264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3438 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_3438  flagellar basal body rod protein FlgC  100 
 
 
135 aa  281  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2133  flagellar basal body rod protein FlgC  55.97 
 
 
134 aa  166  7e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0025  flagellar basal body rod protein FlgC  53.08 
 
 
140 aa  155  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0597  flagellar basal body rod protein FlgC  51.97 
 
 
138 aa  150  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2571  flagellar basal body rod protein FlgC  52.59 
 
 
139 aa  150  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1691  flagellar basal body rod protein FlgC  52.76 
 
 
138 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.132509  normal  0.0178 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2607  flagellar basal body rod protein FlgC  49.63 
 
 
136 aa  150  8e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122012  normal  0.267532 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2830  flagellar basal body rod protein FlgC  49.63 
 
 
136 aa  150  8e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.172073  normal  0.232346 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3655  flagellar basal body rod protein FlgC  49.23 
 
 
138 aa  150  8e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.633505  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2637  flagellar basal body rod protein FlgC  49.63 
 
 
136 aa  149  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.296466  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0136  flagellar basal body rod protein FlgC  48.12 
 
 
140 aa  148  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.06608  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0318  flagellar basal body rod protein FlgC  51.88 
 
 
138 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.783853  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1095  flagellar basal body rod protein FlgC  50.77 
 
 
139 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0737  flagellar basal body rod protein FlgC  49.62 
 
 
145 aa  148  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5537  flagellar basal body rod protein FlgC  49.63 
 
 
136 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132652  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0152  flagellar basal body rod protein FlgC  47.37 
 
 
140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0350  flagellar basal body rod protein FlgC  50.38 
 
 
138 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.121375 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4211  flagellar basal body rod protein FlgC  45.86 
 
 
140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1937  flagellar basal body rod protein FlgC  47.73 
 
 
137 aa  144  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.123234  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0256  flagellar basal body rod protein FlgC  47.37 
 
 
139 aa  144  6e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1518  flagellar basal body rod protein FlgC  48.89 
 
 
141 aa  143  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0198818  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2234  flagellar basal body rod protein FlgC  47.41 
 
 
135 aa  142  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2825  flagellar basal body rod protein FlgC  46.27 
 
 
137 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5154  flagellar basal body rod protein FlgC  48.89 
 
 
136 aa  141  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205426  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0619  flagellar basal body rod protein FlgC  54.33 
 
 
138 aa  140  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.017127  normal  0.0984024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0630  flagellar basal body rod protein FlgC  54.33 
 
 
138 aa  140  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.652584  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3776  flagellar basal body rod protein FlgC  47.01 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0600625  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5496  flagellar basal body rod protein FlgC  47.76 
 
 
141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839426  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1694  flagellar basal body rod protein FlgC  45.52 
 
 
141 aa  137  6e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3674  flagellar basal body rod protein FlgC  48.82 
 
 
138 aa  136  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00523112 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4410  flagellar basal body rod protein FlgC  45.52 
 
 
141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.541352  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1393  flagellar basal body rod protein FlgC  47.01 
 
 
141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0993913  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1143  flagellar basal body rod protein FlgC  49.61 
 
 
137 aa  133  9.999999999999999e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0297  flagellar basal body rod protein FlgC  45.86 
 
 
139 aa  130  5e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1367  flagellar basal body rod protein FlgC  45.38 
 
 
140 aa  130  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1133  flagellar basal body rod protein FlgC  44.03 
 
 
141 aa  127  6e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.886301  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2964  flagellar basal body rod protein FlgC  42.54 
 
 
130 aa  115  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.796607  normal  0.243642 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1955  flagellar basal-body rod protein FlgC  44.03 
 
 
135 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3924  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.73 
 
 
145 aa  108  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0670476 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2175  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.28 
 
 
145 aa  107  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.869204  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1685  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.91 
 
 
140 aa  107  8.000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149162  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1125  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.64 
 
 
137 aa  105  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3248  flagellar basal body rod protein FlgC  41.04 
 
 
130 aa  105  2e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.893989  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1644  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.69 
 
