262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0350 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0350  flagellar basal body rod protein FlgC  100 
 
 		 138 aa  281  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.121375 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0318  flagellar basal body rod protein FlgC  97.1 
 
 		 138 aa  271  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.783853  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0737  flagellar basal body rod protein FlgC  75.74 
 
 		 145 aa  226  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0256  flagellar basal body rod protein FlgC  71.53 
 
 		 139 aa  215  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0025  flagellar basal body rod protein FlgC  68.61 
 
 		 140 aa  202  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3655  flagellar basal body rod protein FlgC  67.15 
 
 		 138 aa  195  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.633505  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0597  flagellar basal body rod protein FlgC  63.5 
 
 		 138 aa  190  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.247253 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1691  flagellar basal body rod protein FlgC  63.24 
 
 		 138 aa  189  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.132509  normal  0.0178 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1095  flagellar basal body rod protein FlgC  64.71 
 
 		 139 aa  189  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.367315 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3674  flagellar basal body rod protein FlgC  62.77 
 
 		 138 aa  186  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00523112 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0297  flagellar basal body rod protein FlgC  62.77 
 
 		 139 aa  181  4.0000000000000006e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4211  flagellar basal body rod protein FlgC  61.03 
 
 		 140 aa  178  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0619  flagellar basal body rod protein FlgC  64.23 
 
 		 138 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.017127  normal  0.0984024 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0630  flagellar basal body rod protein FlgC  64.23 
 
 		 138 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.652584  normal  0.153414 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0136  flagellar basal body rod protein FlgC  61.03 
 
 		 140 aa  175  2e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.06608  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0152  flagellar basal body rod protein FlgC  61.03 
 
 		 140 aa  174  4e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1143  flagellar basal body rod protein FlgC  57.78 
 
 		 137 aa  165  2e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1518  flagellar basal body rod protein FlgC  53.73 
 
 		 141 aa  147  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0198818  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3438  flagellar basal body rod protein FlgC  50.38 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1393  flagellar basal body rod protein FlgC  54.96 
 
 		 141 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0993913  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5496  flagellar basal body rod protein FlgC  54.96 
 
 		 141 aa  143  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3776  flagellar basal body rod protein FlgC  51.49 
 
 		 141 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0600625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1133  flagellar basal body rod protein FlgC  54.2 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.886301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4410  flagellar basal body rod protein FlgC  50.75 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.541352  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2637  flagellar basal body rod protein FlgC  53.28 
 
 		 136 aa  141  3e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.296466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1694  flagellar basal body rod protein FlgC  50.75 
 
 		 141 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.649743 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2571  flagellar basal body rod protein FlgC  50.38 
 
 		 139 aa  140  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0907291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5537  flagellar basal body rod protein FlgC  54.62 
 
 		 136 aa  140  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132652  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2825  flagellar basal body rod protein FlgC  49.64 
 
 		 137 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2133  flagellar basal body rod protein FlgC  49.22 
 
 		 134 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5154  flagellar basal body rod protein FlgC  53.85 
 
 		 136 aa  138  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205426  normal  0.0262717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2830  flagellar basal body rod protein FlgC  52.55 
 
 		 136 aa  135  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.172073  normal  0.232346 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2607  flagellar basal body rod protein FlgC  52.55 
 
 		 136 aa  135  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122012  normal  0.267532 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2234  flagellar basal body rod protein FlgC  47.37 
 
 		 135 aa  133  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1937  flagellar basal body rod protein FlgC  47.29 
 
 		 137 aa  131  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.123234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1367  flagellar basal body rod protein FlgC  50.38 
 
 		 140 aa  128  3e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2964  flagellar basal body rod protein FlgC  44.12 
 
 		 130 aa  113  8.999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.796607  normal  0.243642 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3248  flagellar basal body rod protein FlgC  43.38 
 
 		 130 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.893989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1464  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.75 
 
 		 140 aa  103  5e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1418  flagellar basal-body rod protein FlgC  42.75 
 
 		 140 aa  103  5e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2111  flagellar basal body rod protein FlgC  42.11 
 
 		 130 aa  99.8  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.250047 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4197  flagellar basal body rod protein FlgC  43.38 
 
 		 130 aa  98.2  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0705  flagellar basal body rod protein FlgC  34.62 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1715  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.23 
 
