More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3715 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3715  flagellar basal-body rod protein FlgC  100 
 
 		 134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3101  flagellar basal-body rod protein FlgC  82.09 
 
 		 134 aa  229  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.653799  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3828  flagellar basal-body rod protein FlgC  82.09 
 
 		 134 aa  229  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.368958 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4421  flagellar basal-body rod protein FlgC  78.36 
 
 		 134 aa  222  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0632  flagellar basal-body rod protein FlgC  76.12 
 
 		 134 aa  217  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0568  flagellar basal-body rod protein FlgC  76.12 
 
 		 134 aa  214  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2733  flagellar basal-body rod protein FlgC  73.88 
 
 		 136 aa  211  3.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108424 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3072  flagellar basal body rod protein  75.36 
 
 		 138 aa  209  7.999999999999999e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.103316 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3735  flagellar basal body rod protein FlgC  63.7 
 
 		 135 aa  176  9e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1322  flagellar basal-body rod protein FlgC  63.31 
 
 		 139 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2934  flagellar basal body rod protein FlgC  60.14 
 
 		 141 aa  171  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.725751 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3069  flagellar basal body rod protein FlgC  60.14 
 
 		 141 aa  171  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3326  flagellar basal body rod protein FlgC  60.14 
 
 		 141 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2098  flagellar basal body rod protein FlgC  60.14 
 
 		 141 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0267  flagellar basal body rod protein FlgC  60.14 
 
 		 141 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191189  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0463  flagellar basal body rod protein FlgC  60.14 
 
 		 141 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0279  flagellar basal body rod protein FlgC  60.14 
 
 		 141 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3353  flagellar basal body rod protein FlgC  60.14 
 
 		 141 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2995  flagellar basal body rod protein FlgC  60.14 
 
 		 141 aa  170  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0241  flagellar basal body rod protein FlgC  59.42 
 
 		 141 aa  169  9e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2410  flagellar basal body rod protein FlgC  59.42 
 
 		 141 aa  169  9e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642225  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3043  flagellar basal body rod protein FlgC  59.42 
 
 		 141 aa  169  9e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3024  flagellar basal body rod protein FlgC  59.42 
 
 		 141 aa  169  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0826465  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0750  flagellar basal-body rod protein FlgC  61.03 
 
 		 137 aa  168  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24010  flagellar basal-body rod protein  58.96 
 
 		 135 aa  168  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6370  flagellar basal body rod protein FlgC  58.7 
 
 		 141 aa  167  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5626  flagellar basal-body rod protein FlgC  60.74 
 
 		 135 aa  167  6e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3019  flagellar basal body rod protein FlgC  57.97 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1554  flagellar basal body rod protein FlgC  60.45 
 
 		 134 aa  165  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2923  flagellar basal-body rod protein FlgC  60.45 
 
 		 134 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2597  flagellar basal body rod protein FlgC  59.7 
 
 		 134 aa  163  9e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1955  flagellar basal-body rod protein FlgC  59.26 
 
 		 135 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4198  flagellar basal-body rod protein FlgC  61.07 
 
 		 138 aa  162  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  58.96 
 
 		 134 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0141  flagellar basal body rod protein FlgC  55.94 
 
 		 141 aa  159  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.899584 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2949  flagellar basal body rod protein FlgC  57.25 
 
 		 141 aa  159  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.741203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2969  flagellar basal body rod protein FlgC  57.46 
 
 		 134 aa  158  2e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1287  flagellar basal body rod protein FlgC  55.97 
 
 		 134 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158589  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3793  flagellar basal body rod protein FlgC  55.24 
 
 		 141 aa  158  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1272  flagellar basal body rod protein FlgC  55.97 
 
 		 134 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0147313 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1243  flagellar basal body rod protein FlgC  55.97 
 
 		 134 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2013  flagellar basal body rod protein FlgC  55.97 
 
 		 134 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2197  flagellar basal body rod protein FlgC  55.97 
 
 		 134 aa  159  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000907371 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1588  flagellar basal body rod protein FlgC  57.46 
 
 		 134 aa  159  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  56.72 
 
 		 134 aa  157  3e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  56.72 
 
 		 134 aa  157  3e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2526  flagellar basal body rod protein FlgC  56.72 
 
 		 134 aa  157  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310597  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  56.72 
 
