More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2053 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2053  flagellar basal-body rod protein FlgC  100 
 
 
147 aa  299  8.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0463  flagellar basal-body rod protein FlgC  68.71 
 
 
147 aa  218  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2175  flagellar basal-body rod protein FlgC  63.95 
 
 
145 aa  189  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.869204  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2719  flagellar basal-body rod protein FlgC  62.25 
 
 
150 aa  182  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.78537  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16910  flagellar basal-body rod protein FlgC  60 
 
 
145 aa  176  1e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1695  flagellar basal-body rod protein FlgC  59.46 
 
 
147 aa  174  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0947147  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1109  flagellar basal body rod protein FlgC  59.87 
 
 
150 aa  170  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151882  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0847  flagellar basal body rod protein  55.48 
 
 
155 aa  164  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0769  flagellar basal-body rod protein FlgC  54.55 
 
 
145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197549 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0036  flagellar basal-body rod protein FlgC  52.7 
 
 
149 aa  161  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584577  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2001  flagellar basal body rod protein FlgC  55.26 
 
 
150 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1685  flagellar basal-body rod protein FlgC  54.79 
 
 
140 aa  162  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149162  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0408  flagellar basal-body rod protein FlgC  52.74 
 
 
146 aa  161  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4152  flagellar basal-body rod protein FlgC  52 
 
 
176 aa  159  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1389  flagellar basal-body rod protein FlgC  56.76 
 
 
146 aa  157  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.88372 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3114  flagellar basal-body rod protein FlgC  50.34 
 
 
147 aa  155  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0267  flagellar basal-body rod protein FlgC  53.06 
 
 
141 aa  155  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3424  flagellar basal-body rod protein FlgC  51.02 
 
 
145 aa  154  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3027  flagellar basal-body rod protein FlgC  49.66 
 
 
145 aa  154  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1715  flagellar basal-body rod protein FlgC  52.78 
 
 
138 aa  151  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000651347  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0654  flagellar basal-body rod protein FlgC  50.68 
 
 
142 aa  150  5.9999999999999996e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.294463  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4215  flagellar basal-body rod protein FlgC  50.34 
 
 
146 aa  150  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3840  flagellar basal-body rod protein FlgC  49.66 
 
 
145 aa  149  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2666  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.3 
 
 
145 aa  147  5e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3306  flagellar basal-body rod protein FlgC  49.66 
 
 
145 aa  147  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1575  flagellar basal-body rod protein FlgC  51.02 
 
 
145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0299  flagellar basal body rod protein FlgC  49.33 
 
 
152 aa  145  1.0000000000000001e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1125  flagellar basal-body rod protein FlgC  49.66 
 
 
137 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1194  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.94 
 
 
143 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3924  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.98 
 
 
145 aa  143  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0670476 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1464  flagellar basal-body rod protein FlgC  49.66 
 
 
140 aa  143  8.000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1418  flagellar basal-body rod protein FlgC  49.66 
 
 
140 aa  143  8.000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0355  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.94 
 
 
146 aa  142  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2526  flagellar basal-body rod protein FlgC  50.67 
 
 
153 aa  140  7e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2410  flagellar basal-body rod protein FlgC  51.33 
 
 
145 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0705  flagellar basal body rod protein FlgC  42.94 
 
 
164 aa  136  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1673  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.56 
 
 
163 aa  136  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1554  flagellar basal body rod protein FlgC  48.3 
 
 
134 aa  135  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1767  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.26 
 
 
139 aa  134  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.236631  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1644  flagellar basal-body rod protein FlgC  46.85 
 
 
136 aa  133  6.0000000000000005e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000317866  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0343  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.95 
 
 
135 aa  133  9e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.962617 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2597  flagellar basal body rod protein FlgC  46.94 
 
 
134 aa  132  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2969  flagellar basal body rod protein FlgC  45.58 
 
 
134 aa  131  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134298  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  46.26 
 
 
134 aa  131  3e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0686  flagellar basal-body rod protein FlgC  48.3 
 
