More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02927 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02927  flagellar basal-body rod protein FlgC  100 
 
 		 127 aa  261  2e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.133491  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3099  flagellar basal-body rod protein FlgC  82.54 
 
 		 140 aa  219  9e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329796  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1478  flagellar basal-body rod protein FlgC  65.89 
 
 		 143 aa  169  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3086  flagellar basal body rod protein FlgC  62.4 
 
 		 138 aa  168  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2317  flagellar basal body rod protein FlgC  64.8 
 
 		 137 aa  167  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.870376  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1162  flagellar basal body rod protein FlgC  63.2 
 
 		 138 aa  167  5e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.509908  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1346  flagellar basal body rod protein FlgC  62.9 
 
 		 139 aa  167  6e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1598  flagellar basal body rod protein FlgC  63.2 
 
 		 139 aa  166  8e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1304  flagellar basal body rod protein FlgC  61.6 
 
 		 138 aa  166  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004172  flagellar basal-body rod protein FlgC  63.2 
 
 		 137 aa  164  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1341  flagellar basal body rod protein FlgC  60 
 
 		 138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01287  flagellar basal body rod protein FlgC  61.6 
 
 		 137 aa  161  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2377  flagellar basal-body rod protein FlgC  62.4 
 
 		 137 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2596  flagellar basal body rod protein FlgC  59.2 
 
 		 138 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2946  flagellar basal body rod protein FlgC  60.8 
 
 		 138 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2961  flagellar basal body rod protein FlgC  60 
 
 		 138 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.211432  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3099  flagellar basal body rod protein FlgC  60 
 
 		 138 aa  158  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1260  flagellar basal body rod protein FlgC  60 
 
 		 138 aa  158  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1330  flagellar basal body rod protein FlgC  60 
 
 		 138 aa  158  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1417  flagellar basal body rod protein FlgC  60 
 
 		 138 aa  157  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1322  flagellar basal body rod protein FlgC  59.2 
 
 		 138 aa  157  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0795532 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3249  flagellar basal body rod protein FlgC  59.2 
 
 		 138 aa  156  7e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4390  flagellar basal body rod protein FlgC  56.72 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0794673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2212  flagellar basal body rod protein FlgC  59.54 
 
 		 144 aa  155  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1465  flagellar basal body rod protein FlgC  56.72 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3951  flagellar basal body rod protein FlgC  56.72 
 
 		 147 aa  155  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2337  flagellar basal body rod protein FlgC  58.4 
 
 		 138 aa  154  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4299  flagellar basal body rod protein FlgC  57.14 
 
 		 146 aa  154  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50470  flagellar basal body rod protein FlgC  57.14 
 
 		 146 aa  154  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0177426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3731  flagellar basal body rod protein FlgC  55.97 
 
 		 147 aa  154  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.321201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1791  flagellar basal body rod protein FlgC  57.6 
 
 		 138 aa  153  8e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1934  flagellar basal-body rod protein FlgC  54.89 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3480  flagellar basal body rod protein FlgC  54.89 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.485481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1103  flagellar basal body rod protein FlgC  56.62 
 
 		 149 aa  151  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1473  flagellar basal-body rod protein FlgC  56 
 
 		 136 aa  150  5e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3582  flagellar basal-body rod protein FlgC  51.85 
 
 		 151 aa  150  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.122416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2849  flagellar basal body rod protein FlgC  53.73 
 
 		 147 aa  147  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.114818 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4250  flagellar basal body rod protein FlgC  52.99 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0927  flagellar basal-body rod protein FlgC  52.34 
 
 		 139 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1218  flagellar basal-body rod protein FlgC  52.8 
 
 		 139 aa  134  4e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.181311  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1775  flagellar basal-body rod protein FlgC  52 
 
 		 133 aa  130  7.999999999999999e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1225  flagellar basal body rod protein FlgC  48.44 
 
 		 140 aa  125  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0074  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.39 
 
 		 139 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0894  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.45 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0068  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.58 
 
 		 139 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1225  flagellar basal body rod protein FlgC  46.88 
 
 		 140 aa  122  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0750  flagellar basal-body rod protein FlgC  53.17 
 
 		 137 aa  123  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0238  flagellar basal-body rod protein FlgC  49.6 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3650  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.77 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0185  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.8 
 
 		 138 aa  121  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3467  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.97 
 
 		 138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3970  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.16 
 
 		 138 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1955  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.4 
 
 		 135 aa  117  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2923  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.03 
 
 		 134 aa  117  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04910  flagellar basal body rod protein FlgC  43.08 
 
 		 144 aa  114  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000739  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.85 
 
 		 131 aa  114  5e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4198  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.4 
 
 		 138 aa  114  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1272  flagellar basal body rod protein FlgC  45.6 
 
 		 134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0147313 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2013  flagellar basal body rod protein FlgC  45.6 
 
 		 134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2197  flagellar basal body rod protein FlgC  45.6 
 
 		 134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000907371 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1287  flagellar basal body rod protein FlgC  45.6 
 
 		 134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158589  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0241  flagellar basal body rod protein FlgC  44.44 
 
 		 141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1243  flagellar basal body rod protein FlgC  45.6 
 
 		 134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1977  flagellar basal-body rod protein FlgC  45 
 
 		 135 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3326  flagellar basal body rod protein FlgC  44.44 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2098  flagellar basal body rod protein FlgC  44.44 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3353  flagellar basal body rod protein FlgC  44.44 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0463  flagellar basal body rod protein FlgC  44.44 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0267  flagellar basal body rod protein FlgC  44.44 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191189  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0279  flagellar basal body rod protein FlgC  44.44 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2995  flagellar basal body rod protein FlgC  44.44 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0264  flagellar basal body rod protein FlgC  42.75 
 
 		 143 aa  111  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.998059 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3370  flagellar basal body rod protein FlgC  42.75 
 
 		 143 aa  111  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3735  flagellar basal body rod protein FlgC  44.8 
 
 		 135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0640  flagellar basal body rod protein FlgC  45.31 
 
 		 141 aa  110  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0769  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.18 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197549 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1588  flagellar basal body rod protein FlgC  45.6 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4672  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.44 
 
 		 132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0133607 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0720  flagellar basal body rod protein FlgC  45.31 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1322  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.06 
 
 		 139 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0226  flagellar basal body rod protein FlgC  45.31 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.893505 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5626  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.2 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24010  flagellar basal-body rod protein  42.06 
 
 		 135 aa  108  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2949  flagellar basal body rod protein FlgC  42.06 
 
 		 141 aa  107  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.741203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0519  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.23 
 
 		 189 aa  107  8.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.6169  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  44 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  44 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  44 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0463  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.31 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  44 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  44 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2526  flagellar basal body rod protein FlgC  44 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310597  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  44 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1554  flagellar basal body rod protein FlgC  44 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  44 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3101  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.4 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.653799  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3828  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.4 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.368958 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2597  flagellar basal body rod protein FlgC  44 
 
 		 134 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  44 
 
 		 134 aa  105  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2969  flagellar basal body rod protein FlgC  44.8 
 
 		 134 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134298  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>