286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3713 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3713  flagellar basal-body rod protein FlgC  100 
 
 
135 aa  273  6e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.889388  normal  0.277072 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4790  flagellar basal-body rod protein FlgC  100 
 
 
135 aa  273  6e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0343  flagellar basal-body rod protein FlgC  96.3 
 
 
135 aa  263  5.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.962617 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1554  flagellar basal body rod protein FlgC  67.65 
 
 
134 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1999  flagellar basal body rod protein FlgC  65.19 
 
 
134 aa  171  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2323  flagellar basal body rod protein FlgC  65.19 
 
 
134 aa  171  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2424  flagellar basal body rod protein FlgC  65.19 
 
 
134 aa  171  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27738  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1526  flagellar basal-body rod protein FlgC  66.67 
 
 
134 aa  169  9e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2969  flagellar basal body rod protein FlgC  63.7 
 
 
134 aa  168  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134298  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2197  flagellar basal body rod protein FlgC  63.7 
 
 
134 aa  167  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000907371 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1243  flagellar basal body rod protein FlgC  63.7 
 
 
134 aa  167  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1272  flagellar basal body rod protein FlgC  63.7 
 
 
134 aa  167  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0147313 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2013  flagellar basal body rod protein FlgC  63.7 
 
 
134 aa  167  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1287  flagellar basal body rod protein FlgC  63.7 
 
 
134 aa  167  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158589  normal  0.0305834 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  66.18 
 
 
134 aa  166  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  66.18 
 
 
134 aa  166  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  66.18 
 
 
134 aa  166  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2526  flagellar basal body rod protein FlgC  66.18 
 
 
134 aa  166  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310597  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  66.18 
 
 
134 aa  166  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  66.18 
 
 
134 aa  166  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  66.18 
 
 
134 aa  166  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  66.18 
 
 
134 aa  166  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1588  flagellar basal body rod protein FlgC  64.44 
 
 
134 aa  165  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2054  flagellar basal body rod protein FlgC  65.44 
 
 
134 aa  164  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.224564 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2597  flagellar basal body rod protein FlgC  62.22 
 
 
134 aa  164  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  62.22 
 
 
134 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0632  flagellar basal-body rod protein FlgC  57.78 
 
 
134 aa  162  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3735  flagellar basal body rod protein FlgC  62.04 
 
 
135 aa  158  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24010  flagellar basal-body rod protein  57.78 
 
 
135 aa  156  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3101  flagellar basal-body rod protein FlgC  56.3 
 
 
134 aa  155  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.653799  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3828  flagellar basal-body rod protein FlgC  56.3 
 
 
134 aa  155  1e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.368958 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2733  flagellar basal-body rod protein FlgC  55.56 
 
 
136 aa  155  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108424 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1955  flagellar basal-body rod protein FlgC  58.39 
 
 
135 aa  154  3e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3326  flagellar basal body rod protein FlgC  59.71 
 
 
141 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0463  flagellar basal body rod protein FlgC  59.71 
 
 
141 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3353  flagellar basal body rod protein FlgC  59.71 
 
 
141 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0267  flagellar basal body rod protein FlgC  59.71 
 
 
141 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191189  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0279  flagellar basal body rod protein FlgC  59.71 
 
 
141 aa  154  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2995  flagellar basal body rod protein FlgC  59.71 
 
 
141 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2098  flagellar basal body rod protein FlgC  59.71 
 
 
141 aa  154  4e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4198  flagellar basal-body rod protein FlgC  62.31 
 
 
138 aa  154  5.0000000000000005e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0241  flagellar basal body rod protein FlgC  59.71 
 
 
141 aa  153  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2949  flagellar basal body rod protein FlgC  58.99 
 
 
141 aa  153  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.741203  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3043  flagellar basal body rod protein FlgC  59.71 
 
 
141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6370  flagellar basal body rod protein FlgC  58.99 
 
 
141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130671  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3019  flagellar basal body rod protein FlgC  58.99 
 
 
141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2410  flagellar basal body rod protein FlgC  59.71 
 
 
141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642225  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3024  flagellar basal body rod protein FlgC  59.71 
 
 
141 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0826465  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2934  flagellar basal body rod protein FlgC  59.71 
 
