257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3577 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_3577  flagellar basal-body rod protein FlgC  100 
 
 
142 aa  286  6e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04910  flagellar basal body rod protein FlgC  57.14 
 
 
144 aa  161  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0226  flagellar basal body rod protein FlgC  55.4 
 
 
141 aa  156  1e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.893505 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0640  flagellar basal body rod protein FlgC  56.12 
 
 
141 aa  156  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0720  flagellar basal body rod protein FlgC  55.4 
 
 
141 aa  156  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000739  flagellar basal-body rod protein FlgC  57.69 
 
 
131 aa  148  2e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0068  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.92 
 
 
139 aa  142  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3970  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.48 
 
 
138 aa  140  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0207  flagellar basal body rod protein FlgC  52.52 
 
 
142 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.662374 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4672  flagellar basal-body rod protein FlgC  53.28 
 
 
132 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0133607 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3467  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.48 
 
 
138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3370  flagellar basal body rod protein FlgC  49.65 
 
 
143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0264  flagellar basal body rod protein FlgC  49.65 
 
 
143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.998059 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0074  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.76 
 
 
139 aa  135  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3650  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.04 
 
 
139 aa  134  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0185  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.92 
 
 
138 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0238  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.92 
 
 
138 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3582  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.15 
 
 
151 aa  127  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.122416  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1103  flagellar basal body rod protein FlgC  46.26 
 
 
149 aa  126  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2212  flagellar basal body rod protein FlgC  44.37 
 
 
144 aa  123  7e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2849  flagellar basal body rod protein FlgC  41.38 
 
 
147 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1465  flagellar basal body rod protein FlgC  40.69 
 
 
147 aa  120  7e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4390  flagellar basal body rod protein FlgC  40 
 
 
147 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0794673  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4250  flagellar basal body rod protein FlgC  40.69 
 
 
147 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3951  flagellar basal body rod protein FlgC  40 
 
 
147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3731  flagellar basal body rod protein FlgC  40 
 
 
147 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321201  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1934  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.97 
 
 
146 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3480  flagellar basal body rod protein FlgC  40.97 
 
 
146 aa  113  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.485481  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4299  flagellar basal body rod protein FlgC  38.89 
 
 
146 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50470  flagellar basal body rod protein FlgC  38.89 
 
 
146 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0177426 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1473  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.9 
 
 
136 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06154  flagellar basal body rod protein FlgC  44.7 
 
 
135 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000293747  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01012  flagellar basal body rod protein FlgC  44.7 
 
 
135 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.392549  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1346  flagellar basal body rod protein FlgC  43.07 
 
 
139 aa  108  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3086  flagellar basal body rod protein FlgC  41.61 
 
 
138 aa  106  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2377  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.15 
 
 
137 aa  105  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2596  flagellar basal body rod protein FlgC  42.34 
 
 
138 aa  105  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1598  flagellar basal body rod protein FlgC  42.34 
 
 
139 aa  104  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2961  flagellar basal body rod protein FlgC  42.34 
 
 
138 aa  103  5e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.211432  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2317  flagellar basal body rod protein FlgC  42.11 
 
 
137 aa  103  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.870376  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3099  flagellar basal body rod protein FlgC  42.34 
 
 
138 aa  103  5e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2946  flagellar basal body rod protein FlgC  42.34 
 
 
138 aa  104  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1225  flagellar basal body rod protein FlgC  37.41 
 
 
140 aa  103  6e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0927  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.3 
 
 
139 aa  103  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1417  flagellar basal body rod protein FlgC  42.34 
 
 
138 aa  103  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1260  flagellar basal body rod protein FlgC  42.34 
 
 
138 aa  103  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1330  flagellar basal body rod protein FlgC  42.34 
 
 
138 aa  103  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1225  flagellar basal body rod protein FlgC  37.41 
 
 
140 aa  103  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  46.21 
 
 
134 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.21 
 
 
134 aa  102  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  46.21 
 
 
134 aa  102  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  46.21 
 
 
134 aa  102  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  46.21 
 
 
134 aa  102  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2526  flagellar basal body rod protein FlgC  46.21 
 
 
134 aa  102  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310597  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  46.21 
 
 
134 aa  102  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  46.21 
 
 
134 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2054  flagellar basal body rod protein FlgC  46.21 
 
 
134 aa  102  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.224564 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1322  flagellar basal body rod protein FlgC  41.61 
 
 
138 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0795532 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1905  flagellar basal body rod protein FlgC  39.39 
 
 
135 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.127075 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2908  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.01 
 
 
267 aa  101  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.742895  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3249  flagellar basal body rod protein FlgC  40.15 
 
 
138 aa  99.8  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1162  flagellar basal body rod protein FlgC  39.42 
 
 
138 aa  100  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.509908  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004172  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.6 
 
 
137 aa  99.8  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0894  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.46 
 
 
151 aa  98.2  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1304  flagellar basal body rod protein FlgC  38.57 
 
 
138 aa  97.8  4e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1270  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.58 
 
 
134 aa  97.8  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.261409  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1341  flagellar basal body rod protein FlgC  40.15 
 
 
138 aa  97.8  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01287  flagellar basal body rod protein FlgC  39.85 
 
 
137 aa  97.8  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3101  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.91 
 
 
134 aa  97.4  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.653799  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1218  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.31 
 
 
139 aa  97.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.181311  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3828  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.91 
 
 
134 aa  97.4  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.368958 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2733  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.15 
 
 
136 aa  97.1  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108424 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1791  flagellar basal body rod protein FlgC  40.91 
 
 
138 aa  96.7  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1322  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.55 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1243  flagellar basal body rod protein FlgC  42.42 
 
 
134 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1272  flagellar basal body rod protein FlgC  42.42 
 
 
134 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0147313 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2197  flagellar basal body rod protein FlgC  42.42 
 
 
134 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000907371 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2013  flagellar basal body rod protein FlgC  42.42 
 
 
134 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1287  flagellar basal body rod protein FlgC  42.42 
 
 
134 aa  94.7  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158589  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0632  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.85 
 
 
134 aa  94.4  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  39.57 
 
 
134 aa  94  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0343  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.81 
 
 
135 aa  93.6  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.962617 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2597  flagellar basal body rod protein FlgC  39.57 
 
 
134 aa  93.6  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2337  flagellar basal body rod protein FlgC  37.23 
 
 
138 aa  93.6  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4790  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.31 
 
 
135 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3713  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.31 
 
 
135 aa  93.2  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.889388  normal  0.277072 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1588  flagellar basal body rod protein FlgC  41.67 
 
 
134 aa  92  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1775  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.88 
 
 
133 aa  92  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0568  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.22 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2969  flagellar basal body rod protein FlgC  40.91 
 
 
134 aa  91.3  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134298  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2949  flagellar basal body rod protein FlgC  40.29 
 
 
141 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.741203  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3326  flagellar basal body rod protein FlgC  40.58 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0463  flagellar basal body rod protein FlgC  40.58 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2995  flagellar basal body rod protein FlgC  40.58 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2098  flagellar basal body rod protein FlgC  40.58 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0267  flagellar basal body rod protein FlgC  40.58 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191189  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0279  flagellar basal body rod protein FlgC  40.58 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3353  flagellar basal body rod protein FlgC  40.58 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3043  flagellar basal body rod protein FlgC  40.29 
 
 
141 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2410  flagellar basal body rod protein FlgC  40.29 
 
 
141 aa  90.9  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>