More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0847 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0847  flagellar basal body rod protein  100 
 
 
155 aa  315  1e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2053  flagellar basal-body rod protein FlgC  55.48 
 
 
147 aa  164  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0463  flagellar basal-body rod protein FlgC  54.19 
 
 
147 aa  163  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1109  flagellar basal body rod protein FlgC  47.47 
 
 
150 aa  148  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151882  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1695  flagellar basal-body rod protein FlgC  50.32 
 
 
147 aa  147  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0947147  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2001  flagellar basal body rod protein FlgC  46.84 
 
 
150 aa  147  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2175  flagellar basal-body rod protein FlgC  49.34 
 
 
145 aa  145  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.869204  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16910  flagellar basal-body rod protein FlgC  49.67 
 
 
145 aa  144  4.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0769  flagellar basal-body rod protein FlgC  49.04 
 
 
145 aa  141  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197549 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1389  flagellar basal-body rod protein FlgC  50.33 
 
 
146 aa  141  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.88372 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2719  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.5 
 
 
150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.78537  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3924  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.81 
 
 
145 aa  134  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0670476 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3027  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.23 
 
 
145 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1685  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.81 
 
 
140 aa  132  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149162  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4215  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.5 
 
 
146 aa  131  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3840  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.16 
 
 
145 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1715  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.7 
 
 
138 aa  128  2.0000000000000002e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000651347  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0299  flagellar basal body rod protein FlgC  44.65 
 
 
152 aa  128  3e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2046  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.16 
 
 
137 aa  128  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3424  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.58 
 
 
145 aa  128  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4152  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.26 
 
 
176 aa  127  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0267  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.52 
 
 
141 aa  128  4.0000000000000003e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3114  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.51 
 
 
147 aa  125  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0355  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.31 
 
 
146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3306  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.52 
 
 
145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0686  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.57 
 
 
140 aa  124  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1125  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.86 
 
 
137 aa  124  5e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2666  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.71 
 
 
145 aa  124  5e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2410  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.83 
 
 
145 aa  121  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2285  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.74 
 
 
145 aa  121  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0408  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.51 
 
 
146 aa  120  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0654  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.21 
 
 
142 aa  120  7e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.294463  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0036  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.37 
 
 
149 aa  120  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584577  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2461  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.87 
 
 
140 aa  120  8e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0105073  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1575  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.29 
 
 
145 aa  120  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1396  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.23 
 
 
140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00396064  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2557  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.23 
 
 
140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0110618  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1673  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.46 
 
 
163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1339  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.87 
 
 
139 aa  118  3e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00198862  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1464  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.33 
 
 
140 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1418  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.33 
 
 
140 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0750  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.04 
 
 
137 aa  117  7e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0364  flagellar basal body rod protein FlgC  39.88 
 
 
164 aa  117  7.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2526  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.91 
 
 
153 aa  116  9e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1403  flagellar basal body rod protein FlgC  39.77 
 
 
164 aa  115  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.144667  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0552  flagellar basal body rod protein FlgC  39.2 
 
 
164 aa  114  6e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1194  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.06 
 
 
143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2212  flagellar basal body rod protein FlgC  41.29 
 
 
144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0631  flagellar basal body rod protein FlgC  38.64 
 
 
164 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.662451  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1387  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.33 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1066  flagellar basal body rod protein FlgC  39.02 
 
 
164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1767  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.29 
 
 
139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.236631  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2923  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.35 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2969  flagellar basal body rod protein FlgC  41.03 
 
 
134 aa  108  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134298  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0692  flagellar basal body rod protein FlgC  36.21 
 
 
167 aa  108  3e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0705  flagellar basal body rod protein FlgC  36.21 
 
 
164 aa  108  3e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0057  flagellar basal body rod protein FlgC  36.69 
 
 
166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.223353  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2733  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.71 
 
 
136 aa  107  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108424 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3735  flagellar basal body rod protein FlgC  39.35 
 
 
135 aa  107  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3072  flagellar basal body rod protein  39.35 
 
 
138 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.103316 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1213  flagellar basal body rod protein FlgC  38.99 
 
 
151 aa  107  9.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0426  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.77 
 
 
139 aa  106  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.651344  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1955  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.35 
 
 
135 aa  106  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4421  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.99 
 
 
134 aa  105  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2054  flagellar basal body rod protein FlgC  38.46 
 
 
134 aa  105  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.224564 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1304  flagellar basal body rod protein FlgC  36.94 
 
 
138 aa  105  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  38.46 
 
 
134 aa  104  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2526  flagellar basal body rod protein FlgC  38.46 
 
 
134 aa  104  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310597  normal  0.0167576 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.46 
 
 
134 aa  104  4e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  38.46 
 
 
134 aa  104  4e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  38.46 
 
 
134 aa  104  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3249  flagellar basal body rod protein FlgC  38.85 
 
 
138 aa  104  4e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  38.46 
 
 
134 aa  104  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  38.46 
 
 
134 aa  104  4e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  38.46 
 
 
134 aa  104  4e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3326  flagellar basal body rod protein FlgC  36.6 
 
 
141 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0463  flagellar basal body rod protein FlgC  36.6 
 
 
141 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0279  flagellar basal body rod protein FlgC  36.6 
 
 
141 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3353  flagellar basal body rod protein FlgC  36.6 
 
 
141 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2995  flagellar basal body rod protein FlgC  36.6 
 
 
141 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0267  flagellar basal body rod protein FlgC  36.6 
 
 
141 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191189  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2098  flagellar basal body rod protein FlgC  36.6 
 
 
141 aa  104  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0568  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.82 
 
 
134 aa  104  6e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0927  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.61 
 
 
139 aa  103  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1465  flagellar basal body rod protein FlgC  37.58 
 
 
147 aa  103  8e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0343  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.11 
 
 
135 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.962617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3951  flagellar basal body rod protein FlgC  37.58 
 
 
147 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  40.38 
 
 
134 aa  103  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2317  flagellar basal body rod protein FlgC  38.22 
 
 
137 aa  103  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.870376  normal  0.36477 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2596  flagellar basal body rod protein FlgC  38.22 
 
 
138 aa  102  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3086  flagellar basal body rod protein FlgC  37.58 
 
 
138 aa  102  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1554  flagellar basal body rod protein FlgC  39.74 
 
 
134 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4790  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.42 
 
 
135 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3713  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.42 
 
 
135 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.889388  normal  0.277072 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1588  flagellar basal body rod protein FlgC  37.82 
 
 
134 aa  102  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2424  flagellar basal body rod protein FlgC  39.1 
 
 
134 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27738  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2323  flagellar basal body rod protein FlgC  39.1 
 
 
134 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1654  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.91 
 
 
145 aa  102  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105291  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1999  flagellar basal body rod protein FlgC  39.1 
 
 
134 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1103  flagellar basal body rod protein FlgC  39.38 
 
 
149 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>