 		 134 aa  157  3e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  56.72 
 
 		 134 aa  157  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  56.72 
 
 		 134 aa  157  3e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  56.72 
 
 		 134 aa  157  3e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  56.72 
 
 		 134 aa  157  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3713  flagellar basal-body rod protein FlgC  56.3 
 
 		 135 aa  157  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.889388  normal  0.277072 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4790  flagellar basal-body rod protein FlgC  56.3 
 
 		 135 aa  157  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2323  flagellar basal body rod protein FlgC  57.46 
 
 		 134 aa  157  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2424  flagellar basal body rod protein FlgC  57.46 
 
 		 134 aa  157  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1999  flagellar basal body rod protein FlgC  57.46 
 
 		 134 aa  157  6e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2054  flagellar basal body rod protein FlgC  55.97 
 
 		 134 aa  156  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.224564 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1775  flagellar basal-body rod protein FlgC  59.7 
 
 		 133 aa  155  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0343  flagellar basal-body rod protein FlgC  55.56 
 
 		 135 aa  153  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.962617 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1526  flagellar basal-body rod protein FlgC  58.96 
 
 		 134 aa  152  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0894  flagellar basal-body rod protein FlgC  52 
 
 		 151 aa  150  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1977  flagellar basal-body rod protein FlgC  57.46 
 
 		 135 aa  148  3e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1636  flagellar basal-body rod protein FlgC  59.66 
 
 		 134 aa  147  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2317  flagellar basal body rod protein FlgC  53.28 
 
 		 137 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.870376  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2377  flagellar basal-body rod protein FlgC  52.55 
 
 		 137 aa  140  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1346  flagellar basal body rod protein FlgC  51.09 
 
 		 139 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1791  flagellar basal body rod protein FlgC  51.45 
 
 		 138 aa  139  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1162  flagellar basal body rod protein FlgC  50.72 
 
 		 138 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.509908  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004172  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.97 
 
 		 137 aa  137  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1304  flagellar basal body rod protein FlgC  49.28 
 
 		 138 aa  136  7.999999999999999e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1473  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.72 
 
 		 136 aa  136  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0927  flagellar basal-body rod protein FlgC  50.37 
 
 		 139 aa  136  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2596  flagellar basal body rod protein FlgC  50.72 
 
 		 138 aa  135  1e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2337  flagellar basal body rod protein FlgC  49.28 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01287  flagellar basal body rod protein FlgC  48.28 
 
 		 137 aa  135  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3086  flagellar basal body rod protein FlgC  50 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2946  flagellar basal body rod protein FlgC  51.45 
 
 		 138 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1260  flagellar basal body rod protein FlgC  51.45 
 
 		 138 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1330  flagellar basal body rod protein FlgC  51.45 
 
 		 138 aa  134  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2961  flagellar basal body rod protein FlgC  51.45 
 
 		 138 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.211432  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3099  flagellar basal body rod protein FlgC  51.45 
 
 		 138 aa  134  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1341  flagellar basal body rod protein FlgC  50 
 
 		 138 aa  134  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1478  flagellar basal-body rod protein FlgC  50.7 
 
 		 143 aa  134  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1417  flagellar basal body rod protein FlgC  51.45 
 
 		 138 aa  134  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1322  flagellar basal body rod protein FlgC  50.72 
 
 		 138 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0795532 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1934  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.26 
 
 		 146 aa  133  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3480  flagellar basal body rod protein FlgC  47.26 
 
 		 146 aa  133  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.485481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0185  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.55 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1598  flagellar basal body rod protein FlgC  49.28 
 
 		 139 aa  131  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1218  flagellar basal-body rod protein FlgC  54.74 
 
 		 139 aa  130  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.181311  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4250  flagellar basal body rod protein FlgC  47.62 
 
 		 147 aa  130  9e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.833484 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3249  flagellar basal body rod protein FlgC  49.28 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0238  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.83 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3582  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.95 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.122416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2212  flagellar basal body rod protein FlgC  47.22 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01012  flagellar basal body rod protein FlgC  50.37 
 
 		 135 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.392549  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06154  flagellar basal body rod protein FlgC  50.37 
 
 		 135 aa  127  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000293747  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1465  flagellar basal body rod protein FlgC  44.9 
 
 		 147 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2849  flagellar basal body rod protein FlgC  46.94 
 
 		 147 aa  125  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.114818 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>