260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2830 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2830  flagellar basal body rod protein FlgC  100 
 
 
136 aa  276  7e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.172073  normal  0.232346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2607  flagellar basal body rod protein FlgC  100 
 
 
136 aa  276  7e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122012  normal  0.267532 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2637  flagellar basal body rod protein FlgC  96.32 
 
 
136 aa  265  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.296466  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5537  flagellar basal body rod protein FlgC  77.04 
 
 
136 aa  223  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132652  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5154  flagellar basal body rod protein FlgC  74.07 
 
 
136 aa  213  7e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205426  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2234  flagellar basal body rod protein FlgC  73.33 
 
 
135 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1393  flagellar basal body rod protein FlgC  67.41 
 
 
141 aa  196  6e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0993913  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1518  flagellar basal body rod protein FlgC  69.12 
 
 
141 aa  196  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0198818  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1133  flagellar basal body rod protein FlgC  67.41 
 
 
141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.886301  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1694  flagellar basal body rod protein FlgC  68.15 
 
 
141 aa  194  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4410  flagellar basal body rod protein FlgC  68.15 
 
 
141 aa  193  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.541352  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3776  flagellar basal body rod protein FlgC  68.15 
 
 
141 aa  192  9e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0600625  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5496  flagellar basal body rod protein FlgC  67.16 
 
 
141 aa  190  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839426  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2571  flagellar basal body rod protein FlgC  64.44 
 
 
139 aa  186  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2825  flagellar basal body rod protein FlgC  58.39 
 
 
137 aa  158  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1367  flagellar basal body rod protein FlgC  57.58 
 
 
140 aa  151  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3438  flagellar basal body rod protein FlgC  49.63 
 
 
135 aa  150  8e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1691  flagellar basal body rod protein FlgC  57.48 
 
 
138 aa  147  4e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.132509  normal  0.0178 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1937  flagellar basal body rod protein FlgC  53.08 
 
 
137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.123234  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2133  flagellar basal body rod protein FlgC  48.51 
 
 
134 aa  142  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4211  flagellar basal body rod protein FlgC  52.94 
 
 
140 aa  142  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0152  flagellar basal body rod protein FlgC  52.94 
 
 
140 aa  142  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0136  flagellar basal body rod protein FlgC  52.94 
 
 
140 aa  142  2e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.06608  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0025  flagellar basal body rod protein FlgC  52.67 
 
 
140 aa  141  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0256  flagellar basal body rod protein FlgC  53.28 
 
 
139 aa  141  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3655  flagellar basal body rod protein FlgC  51.09 
 
 
138 aa  140  6e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.633505  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0737  flagellar basal body rod protein FlgC  52.67 
 
 
145 aa  140  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0318  flagellar basal body rod protein FlgC  52.55 
 
 
138 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.783853  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1095  flagellar basal body rod protein FlgC  50 
 
 
139 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0350  flagellar basal body rod protein FlgC  52.55 
 
 
138 aa  135  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.121375 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0597  flagellar basal body rod protein FlgC  48.51 
 
 
138 aa  135  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3674  flagellar basal body rod protein FlgC  50 
 
 
138 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00523112 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0297  flagellar basal body rod protein FlgC  48.18 
 
 
139 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1143  flagellar basal body rod protein FlgC  47.24 
 
 
137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0619  flagellar basal body rod protein FlgC  49.25 
 
 
138 aa  121  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.017127  normal  0.0984024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0630  flagellar basal body rod protein FlgC  49.25 
 
 
138 aa  121  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.652584  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1418  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.15 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2964  flagellar basal body rod protein FlgC  46.27 
 
 
130 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.796607  normal  0.243642 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1464  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.15 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1644  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.18 
 
 
136 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000317866  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0267  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.29 
 
 
141 aa  108  3e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2175  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.45 
 
 
145 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.869204  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3840  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.04 
 
 
145 aa  104  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1125  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.18 
 
 
137 aa  103  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1109  flagellar basal body rod protein FlgC  41.33 
 
 
150 aa  102  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151882  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16910  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.96 
 
