265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0025 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0025  flagellar basal body rod protein FlgC  100 
 
 		 140 aa  281  1.0000000000000001e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3655  flagellar basal body rod protein FlgC  71.74 
 
 		 138 aa  224  4e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.633505  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1095  flagellar basal body rod protein FlgC  68.35 
 
 		 139 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0737  flagellar basal body rod protein FlgC  70.07 
 
 		 145 aa  209  1e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0318  flagellar basal body rod protein FlgC  70.07 
 
 		 138 aa  206  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.783853  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0597  flagellar basal body rod protein FlgC  68.12 
 
 		 138 aa  203  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1691  flagellar basal body rod protein FlgC  69.34 
 
 		 138 aa  202  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.132509  normal  0.0178 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0350  flagellar basal body rod protein FlgC  68.61 
 
 		 138 aa  202  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.121375 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0256  flagellar basal body rod protein FlgC  67.39 
 
 		 139 aa  199  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3674  flagellar basal body rod protein FlgC  68.12 
 
 		 138 aa  198  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523112 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0630  flagellar basal body rod protein FlgC  68.84 
 
 		 138 aa  190  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.652584  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0619  flagellar basal body rod protein FlgC  68.84 
 
 		 138 aa  190  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.017127  normal  0.0984024 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4211  flagellar basal body rod protein FlgC  61.31 
 
 		 140 aa  185  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0297  flagellar basal body rod protein FlgC  64.49 
 
 		 139 aa  185  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0136  flagellar basal body rod protein FlgC  61.31 
 
 		 140 aa  183  6e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.06608  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0152  flagellar basal body rod protein FlgC  61.31 
 
 		 140 aa  183  7e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1143  flagellar basal body rod protein FlgC  59.85 
 
 		 137 aa  169  1e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3438  flagellar basal body rod protein FlgC  53.08 
 
 		 135 aa  155  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2133  flagellar basal body rod protein FlgC  51.16 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1518  flagellar basal body rod protein FlgC  54.2 
 
 		 141 aa  147  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0198818  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1133  flagellar basal body rod protein FlgC  52.67 
 
 		 141 aa  147  5e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.886301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1393  flagellar basal body rod protein FlgC  51.91 
 
 		 141 aa  144  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0993913  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2637  flagellar basal body rod protein FlgC  52.67 
 
 		 136 aa  143  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.296466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2830  flagellar basal body rod protein FlgC  52.67 
 
 		 136 aa  141  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.172073  normal  0.232346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2607  flagellar basal body rod protein FlgC  52.67 
 
 		 136 aa  141  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122012  normal  0.267532 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5496  flagellar basal body rod protein FlgC  51.91 
 
 		 141 aa  141  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5154  flagellar basal body rod protein FlgC  55.38 
 
 		 136 aa  141  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205426  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5537  flagellar basal body rod protein FlgC  51.18 
 
 		 136 aa  140  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132652  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1937  flagellar basal body rod protein FlgC  46.92 
 
 		 137 aa  139  9e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.123234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4410  flagellar basal body rod protein FlgC  50.38 
 
 		 141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.541352  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2571  flagellar basal body rod protein FlgC  49.62 
 
 		 139 aa  138  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2825  flagellar basal body rod protein FlgC  46.72 
 
 		 137 aa  137  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1694  flagellar basal body rod protein FlgC  49.62 
 
 		 141 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3776  flagellar basal body rod protein FlgC  49.62 
 
 		 141 aa  135  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0600625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2234  flagellar basal body rod protein FlgC  49.23 
 
 		 135 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1367  flagellar basal body rod protein FlgC  44.27 
 
 		 140 aa  122  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2964  flagellar basal body rod protein FlgC  46.92 
 
 		 130 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.796607  normal  0.243642 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1685  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.15 
 
 		 140 aa  100  7e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149162  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4198  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.31 
 
 		 138 aa  100  7e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0408  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.71 
 
 		 146 aa  97.8  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1644  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.26 
 
 		 136 aa  97.8  4e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000317866  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2949  flagellar basal body rod protein FlgC  40.48 
 
 		 141 aa  97.8  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.741203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1125  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.28 
 
 		 137 aa  97.1  7e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6370  flagellar basal body rod protein FlgC  41.94 
 