 
136 aa  105  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000317866  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3840  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.04 
 
 
145 aa  104  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0408  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.58 
 
 
146 aa  103  8e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0769  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.81 
 
 
145 aa  102  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197549 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0036  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.66 
 
 
149 aa  102  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584577  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0267  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.71 
 
 
141 aa  100  6e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3424  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.67 
 
 
145 aa  100  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  37.59 
 
 
134 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.59 
 
 
134 aa  100  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2054  flagellar basal body rod protein FlgC  37.59 
 
 
134 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.224564 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  37.59 
 
 
134 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  37.59 
 
 
134 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  37.59 
 
 
134 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1418  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.59 
 
 
140 aa  99.4  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2053  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.16 
 
 
147 aa  99.8  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  37.59 
 
 
134 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1464  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.59 
 
 
140 aa  99.4  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2526  flagellar basal body rod protein FlgC  37.59 
 
 
134 aa  100  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310597  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  37.59 
 
 
134 aa  100  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16910  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.17 
 
 
145 aa  99.4  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1554  flagellar basal body rod protein FlgC  36.09 
 
 
134 aa  98.2  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1322  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.78 
 
 
139 aa  98.6  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0705  flagellar basal body rod protein FlgC  33.54 
 
 
164 aa  98.6  3e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0750  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.74 
 
 
137 aa  97.8  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2597  flagellar basal body rod protein FlgC  33.83 
 
 
134 aa  97.8  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2013  flagellar basal body rod protein FlgC  36.84 
 
 
134 aa  97.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1287  flagellar basal body rod protein FlgC  36.84 
 
 
134 aa  97.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158589  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1243  flagellar basal body rod protein FlgC  36.84 
 
 
134 aa  97.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1272  flagellar basal body rod protein FlgC  36.84 
 
 
134 aa  97.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0147313 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2197  flagellar basal body rod protein FlgC  36.84 
 
 
134 aa  97.4  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000907371 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  33.83 
 
 
134 aa  97.8  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1715  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.8 
 
 
138 aa  97.1  7e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000651347  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4198  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.88 
 
 
138 aa  96.7  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1695  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.86 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0947147  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3043  flagellar basal body rod protein FlgC  35.56 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6370  flagellar basal body rod protein FlgC  35.56 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130671  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3735  flagellar basal body rod protein FlgC  38.89 
 
 
135 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2410  flagellar basal body rod protein FlgC  35.56 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642225  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3024  flagellar basal body rod protein FlgC  35.56 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0826465  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1588  flagellar basal body rod protein FlgC  35.34 
 
 
134 aa  95.1  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1330  flagellar basal body rod protein FlgC  41.04 
 
 
128 aa  95.1  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3019  flagellar basal body rod protein FlgC  35.56 
 
 
141 aa  94.7  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0847  flagellar basal body rod protein  33.99 
 
 
155 aa  95.1  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0426  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.14 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.651344  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0364  flagellar basal body rod protein FlgC  33.74 
 
 
164 aa  94.4  4e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3069  flagellar basal body rod protein FlgC  34.81 
 
 
141 aa  94.4  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2949  flagellar basal body rod protein FlgC  37.4 
 
 
141 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.741203  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2991  flagellar basal body rod protein FlgC  40.3 
 
 
126 aa  94.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2934  flagellar basal body rod protein FlgC  34.81 
 
 
141 aa  94.4  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.725751 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1109  flagellar basal body rod protein FlgC  34.67 
 
 
150 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151882  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0057  flagellar basal body rod protein FlgC  33.13 
 
 
166 aa  94.4  5e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.223353  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0463  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.19 
 
 
147 aa  94.4  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2424  flagellar basal body rod protein FlgC  35.34 
 
 
134 aa  94  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27738  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2323  flagellar basal body rod protein FlgC  35.34 
 
 
134 aa  94  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1999  flagellar basal body rod protein FlgC  35.34 
 
 
134 aa  94  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3027  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.62 
 
 
145 aa  94  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2046  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.97 
 
 
137 aa  94  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>