 
145 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2053  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.24 
 
 
147 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0769  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.58 
 
 
145 aa  101  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197549 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1715  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.98 
 
 
138 aa  101  4e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000651347  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2001  flagellar basal body rod protein FlgC  41.33 
 
 
150 aa  100  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1685  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.48 
 
 
140 aa  100  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149162  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1695  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.38 
 
 
147 aa  99.8  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0947147  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0944  flagellar basal body rod protein FlgC  42.28 
 
 
136 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.255907  normal  0.801291 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0705  flagellar basal body rod protein FlgC  35.37 
 
 
164 aa  99.4  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0408  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.28 
 
 
146 aa  98.6  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4215  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.69 
 
 
146 aa  97.1  8e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3924  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.04 
 
 
145 aa  96.7  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0670476 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1194  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.03 
 
 
143 aa  96.7  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3114  flagellar basal-body rod protein FlgC  40 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4075  protein of unknown function DUF1078 domain protein  45.69 
 
 
113 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.402367 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0036  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.33 
 
 
149 aa  95.5  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584577  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0654  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.59 
 
 
142 aa  95.5  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.294463  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3424  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.36 
 
 
145 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0463  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.04 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2949  flagellar basal body rod protein FlgC  37.96 
 
 
141 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.741203  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3027  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.11 
 
 
145 aa  94  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  39.1 
 
 
134 aa  93.6  8e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3019  flagellar basal body rod protein FlgC  39.42 
 
 
141 aa  93.6  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2597  flagellar basal body rod protein FlgC  39.1 
 
 
134 aa  93.6  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4790  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.55 
 
 
135 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3043  flagellar basal body rod protein FlgC  37.23 
 
 
141 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1554  flagellar basal body rod protein FlgC  39.1 
 
 
134 aa  93.2  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2410  flagellar basal body rod protein FlgC  37.23 
 
 
141 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642225  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3024  flagellar basal body rod protein FlgC  37.23 
 
 
141 aa  93.2  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0826465  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2666  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.89 
 
 
145 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1767  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.15 
 
 
139 aa  92.8  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.236631  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3713  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.55 
 
 
135 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.889388  normal  0.277072 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1330  flagellar basal body rod protein FlgC  39.55 
 
 
128 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0355  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.99 
 
 
146 aa  92  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0141  flagellar basal body rod protein FlgC  38.69 
 
 
141 aa  92  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.899584 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3248  flagellar basal body rod protein FlgC  39.55 
 
 
130 aa  92  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.893989  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2991  flagellar basal body rod protein FlgC  39.55 
 
 
126 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0343  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.81 
 
 
135 aa  91.7  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.962617 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2323  flagellar basal body rod protein FlgC  39.1 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2424  flagellar basal body rod protein FlgC  39.1 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27738  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6370  flagellar basal body rod protein FlgC  36.5 
 
 
141 aa  92  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130671  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2934  flagellar basal body rod protein FlgC  36.5 
 
 
141 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.725751 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3069  flagellar basal body rod protein FlgC  36.5 
 
 
141 aa  92  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1999  flagellar basal body rod protein FlgC  39.1 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4198  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.58 
 
 
138 aa  91.3  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3793  flagellar basal body rod protein FlgC  37.96 
 
 
141 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1636  flagellar basal-body rod protein FlgC  40 
 
 
134 aa  90.9  6e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0299  flagellar basal body rod protein FlgC  34.64 
 
 
152 aa  89  2e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2969  flagellar basal body rod protein FlgC  38.35 
 
 
134 aa  89  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134298  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0463  flagellar basal body rod protein FlgC  36.64 
 
 
141 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1389  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.11 
 
 
146 aa  88.6  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.88372 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2098  flagellar basal body rod protein FlgC  36.64 
 
 
141 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0267  flagellar basal body rod protein FlgC  36.64 
 
 
141 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191189  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0279  flagellar basal body rod protein FlgC  36.64 
 
 
141 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3353  flagellar basal body rod protein FlgC  36.64 
 
 
141 aa  88.6  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>