 
140 aa  131  3e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3713  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.95 
 
 
135 aa  130  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.889388  normal  0.277072 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4790  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.95 
 
 
135 aa  130  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2285  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.5 
 
 
145 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2461  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.58 
 
 
140 aa  130  9e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0105073  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2557  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.58 
 
 
140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0110618  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2046  flagellar basal-body rod protein FlgC  47.62 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1396  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.58 
 
 
140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00396064  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2934  flagellar basal body rod protein FlgC  45.89 
 
 
141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.725751 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3069  flagellar basal body rod protein FlgC  45.89 
 
 
141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2424  flagellar basal body rod protein FlgC  44.9 
 
 
134 aa  128  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27738  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4198  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.58 
 
 
138 aa  128  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2323  flagellar basal body rod protein FlgC  44.9 
 
 
134 aa  128  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1999  flagellar basal body rod protein FlgC  44.9 
 
 
134 aa  128  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2410  flagellar basal body rod protein FlgC  45.89 
 
 
141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642225  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3019  flagellar basal body rod protein FlgC  45.89 
 
 
141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3043  flagellar basal body rod protein FlgC  45.89 
 
 
141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3024  flagellar basal body rod protein FlgC  45.89 
 
 
141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0826465  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1339  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.52 
 
 
139 aa  128  3e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00198862  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0364  flagellar basal body rod protein FlgC  44.65 
 
 
164 aa  128  3e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1588  flagellar basal body rod protein FlgC  46.26 
 
 
134 aa  128  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1322  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.86 
 
 
139 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0057  flagellar basal body rod protein FlgC  40.99 
 
 
166 aa  127  5.0000000000000004e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.223353  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0750  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.9 
 
 
137 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6370  flagellar basal body rod protein FlgC  45.21 
 
 
141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130671  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1955  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.97 
 
 
135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1213  flagellar basal body rod protein FlgC  41.06 
 
 
151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2197  flagellar basal body rod protein FlgC  42.86 
 
 
134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000907371 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0552  flagellar basal body rod protein FlgC  40.72 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1287  flagellar basal body rod protein FlgC  42.86 
 
 
134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158589  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1272  flagellar basal body rod protein FlgC  42.86 
 
 
134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0147313 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2013  flagellar basal body rod protein FlgC  42.86 
 
 
134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1243  flagellar basal body rod protein FlgC  42.86 
 
 
134 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.136265 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  44.22 
 
 
134 aa  125  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.22 
 
 
134 aa  125  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2054  flagellar basal body rod protein FlgC  44.22 
 
 
134 aa  124  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.224564 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0631  flagellar basal body rod protein FlgC  40.72 
 
 
164 aa  124  3e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.662451  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2526  flagellar basal body rod protein FlgC  44.22 
 
 
134 aa  125  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310597  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  44.22 
 
 
134 aa  125  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  44.22 
 
 
134 aa  125  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  44.22 
 
 
134 aa  125  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  44.22 
 
 
134 aa  125  3e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  44.22 
 
 
134 aa  125  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2995  flagellar basal body rod protein FlgC  44.52 
 
 
141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0267  flagellar basal body rod protein FlgC  44.52 
 
 
141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191189  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3326  flagellar basal body rod protein FlgC  44.52 
 
 
141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0463  flagellar basal body rod protein FlgC  44.52 
 
 
141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0279  flagellar basal body rod protein FlgC  44.52 
 
 
141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1387  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.45 
 
 
144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3353  flagellar basal body rod protein FlgC  44.52 
 
 
141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2098  flagellar basal body rod protein FlgC  44.52 
 
 
141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1357  flagellar basal body rod protein FlgC  46.21 
 
 
137 aa  124  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0426  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.86 
 
 
139 aa  123  7e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.651344  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0241  flagellar basal body rod protein FlgC  45.21 
 
 
141 aa  123  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2949  flagellar basal body rod protein FlgC  44.52 
 
 
141 aa  122  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.741203  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1654  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.5 
 
 
145 aa  123  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.105291  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>