 
 		 135 aa  196  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2597  flagellar basal body rod protein FlgC  70.23 
 
 		 134 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2323  flagellar basal body rod protein FlgC  70.23 
 
 		 134 aa  195  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2424  flagellar basal body rod protein FlgC  70.23 
 
 		 134 aa  195  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27738  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  70.23 
 
 		 134 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1999  flagellar basal body rod protein FlgC  70.23 
 
 		 134 aa  195  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2934  flagellar basal body rod protein FlgC  70.8 
 
 		 141 aa  193  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.725751 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3069  flagellar basal body rod protein FlgC  70.8 
 
 		 141 aa  193  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3043  flagellar basal body rod protein FlgC  70.8 
 
 		 141 aa  192  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2410  flagellar basal body rod protein FlgC  70.8 
 
 		 141 aa  192  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642225  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3024  flagellar basal body rod protein FlgC  70.8 
 
 		 141 aa  192  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0826465  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5626  flagellar basal-body rod protein FlgC  72.18 
 
 		 135 aa  192  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1526  flagellar basal-body rod protein FlgC  70.77 
 
 		 134 aa  192  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3019  flagellar basal body rod protein FlgC  70.8 
 
 		 141 aa  191  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6370  flagellar basal body rod protein FlgC  70.07 
 
 		 141 aa  192  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2949  flagellar basal body rod protein FlgC  70.07 
 
 		 141 aa  192  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.741203  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3326  flagellar basal body rod protein FlgC  69.85 
 
 		 141 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0463  flagellar basal body rod protein FlgC  69.85 
 
 		 141 aa  191  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0267  flagellar basal body rod protein FlgC  69.85 
 
 		 141 aa  191  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191189  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2098  flagellar basal body rod protein FlgC  69.85 
 
 		 141 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3353  flagellar basal body rod protein FlgC  69.85 
 
 		 141 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0279  flagellar basal body rod protein FlgC  69.85 
 
 		 141 aa  191  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2995  flagellar basal body rod protein FlgC  69.85 
 
 		 141 aa  191  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1287  flagellar basal body rod protein FlgC  69.17 
 
 		 134 aa  190  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158589  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1243  flagellar basal body rod protein FlgC  69.17 
 
 		 134 aa  190  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1272  flagellar basal body rod protein FlgC  69.17 
 
 		 134 aa  190  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0147313 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0241  flagellar basal body rod protein FlgC  70.8 
 
 		 141 aa  191  4e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2197  flagellar basal body rod protein FlgC  69.17 
 
 		 134 aa  190  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000907371 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2013  flagellar basal body rod protein FlgC  69.17 
 
 		 134 aa  190  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2969  flagellar basal body rod protein FlgC  67.18 
 
 		 134 aa  190  7e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134298  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  69.17 
 
 		 134 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  69.17 
 
 		 134 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  69.17 
 
 		 134 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  69.17 
 
 		 134 aa  187  2.9999999999999997e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  69.17 
 
 		 134 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2526  flagellar basal body rod protein FlgC  69.17 
 
 		 134 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310597  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  69.17 
 
 		 134 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  69.17 
 
 		 134 aa  187  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2054  flagellar basal body rod protein FlgC  68.42 
 
 		 134 aa  187  5.999999999999999e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.224564 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1588  flagellar basal body rod protein FlgC  67.67 
 
 		 134 aa  186  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0750  flagellar basal-body rod protein FlgC  67.67 
 
 		 137 aa  183  8e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24010  flagellar basal-body rod protein  61.83 
 
 		 135 aa  175  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0141  flagellar basal body rod protein FlgC  62.41 
 
 		 141 aa  173  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.899584 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3793  flagellar basal body rod protein FlgC  61.7 
 
 		 141 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2733  flagellar basal-body rod protein FlgC  62.6 
 
 		 136 aa  172  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108424 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1322  flagellar basal-body rod protein FlgC  63.5 
 
 		 139 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3072  flagellar basal body rod protein  62.22 
 
 		 138 aa  166  8e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.103316 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1955  flagellar basal-body rod protein FlgC  60.45 
 