 		 141 aa  97.1  7e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0463  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.76 
 
 		 147 aa  97.1  7e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3924  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.17 
 
 		 145 aa  96.3  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0670476 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4197  flagellar basal body rod protein FlgC  45.38 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3019  flagellar basal body rod protein FlgC  41.13 
 
 		 141 aa  96.3  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2601  flagellar basal body rod protein FlgC  44.72 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.773402  hitchhiker  0.000553357 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3043  flagellar basal body rod protein FlgC  41.13 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1322  flagellar basal-body rod protein FlgC  40 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2410  flagellar basal body rod protein FlgC  41.13 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642225  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3099  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.6 
 
 		 140 aa  95.5  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.329796  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3024  flagellar basal body rod protein FlgC  41.13 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0826465  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0267  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.5 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0426  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.76 
 
 		 139 aa  94.7  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.651344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3069  flagellar basal body rod protein FlgC  40.32 
 
 		 141 aa  94.7  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2934  flagellar basal body rod protein FlgC  40.32 
 
 		 141 aa  94.7  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.725751 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1464  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.84 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1418  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.84 
 
 		 140 aa  94.7  4e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0036  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.93 
 
 		 149 aa  94.4  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3840  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.17 
 
 		 145 aa  94.7  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3326  flagellar basal body rod protein FlgC  41.13 
 
 		 141 aa  94  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1636  flagellar basal-body rod protein FlgC  43.86 
 
 		 134 aa  94.4  5e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0463  flagellar basal body rod protein FlgC  41.13 
 
 		 141 aa  94  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2053  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.76 
 
 		 147 aa  94.4  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3353  flagellar basal body rod protein FlgC  41.13 
 
 		 141 aa  94  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2995  flagellar basal body rod protein FlgC  41.13 
 
 		 141 aa  94  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2098  flagellar basal body rod protein FlgC  41.13 
 
 		 141 aa  94  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0267  flagellar basal body rod protein FlgC  41.13 
 
 		 141 aa  94  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191189  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0279  flagellar basal body rod protein FlgC  41.13 
 
 		 141 aa  94  5e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2969  flagellar basal body rod protein FlgC  41.73 
 
 		 134 aa  94  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0299  flagellar basal body rod protein FlgC  38.73 
 
 		 152 aa  94  6e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3424  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.81 
 
 		 145 aa  93.6  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  38.4 
 
 		 134 aa  93.2  9e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.4 
 
 		 134 aa  93.2  9e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  38.4 
 
 		 134 aa  93.2  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  38.4 
 
 		 134 aa  93.2  9e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2526  flagellar basal body rod protein FlgC  38.4 
 
 		 134 aa  93.2  9e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310597  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  38.4 
 
 		 134 aa  93.2  9e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  38.4 
 
 		 134 aa  93.2  9e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  38.4 
 
 		 134 aa  93.2  9e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1999  flagellar basal body rod protein FlgC  40.8 
 
 		 134 aa  92.8  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1330  flagellar basal body rod protein FlgC  42.34 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0241  flagellar basal body rod protein FlgC  39.52 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2054  flagellar basal body rod protein FlgC  38.4 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.224564 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2323  flagellar basal body rod protein FlgC  40.8 
 
 		 134 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2424  flagellar basal body rod protein FlgC  40.8 
 
 		 134 aa  92.8  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27738  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2991  flagellar basal body rod protein FlgC  42.34 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1341  flagellar basal body rod protein FlgC  40.46 
 
 		 138 aa  92  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2197  flagellar basal body rod protein FlgC  37.6 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000907371 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1869  flagellar basal body rod protein FlgC  37.98 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1272  flagellar basal body rod protein FlgC  37.6 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0147313 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2046  flagellar basal-body rod protein FlgC  40.43 
 
 		 137 aa  92.4  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1287  flagellar basal body rod protein FlgC  37.6 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158589  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1243  flagellar basal body rod protein FlgC  37.6 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2013  flagellar basal body rod protein FlgC  37.6 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2597  flagellar basal body rod protein FlgC  37.98 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.319275  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1715  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.12 
 
 		 138 aa  91.7  3e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000651347  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0944  flagellar basal body rod protein FlgC  41.94 
 
 		 136 aa  92  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.255907  normal  0.801291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>