260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000739 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000739  flagellar basal-body rod protein FlgC  100 
 
 		 131 aa  266  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04910  flagellar basal body rod protein FlgC  93.85 
 
 		 144 aa  252  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0640  flagellar basal body rod protein FlgC  57.36 
 
 		 141 aa  150  4e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0226  flagellar basal body rod protein FlgC  57.36 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.893505 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0720  flagellar basal body rod protein FlgC  57.36 
 
 		 141 aa  149  1e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3577  flagellar basal-body rod protein FlgC  57.69 
 
 		 142 aa  148  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3370  flagellar basal body rod protein FlgC  58.02 
 
 		 143 aa  148  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0264  flagellar basal body rod protein FlgC  58.02 
 
 		 143 aa  148  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.998059 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0207  flagellar basal body rod protein FlgC  61.24 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.662374 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3650  flagellar basal-body rod protein FlgC  53.12 
 
 		 139 aa  144  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0074  flagellar basal-body rod protein FlgC  53.12 
 
 		 139 aa  143  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3467  flagellar basal-body rod protein FlgC  53.91 
 
 		 138 aa  142  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3970  flagellar basal-body rod protein FlgC  53.12 
 
 		 138 aa  142  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4250  flagellar basal body rod protein FlgC  50 
 
 		 147 aa  141  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0068  flagellar basal-body rod protein FlgC  51.56 
 
 		 139 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1103  flagellar basal body rod protein FlgC  50.74 
 
 		 149 aa  137  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1465  flagellar basal body rod protein FlgC  48.51 
 
 		 147 aa  135  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3951  flagellar basal body rod protein FlgC  48.51 
 
 		 147 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4390  flagellar basal body rod protein FlgC  47.76 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0794673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2849  flagellar basal body rod protein FlgC  47.01 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1934  flagellar basal-body rod protein FlgC  49.62 
 
 		 146 aa  134  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3480  flagellar basal body rod protein FlgC  49.62 
 
 		 146 aa  134  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.485481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3731  flagellar basal body rod protein FlgC  47.01 
 
 		 147 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0185  flagellar basal-body rod protein FlgC  52.71 
 
 		 138 aa  130  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4299  flagellar basal body rod protein FlgC  46.67 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50470  flagellar basal body rod protein FlgC  46.67 
 
 		 146 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0177426 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0238  flagellar basal-body rod protein FlgC  51.16 
 
 		 138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4672  flagellar basal-body rod protein FlgC  50.77 
 
 		 132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0133607 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3582  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.2 
 
 		 151 aa  122  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.122416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1473  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.96 
 
 		 136 aa  121  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2212  flagellar basal body rod protein FlgC  44.7 
 
 		 144 aa  120  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0927  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.56 
 
 		 139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3099  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.27 
 
 		 140 aa  117  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329796  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1218  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.96 
 
 		 139 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.181311  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02927  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.85 
 
 		 127 aa  114  5e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.133491  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3086  flagellar basal body rod protein FlgC  41.86 
 
 		 138 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1598  flagellar basal body rod protein FlgC  41.86 
 
 		 139 aa  110  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1162  flagellar basal body rod protein FlgC  43.41 
 
 		 138 aa  110  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.509908  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2377  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.86 
 
 		 137 aa  110  7.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1304  flagellar basal body rod protein FlgC  41.86 
 
 		 138 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1346  flagellar basal body rod protein FlgC  43.08 
 
 		 139 aa  110  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1791  flagellar basal body rod protein FlgC  42.64 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1775  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.41 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2317  flagellar basal body rod protein FlgC  41.54 
 
 		 137 aa  108  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.870376  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1341  flagellar basal body rod protein FlgC  41.09 
 
 		 138 aa  105  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2337  flagellar basal body rod protein FlgC  39.53 
 
 		 138 aa  105  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2596  flagellar basal body rod protein FlgC  40.31 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1225  flagellar basal body rod protein FlgC  38.76 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1225  flagellar basal body rod protein FlgC  38.76 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0894  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.34 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004172  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.09 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1478  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.31 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3249  flagellar basal body rod protein FlgC  40.31 
 
 		 138 aa  101  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1905  flagellar basal body rod protein FlgC  37.69 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127075 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2969  flagellar basal body rod protein FlgC  42.64 
 
 		 134 aa  101  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01287  flagellar basal body rod protein FlgC  40.31 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2946  flagellar basal body rod protein FlgC  41.09 
 
 		 138 aa  101  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  42.64 
 
 		 134 aa  100  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  44.19 
 
 		 134 aa  100  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.19 
 
 		 134 aa  100  7e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  44.19 
 
 		 134 aa  100  7e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  44.19 
 
 		 134 aa  100  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  44.19 
 
 		 134 aa  100  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  44.19 
 
 		 134 aa  100  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2526  flagellar basal body rod protein FlgC  44.19 
 
 		 134 aa  100  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310597  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  44.19 
 
 		 134 aa  100  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2597  flagellar basal body rod protein FlgC  42.64 
 
 		 134 aa  100  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1260  flagellar basal body rod protein FlgC  40.31 
 
 		 138 aa  100  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1330  flagellar basal body rod protein FlgC  40.31 
 
 		 138 aa  100  9e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2961  flagellar basal body rod protein FlgC  40.31 
 
 		 138 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.211432  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3099  flagellar basal body rod protein FlgC  40.31 
 
 		 138 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2054  flagellar basal body rod protein FlgC  43.41 
 
 		 134 aa  99.4  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.224564 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1417  flagellar basal body rod protein FlgC  40.31 
 
 		 138 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1322  flagellar basal body rod protein FlgC  39.53 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0795532 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1287  flagellar basal body rod protein FlgC  41.86 
 
 		 134 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158589  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1272  flagellar basal body rod protein FlgC  41.86 
 
 		 134 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0147313 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1322  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.53 
 
 		 139 aa  97.1  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1588  flagellar basal body rod protein FlgC  44.19 
 
 		 134 aa  97.1  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2013  flagellar basal body rod protein FlgC  41.86 
 
 		 134 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2197  flagellar basal body rod protein FlgC  41.86 
 
 		 134 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000907371 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1243  flagellar basal body rod protein FlgC  41.86 
 
 		 134 aa  97.1  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0750  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.09 
 
 		 137 aa  96.3  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01012  flagellar basal body rod protein FlgC  35.66 
 
 		 135 aa  95.5  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.392549  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06154  flagellar basal body rod protein FlgC  35.66 
 
 		 135 aa  95.5  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000293747  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1526  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.64 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2424  flagellar basal body rod protein FlgC  39.53 
 
 		 134 aa  93.6  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27738  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2323  flagellar basal body rod protein FlgC  39.53 
 
 		 134 aa  93.6  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2923  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.22 
 
 		 134 aa  93.6  9e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1999  flagellar basal body rod protein FlgC  39.53 
 
 		 134 aa  93.6  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1270  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.31 
 
 		 134 aa  92.8  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24010  flagellar basal-body rod protein  37.69 
 
 		 135 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2908  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.76 
 
 		 267 aa  92.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.742895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3713  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.31 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.889388  normal  0.277072 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4790  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.31 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0519  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.95 
 
 		 189 aa  90.9  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.6169  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0568  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.53 
 
 		 134 aa  90.9  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3101  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.53 
 
 		 134 aa  90.1  9e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.653799  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3828  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.53 
 
 		 134 aa  90.1  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.368958 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0463  flagellar basal body rod protein FlgC  39.53 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3353  flagellar basal body rod protein FlgC  39.53 
 
 		 141 aa  89.7  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>