260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0207 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_0207  flagellar basal body rod protein FlgC  100 
 
 		 142 aa  291  2e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.662374 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0640  flagellar basal body rod protein FlgC  62.41 
 
 		 141 aa  181  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0720  flagellar basal body rod protein FlgC  61.7 
 
 		 141 aa  178  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0226  flagellar basal body rod protein FlgC  61.7 
 
 		 141 aa  178  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.893505 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04910  flagellar basal body rod protein FlgC  59.15 
 
 		 144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3467  flagellar basal-body rod protein FlgC  57.86 
 
 		 138 aa  164  5e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3970  flagellar basal-body rod protein FlgC  57.14 
 
 		 138 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3650  flagellar basal-body rod protein FlgC  56.43 
 
 		 139 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0264  flagellar basal body rod protein FlgC  57.64 
 
 		 143 aa  161  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.998059 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0074  flagellar basal-body rod protein FlgC  55.71 
 
 		 139 aa  161  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3370  flagellar basal body rod protein FlgC  57.64 
 
 		 143 aa  161  3e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0068  flagellar basal-body rod protein FlgC  55 
 
 		 139 aa  158  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000739  flagellar basal-body rod protein FlgC  61.24 
 
 		 131 aa  158  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4672  flagellar basal-body rod protein FlgC  53.9 
 
 		 132 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0133607 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3577  flagellar basal-body rod protein FlgC  52.52 
 
 		 142 aa  150  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0185  flagellar basal-body rod protein FlgC  54.93 
 
 		 138 aa  149  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0238  flagellar basal-body rod protein FlgC  54.93 
 
 		 138 aa  147  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3582  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.4 
 
 		 151 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.122416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1103  flagellar basal body rod protein FlgC  47.33 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4250  flagellar basal body rod protein FlgC  44.22 
 
 		 147 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1934  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.52 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3480  flagellar basal body rod protein FlgC  44.52 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.485481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4299  flagellar basal body rod protein FlgC  43.15 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1465  flagellar basal body rod protein FlgC  43.54 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50470  flagellar basal body rod protein FlgC  43.15 
 
 		 146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0177426 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3951  flagellar basal body rod protein FlgC  43.54 
 
 		 147 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2212  flagellar basal body rod protein FlgC  45.03 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4390  flagellar basal body rod protein FlgC  42.86 
 
 		 147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0794673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2849  flagellar basal body rod protein FlgC  42.21 
 
 		 147 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3731  flagellar basal body rod protein FlgC  42.18 
 
 		 147 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2377  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.68 
 
 		 137 aa  125  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1218  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.73 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.181311  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06154  flagellar basal body rod protein FlgC  42.22 
 
 		 135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000293747  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01012  flagellar basal body rod protein FlgC  42.22 
 
 		 135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.392549  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1225  flagellar basal body rod protein FlgC  38.78 
 
 		 140 aa  116  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1225  flagellar basal body rod protein FlgC  40.43 
 
 		 140 aa  116  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0894  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.87 
 
 		 151 aa  115  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1478  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.25 
 
 		 143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1775  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.72 
 
 		 133 aa  114  3.9999999999999997e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1791  flagellar basal body rod protein FlgC  39.01 
 
 		 138 aa  114  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1346  flagellar basal body rod protein FlgC  40.28 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2337  flagellar basal body rod protein FlgC  38.73 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1162  flagellar basal body rod protein FlgC  39.16 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.509908  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2596  flagellar basal body rod protein FlgC  39.01 
 
 		 138 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1417  flagellar basal body rod protein FlgC  39.72 
 
 		 138 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2946  flagellar basal body rod protein FlgC  39.72 
 
 		 138 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1304  flagellar basal body rod protein FlgC  37.59 
 
 		 138 aa  110  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2317  flagellar basal body rod protein FlgC  39.44 
 
 		 137 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.870376  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3099  flagellar basal body rod protein FlgC  39.01 
 
 		 138 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2961  flagellar basal body rod protein FlgC  39.01 
 
 		 138 aa  110  9e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.211432  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1473  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.06 
 
 		 136 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01287  flagellar basal body rod protein FlgC  38.03 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004172  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.03 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3099  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.01 
 
 		 140 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329796  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1260  flagellar basal body rod protein FlgC  39.01 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1330  flagellar basal body rod protein FlgC  39.01 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1322  flagellar basal body rod protein FlgC  37.59 
 
 		 138 aa  107  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0795532 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3249  flagellar basal body rod protein FlgC  37.59 
 
 		 138 aa  106  9.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1905  flagellar basal body rod protein FlgC  37.23 
 
 		 135 aa  106  9.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127075 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0750  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.44 
 
 		 137 aa  106  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1341  flagellar basal body rod protein FlgC  37.76 
 
 		 138 aa  105  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  42.55 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.55 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1598  flagellar basal body rod protein FlgC  37.06 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  42.55 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3086  flagellar basal body rod protein FlgC  35.86 
 
 		 138 aa  105  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  42.55 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  42.55 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  42.55 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  42.55 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1270  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.88 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2526  flagellar basal body rod protein FlgC  42.55 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310597  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2054  flagellar basal body rod protein FlgC  42.55 
 
 		 134 aa  105  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.224564 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0632  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.44 
 
 		 134 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1636  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.88 
 
 		 134 aa  103  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0082  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.57 
 
 		 138 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1718  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.57 
 
 		 138 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.963036 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2597  flagellar basal body rod protein FlgC  40.43 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2733  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.73 
 
 		 136 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108424 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  40.43 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2013  flagellar basal body rod protein FlgC  41.13 
 
 		 134 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1287  flagellar basal body rod protein FlgC  41.13 
 
 		 134 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158589  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1243  flagellar basal body rod protein FlgC  41.13 
 
 		 134 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2197  flagellar basal body rod protein FlgC  41.13 
 
 		 134 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000907371 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1272  flagellar basal body rod protein FlgC  41.13 
 
 		 134 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0147313 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0241  flagellar basal body rod protein FlgC  41.61 
 
 		 141 aa  100  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1955  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.43 
 
 		 135 aa  100  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3101  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.73 
 
 		 134 aa  100  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.653799  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3828  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.73 
 
 		 134 aa  100  7e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.368958 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2923  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.86 
 
 		 134 aa  100  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3326  flagellar basal body rod protein FlgC  41.61 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4790  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.14 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0463  flagellar basal body rod protein FlgC  41.61 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3713  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.14 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.889388  normal  0.277072 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2995  flagellar basal body rod protein FlgC  41.61 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0568  flagellar basal-body rod protein FlgC  40 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2098  flagellar basal body rod protein FlgC  41.61 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0267  flagellar basal body rod protein FlgC  41.61 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191189  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0279  flagellar basal body rod protein FlgC  41.61 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3353  flagellar basal body rod protein FlgC  41.61 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>