260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0720 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0720  flagellar basal body rod protein FlgC  100 
 
 		 141 aa  283  5.999999999999999e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0226  flagellar basal body rod protein FlgC  100 
 
 		 141 aa  283  5.999999999999999e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.893505 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0640  flagellar basal body rod protein FlgC  95.74 
 
 		 141 aa  273  5e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3370  flagellar basal body rod protein FlgC  64.79 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0264  flagellar basal body rod protein FlgC  64.79 
 
 		 143 aa  188  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.998059 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04910  flagellar basal body rod protein FlgC  59.15 
 
 		 144 aa  170  5.999999999999999e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0207  flagellar basal body rod protein FlgC  61.7 
 
 		 142 aa  164  4e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.662374 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3577  flagellar basal-body rod protein FlgC  55.4 
 
 		 142 aa  156  1e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1103  flagellar basal body rod protein FlgC  53.02 
 
 		 149 aa  155  1e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3582  flagellar basal-body rod protein FlgC  54.73 
 
 		 151 aa  154  4e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.122416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0068  flagellar basal-body rod protein FlgC  54.23 
 
 		 139 aa  153  8e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3467  flagellar basal-body rod protein FlgC  52.82 
 
 		 138 aa  152  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3970  flagellar basal-body rod protein FlgC  52.11 
 
 		 138 aa  152  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0185  flagellar basal-body rod protein FlgC  52.48 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000739  flagellar basal-body rod protein FlgC  57.36 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0238  flagellar basal-body rod protein FlgC  52.48 
 
 		 138 aa  149  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2849  flagellar basal body rod protein FlgC  52.7 
 
 		 147 aa  148  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3650  flagellar basal-body rod protein FlgC  53.57 
 
 		 139 aa  148  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1465  flagellar basal body rod protein FlgC  49.66 
 
 		 147 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0074  flagellar basal-body rod protein FlgC  53.52 
 
 		 139 aa  146  8e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4250  flagellar basal body rod protein FlgC  49.66 
 
 		 147 aa  146  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4390  flagellar basal body rod protein FlgC  48.98 
 
 		 147 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0794673  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1934  flagellar basal-body rod protein FlgC  50.68 
 
 		 146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3480  flagellar basal body rod protein FlgC  50.68 
 
 		 146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.485481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2212  flagellar basal body rod protein FlgC  52.08 
 
 		 144 aa  145  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3951  flagellar basal body rod protein FlgC  48.98 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4299  flagellar basal body rod protein FlgC  51.7 
 
 		 146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50470  flagellar basal body rod protein FlgC  51.7 
 
 		 146 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0177426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3731  flagellar basal body rod protein FlgC  47.62 
 
 		 147 aa  143  6e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4672  flagellar basal-body rod protein FlgC  51.77 
 
 		 132 aa  143  9e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0133607 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2377  flagellar basal-body rod protein FlgC  49.65 
 
 		 137 aa  136  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2337  flagellar basal body rod protein FlgC  47.52 
 
 		 138 aa  126  1.0000000000000001e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1473  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.97 
 
 		 136 aa  123  9e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1598  flagellar basal body rod protein FlgC  46.1 
 
 		 139 aa  122  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2317  flagellar basal body rod protein FlgC  45.77 
 
 		 137 aa  122  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.870376  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1478  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.52 
 
 		 143 aa  122  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004172  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.39 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1346  flagellar basal body rod protein FlgC  45.71 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3099  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.1 
 
 		 140 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329796  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01287  flagellar basal body rod protein FlgC  44.68 
 
 		 137 aa  121  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1162  flagellar basal body rod protein FlgC  45.39 
 
 		 138 aa  121  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.509908  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3086  flagellar basal body rod protein FlgC  45.77 
 
 		 138 aa  121  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1304  flagellar basal body rod protein FlgC  43.97 
 
 		 138 aa  120  5e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1218  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.72 
 
 		 139 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.181311  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1322  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.81 
 
 		 139 aa  118  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2596  flagellar basal body rod protein FlgC  44.68 
 
 		 138 aa  118  3e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1791  flagellar basal body rod protein FlgC  46.48 
 
 		 138 aa  118  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1341  flagellar basal body rod protein FlgC  44.68 
 
 		 138 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0894  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.08 
 
 		 151 aa  117  3.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2946  flagellar basal body rod protein FlgC  44.68 
 
 		 138 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2961  flagellar basal body rod protein FlgC  43.97 
 
 		 138 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.211432  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3099  flagellar basal body rod protein FlgC  43.97 
 
 		 138 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1322  flagellar basal body rod protein FlgC  43.97 
 
 		 138 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0795532 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0927  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.32 
 
 		 139 aa  116  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1260  flagellar basal body rod protein FlgC  43.97 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1330  flagellar basal body rod protein FlgC  43.97 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1417  flagellar basal body rod protein FlgC  43.97 
 
 		 138 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3249  flagellar basal body rod protein FlgC  43.26 
 
 		 138 aa  114  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2923  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.68 
 
 		 134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01012  flagellar basal body rod protein FlgC  45.32 
 
 		 135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.392549  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06154  flagellar basal body rod protein FlgC  45.32 
 
 		 135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000293747  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1225  flagellar basal body rod protein FlgC  42.96 
 
 		 140 aa  110  7.000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0750  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.86 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1955  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.97 
 
 		 135 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  46.1 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.1 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  46.1 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  46.1 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1225  flagellar basal body rod protein FlgC  40.82 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2526  flagellar basal body rod protein FlgC  46.1 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310597  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  46.1 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  46.1 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02927  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.31 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.133491  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  46.1 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2054  flagellar basal body rod protein FlgC  46.1 
 
 		 134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.224564 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1905  flagellar basal body rod protein FlgC  40.29 
 
 		 135 aa  107  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.127075 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24010  flagellar basal-body rod protein  42.86 
 
 		 135 aa  105  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2733  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.13 
 
 		 136 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108424 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1588  flagellar basal body rod protein FlgC  44.68 
 
 		 134 aa  102  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0568  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.37 
 
 		 134 aa  102  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2197  flagellar basal body rod protein FlgC  43.97 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000907371 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1243  flagellar basal body rod protein FlgC  43.97 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4790  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.68 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1272  flagellar basal body rod protein FlgC  43.97 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0147313 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1287  flagellar basal body rod protein FlgC  43.97 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158589  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2013  flagellar basal body rod protein FlgC  43.97 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3713  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.68 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.889388  normal  0.277072 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2949  flagellar basal body rod protein FlgC  43.97 
 
 		 141 aa  101  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.741203  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0343  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.68 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.962617 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1526  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.84 
 
 		 134 aa  100  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3072  flagellar basal body rod protein  41.83 
 
 		 138 aa  100  5e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.103316 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5626  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.26 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3114  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.14 
 
 		 147 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1775  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.46 
 
 		 133 aa  99.8  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2969  flagellar basal body rod protein FlgC  43.26 
 
 		 134 aa  98.6  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3735  flagellar basal body rod protein FlgC  43.38 
 
 		 135 aa  99  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  42.55 
 
 		 134 aa  98.6  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4198  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.8 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2323  flagellar basal body rod protein FlgC  42.25 
 
 		 134 aa  98.6  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2424  flagellar basal body rod protein FlgC  42.25 
 
 		 134 aa  98.6  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>