259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1393 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1393  flagellar basal body rod protein FlgC  100 
 
 		 141 aa  286  8e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0993913  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1133  flagellar basal body rod protein FlgC  94.33 
 
 		 141 aa  272  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.886301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4410  flagellar basal body rod protein FlgC  85.11 
 
 		 141 aa  253  9e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.541352  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3776  flagellar basal body rod protein FlgC  84.4 
 
 		 141 aa  251  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0600625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1518  flagellar basal body rod protein FlgC  85.82 
 
 		 141 aa  249  7e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0198818  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5496  flagellar basal body rod protein FlgC  86.52 
 
 		 141 aa  249  8.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1694  flagellar basal body rod protein FlgC  81.56 
 
 		 141 aa  246  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5537  flagellar basal body rod protein FlgC  71.64 
 
 		 136 aa  199  9e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132652  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2830  flagellar basal body rod protein FlgC  67.41 
 
 		 136 aa  196  6e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.172073  normal  0.232346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2607  flagellar basal body rod protein FlgC  67.41 
 
 		 136 aa  196  6e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122012  normal  0.267532 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2637  flagellar basal body rod protein FlgC  66.67 
 
 		 136 aa  196  9e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.296466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5154  flagellar basal body rod protein FlgC  67.91 
 
 		 136 aa  191  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205426  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2571  flagellar basal body rod protein FlgC  61.94 
 
 		 139 aa  176  7e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2234  flagellar basal body rod protein FlgC  61.19 
 
 		 135 aa  175  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2825  flagellar basal body rod protein FlgC  57.04 
 
 		 137 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1937  flagellar basal body rod protein FlgC  57.69 
 
 		 137 aa  158  3e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.123234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1367  flagellar basal body rod protein FlgC  57.58 
 
 		 140 aa  154  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3674  flagellar basal body rod protein FlgC  54.2 
 
 		 138 aa  150  7e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523112 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0737  flagellar basal body rod protein FlgC  54.2 
 
 		 145 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0597  flagellar basal body rod protein FlgC  56.25 
 
 		 138 aa  147  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0318  flagellar basal body rod protein FlgC  55.73 
 
 		 138 aa  147  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.783853  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1691  flagellar basal body rod protein FlgC  55.12 
 
 		 138 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.132509  normal  0.0178 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1095  flagellar basal body rod protein FlgC  51.54 
 
 		 139 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0025  flagellar basal body rod protein FlgC  51.91 
 
 		 140 aa  144  3e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0350  flagellar basal body rod protein FlgC  54.96 
 
 		 138 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.121375 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4211  flagellar basal body rod protein FlgC  51.15 
 
 		 140 aa  141  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0256  flagellar basal body rod protein FlgC  49.62 
 
 		 139 aa  140  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1143  flagellar basal body rod protein FlgC  48.12 
 
 		 137 aa  140  7e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0136  flagellar basal body rod protein FlgC  51.15 
 
 		 140 aa  138  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.06608  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0152  flagellar basal body rod protein FlgC  51.15 
 
 		 140 aa  138  3e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0297  flagellar basal body rod protein FlgC  50.38 
 
 		 139 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3655  flagellar basal body rod protein FlgC  51.15 
 
 		 138 aa  137  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.633505  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3438  flagellar basal body rod protein FlgC  47.01 
 
 		 135 aa  134  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2133  flagellar basal body rod protein FlgC  46.21 
 
 		 134 aa  134  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0619  flagellar basal body rod protein FlgC  56.25 
 
 		 138 aa  130  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.017127  normal  0.0984024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0630  flagellar basal body rod protein FlgC  56.25 
 
 		 138 aa  130  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.652584  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2964  flagellar basal body rod protein FlgC  42.96 
 
 		 130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.796607  normal  0.243642 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3924  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.69 
 
 		 145 aa  105  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0670476 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1464  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.22 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1418  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.22 
 
 		 140 aa  105  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3840  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.69 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1125  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.08 
 