 		 135 aa  166  1e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3101  flagellar basal-body rod protein FlgC  61.07 
 
 		 134 aa  164  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.653799  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3828  flagellar basal-body rod protein FlgC  61.07 
 
 		 134 aa  164  4e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.368958 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0632  flagellar basal-body rod protein FlgC  58.02 
 
 		 134 aa  163  5.9999999999999996e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2923  flagellar basal-body rod protein FlgC  61.07 
 
 		 134 aa  162  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4421  flagellar basal-body rod protein FlgC  59.54 
 
 		 134 aa  161  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1636  flagellar basal-body rod protein FlgC  68.1 
 
 		 134 aa  159  8.000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0343  flagellar basal-body rod protein FlgC  63.08 
 
 		 135 aa  157  5e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.962617 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1977  flagellar basal-body rod protein FlgC  61.83 
 
 		 135 aa  157  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0568  flagellar basal-body rod protein FlgC  56.49 
 
 		 134 aa  155  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3713  flagellar basal-body rod protein FlgC  62.31 
 
 		 135 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.889388  normal  0.277072 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4790  flagellar basal-body rod protein FlgC  62.31 
 
 		 135 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3715  flagellar basal-body rod protein FlgC  61.07 
 
 		 134 aa  148  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1934  flagellar basal-body rod protein FlgC  51.41 
 
 		 146 aa  147  7e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3480  flagellar basal body rod protein FlgC  51.41 
 
 		 146 aa  147  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.485481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2317  flagellar basal body rod protein FlgC  52.99 
 
 		 137 aa  143  9e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.870376  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1346  flagellar basal body rod protein FlgC  55.22 
 
 		 139 aa  142  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4250  flagellar basal body rod protein FlgC  50.7 
 
 		 147 aa  140  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1341  flagellar basal body rod protein FlgC  51.11 
 
 		 138 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4299  flagellar basal body rod protein FlgC  47.95 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50470  flagellar basal body rod protein FlgC  47.95 
 
 		 146 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0177426 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1478  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.92 
 
 		 143 aa  131  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2596  flagellar basal body rod protein FlgC  49.63 
 
 		 138 aa  131  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1685  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.36 
 
 		 140 aa  130  3.9999999999999996e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149162  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3951  flagellar basal body rod protein FlgC  46.48 
 
 		 147 aa  130  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1103  flagellar basal body rod protein FlgC  46.53 
 
 		 149 aa  130  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3086  flagellar basal body rod protein FlgC  48.15 
 
 		 138 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3731  flagellar basal body rod protein FlgC  47.18 
 
 		 147 aa  130  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1304  flagellar basal body rod protein FlgC  49.63 
 
 		 138 aa  129  9e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0408  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.83 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2377  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.48 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2175  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.71 
 
 		 145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.869204  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1162  flagellar basal body rod protein FlgC  49.63 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.509908  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1465  flagellar basal body rod protein FlgC  46.48 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2053  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.58 
 
 		 147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1473  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.15 
 
 		 136 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2212  flagellar basal body rod protein FlgC  48.2 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0463  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.97 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4390  flagellar basal body rod protein FlgC  46.48 
 
 		 147 aa  128  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0794673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004172  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.01 
 
 		 137 aa  128  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1322  flagellar basal body rod protein FlgC  49.63 
 
 		 138 aa  128  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0795532 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2337  flagellar basal body rod protein FlgC  47.41 
 
 		 138 aa  127  7.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01287  flagellar basal body rod protein FlgC  46.27 
 
 		 137 aa  127  7.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2849  flagellar basal body rod protein FlgC  44.9 
 
 		 147 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3249  flagellar basal body rod protein FlgC  48.89 
 
 		 138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2946  flagellar basal body rod protein FlgC  49.63 
 
 		 138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16910  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.45 
 
 		 145 aa  125  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3099  flagellar basal body rod protein FlgC  49.63 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1417  flagellar basal body rod protein FlgC  49.63 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1598  flagellar basal body rod protein FlgC  48.15 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3582  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.44 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.122416  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>