 
141 aa  150  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.725751 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3069  flagellar basal body rod protein FlgC  59.71 
 
 
141 aa  150  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0750  flagellar basal-body rod protein FlgC  57.66 
 
 
137 aa  150  5.9999999999999996e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5626  flagellar basal-body rod protein FlgC  58.39 
 
 
135 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1322  flagellar basal-body rod protein FlgC  55.71 
 
 
139 aa  150  7e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3072  flagellar basal body rod protein  56.12 
 
 
138 aa  150  7e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.103316 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1636  flagellar basal-body rod protein FlgC  63.87 
 
 
134 aa  149  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0141  flagellar basal body rod protein FlgC  58.7 
 
 
141 aa  149  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.899584 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3793  flagellar basal body rod protein FlgC  57.97 
 
 
141 aa  147  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4421  flagellar basal-body rod protein FlgC  55.56 
 
 
134 aa  146  9e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3715  flagellar basal-body rod protein FlgC  54.07 
 
 
134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0568  flagellar basal-body rod protein FlgC  54.07 
 
 
134 aa  145  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2923  flagellar basal-body rod protein FlgC  54.81 
 
 
134 aa  142  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1977  flagellar basal-body rod protein FlgC  56.62 
 
 
135 aa  142  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2053  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.95 
 
 
147 aa  130  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2719  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.67 
 
 
150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.78537  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2212  flagellar basal body rod protein FlgC  46.9 
 
 
144 aa  128  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0463  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.59 
 
 
147 aa  128  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1218  flagellar basal-body rod protein FlgC  51.47 
 
 
139 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.181311  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1934  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.58 
 
 
146 aa  127  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3480  flagellar basal body rod protein FlgC  45.58 
 
 
146 aa  127  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.485481  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2849  flagellar basal body rod protein FlgC  46.62 
 
 
147 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1478  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.85 
 
 
143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01012  flagellar basal body rod protein FlgC  50 
 
 
135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.392549  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06154  flagellar basal body rod protein FlgC  50 
 
 
135 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000293747  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4299  flagellar basal body rod protein FlgC  46.94 
 
 
146 aa  124  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50470  flagellar basal body rod protein FlgC  46.94 
 
 
146 aa  124  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0177426 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1341  flagellar basal body rod protein FlgC  44.6 
 
 
138 aa  124  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0894  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.03 
 
 
151 aa  124  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4250  flagellar basal body rod protein FlgC  47.3 
 
 
147 aa  123  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2377  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.1 
 
 
137 aa  123  9e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1775  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.15 
 
 
133 aa  123  9e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2596  flagellar basal body rod protein FlgC  44.6 
 
 
138 aa  122  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1304  flagellar basal body rod protein FlgC  44.6 
 
 
138 aa  122  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1346  flagellar basal body rod protein FlgC  45.65 
 
 
139 aa  122  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2317  flagellar basal body rod protein FlgC  46.1 
 
 
137 aa  122  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.870376  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1473  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.34 
 
 
136 aa  121  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1905  flagellar basal body rod protein FlgC  46.32 
 
 
135 aa  121  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.127075 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1465  flagellar basal body rod protein FlgC  44.59 
 
 
147 aa  121  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3951  flagellar basal body rod protein FlgC  44.59 
 
 
147 aa  120  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4390  flagellar basal body rod protein FlgC  44.59 
 
 
147 aa  120  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0794673  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2946  flagellar basal body rod protein FlgC  45.32 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1162  flagellar basal body rod protein FlgC  43.88 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.509908  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1103  flagellar basal body rod protein FlgC  42.95 
 
 
149 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3099  flagellar basal body rod protein FlgC  44.6 
 
 
138 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1260  flagellar basal body rod protein FlgC  44.6 
 
 
138 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1330  flagellar basal body rod protein FlgC  44.6 
 
 
138 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0267  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.18 
 
 
141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1322  flagellar basal body rod protein FlgC  44.6 
 
 
138 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0795532 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2961  flagellar basal body rod protein FlgC  44.6 
 
 
138 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.211432  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2337  flagellar basal body rod protein FlgC  43.88 
 
 
138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3731  flagellar basal body rod protein FlgC  42.57 
 
 
147 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321201  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>