 		 137 aa  105  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1715  flagellar basal-body rod protein FlgC  45.8 
 
 		 138 aa  102  2e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000651347  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0944  flagellar basal body rod protein FlgC  40.98 
 
 		 136 aa  101  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.255907  normal  0.801291 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0267  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.85 
 
 		 141 aa  100  5e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4075  protein of unknown function DUF1078 domain protein  46.55 
 
 		 113 aa  100  5e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.402367 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1685  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.74 
 
 		 140 aa  100  8e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149162  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1695  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.28 
 
 		 147 aa  97.8  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0947147  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3027  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.16 
 
 		 145 aa  97.1  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1644  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.04 
 
 		 136 aa  96.7  9e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000317866  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3248  flagellar basal body rod protein FlgC  40.74 
 
 		 130 aa  96.7  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.893989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1194  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.59 
 
 		 143 aa  96.7  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1330  flagellar basal body rod protein FlgC  41.79 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3424  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.62 
 
 		 145 aa  95.5  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2991  flagellar basal body rod protein FlgC  41.79 
 
 		 126 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1109  flagellar basal body rod protein FlgC  38.78 
 
 		 150 aa  95.1  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00151882  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2175  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.16 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.869204  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0769  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.66 
 
 		 145 aa  94  6e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197549 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0408  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.56 
 
 		 146 aa  93.6  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1767  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.48 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.236631  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3114  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.5 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0355  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.99 
 
 		 146 aa  92  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4197  flagellar basal body rod protein FlgC  39.71 
 
 		 130 aa  92  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3735  flagellar basal body rod protein FlgC  42.54 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4215  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.19 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2601  flagellar basal body rod protein FlgC  43.09 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.773402  hitchhiker  0.000553357 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1673  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.33 
 
 		 163 aa  90.9  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4198  flagellar basal-body rod protein FlgC  40 
 
 		 138 aa  90.9  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0631  flagellar basal body rod protein FlgC  33.33 
 
 		 164 aa  90.1  8e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.662451  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0552  flagellar basal body rod protein FlgC  33.33 
 
 		 164 aa  90.5  8e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16910  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.06 
 
 		 145 aa  90.5  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2666  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.06 
 
 		 145 aa  90.1  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1575  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.14 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1389  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.73 
 
 		 146 aa  88.6  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.88372 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1403  flagellar basal body rod protein FlgC  32.72 
 
 		 164 aa  88.2  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.144667  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2046  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.07 
 
 		 137 aa  88.2  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2001  flagellar basal body rod protein FlgC  39.19 
 
 		 150 aa  88.2  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0686  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.38 
 
 		 140 aa  87.4  6e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2719  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.41 
 
 		 150 aa  87  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.78537  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1339  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.13 
 
 		 139 aa  87  8e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00198862  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  37.4 
 
 		 134 aa  87  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1999  flagellar basal body rod protein FlgC  37.4 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2424  flagellar basal body rod protein FlgC  37.4 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27738  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2323  flagellar basal body rod protein FlgC  37.4 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2597  flagellar basal body rod protein FlgC  37.4 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0299  flagellar basal body rod protein FlgC  35.76 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3306  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.93 
 
 		 145 aa  86.3  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0343  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.39 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.778917  normal  0.962617 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3326  flagellar basal body rod protein FlgC  37.23 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0463  flagellar basal body rod protein FlgC  37.23 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1066  flagellar basal body rod protein FlgC  31.48 
 
 		 164 aa  85.5  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3713  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.64 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.889388  normal  0.277072 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1955  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.5 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4790  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.64 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2111  flagellar basal body rod protein FlgC  37.12 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2995  flagellar basal body rod protein FlgC  37.23 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2098  flagellar basal body rod protein FlgC  37.23 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0267  flagellar basal body rod protein FlgC  37.23 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191189  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0279  flagellar basal body rod protein FlgC  37.23 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3353  flagellar basal body rod protein FlgC  37.23 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>