 		 138 aa  95.1  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000651347  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1125  flagellar basal-body rod protein FlgC  38.46 
 
 		 137 aa  94.7  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3924  flagellar basal-body rod protein FlgC  34.04 
 
 		 145 aa  94.4  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0670476 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4198  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.37 
 
 		 138 aa  94.4  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1330  flagellar basal body rod protein FlgC  41.18 
 
 		 128 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2991  flagellar basal body rod protein FlgC  41.18 
 
 		 126 aa  94.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0426  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.23 
 
 		 139 aa  93.6  7e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.651344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2053  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.62 
 
 		 147 aa  93.6  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4075  protein of unknown function DUF1078 domain protein  44.83 
 
 		 113 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.402367 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1644  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.3 
 
 		 136 aa  92  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000317866  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2601  flagellar basal body rod protein FlgC  43.09 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.773402  hitchhiker  0.000553357 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0057  flagellar basal body rod protein FlgC  33.54 
 
 		 166 aa  92  3e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.223353  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6370  flagellar basal body rod protein FlgC  40.91 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130671  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0408  flagellar basal-body rod protein FlgC  37.24 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1685  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.96 
 
 		 140 aa  91.3  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.149162  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0364  flagellar basal body rod protein FlgC  34.59 
 
 		 164 aa  91.3  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0241  flagellar basal body rod protein FlgC  40.91 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1194  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.23 
 
 		 143 aa  90.9  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3114  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.99 
 
 		 147 aa  90.9  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3326  flagellar basal body rod protein FlgC  41.67 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0463  flagellar basal body rod protein FlgC  41.67 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3353  flagellar basal body rod protein FlgC  41.67 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.809775  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2410  flagellar basal body rod protein FlgC  40.15 
 
 		 141 aa  90.5  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.642225  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3024  flagellar basal body rod protein FlgC  40.15 
 
 		 141 aa  90.5  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0826465  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3043  flagellar basal body rod protein FlgC  40.15 
 
 		 141 aa  90.5  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2995  flagellar basal body rod protein FlgC  41.67 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2098  flagellar basal body rod protein FlgC  41.67 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0267  flagellar basal body rod protein FlgC  41.67 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.191189  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0279  flagellar basal body rod protein FlgC  41.67 
 
 		 141 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3019  flagellar basal body rod protein FlgC  40.15 
 
 		 141 aa  90.5  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3424  flagellar basal-body rod protein FlgC  35.37 
 
 		 145 aa  90.1  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01070  flagellar basal-body rod protein C  41.41 
 
 		 134 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2572  flagellar basal-body rod protein FlgC  41.41 
 
 		 134 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.641809  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2054  flagellar basal body rod protein FlgC  41.41 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.224564 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2197  flagellar basal body rod protein FlgC  41.41 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000907371 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2526  flagellar basal body rod protein FlgC  41.41 
 
 		 134 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.310597  normal  0.0167576 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01078  hypothetical protein  41.41 
 
 		 134 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1272  flagellar basal body rod protein FlgC  41.41 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0147313 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1287  flagellar basal body rod protein FlgC  41.41 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158589  normal  0.0305834 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1197  flagellar basal body rod protein FlgC  41.41 
 
 		 134 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1243  flagellar basal body rod protein FlgC  41.41 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.400402  normal  0.136265 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2251  flagellar basal body rod protein FlgC  41.41 
 
 		 134 aa  89.4  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1197  flagellar basal body rod protein FlgC  41.41 
 
 		 134 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1453  flagellar basal body rod protein FlgC  41.41 
 
 		 134 aa  89.4  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268657 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2013  flagellar basal body rod protein FlgC  41.41 
 
 		 134 aa  89.7  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2175  flagellar basal-body rod protein FlgC  36.36 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.869204  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2934  flagellar basal body rod protein FlgC  39.39 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.725751 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3069  flagellar basal body rod protein FlgC  39.39 
 
 		 141 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1588  flagellar basal body rod protein FlgC  42.19 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0944  flagellar basal body rod protein FlgC  40.16 
 
 		 136 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.255907  normal  0.801291 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0036  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.11 
 
 		 149 aa  88.2  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3840  flagellar basal-body rod protein FlgC  32.62 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0267  flagellar basal-body rod protein FlgC  33.33 
 
 		 141 aa  88.2  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2949  flagellar basal body rod protein FlgC  38.57 
 
 		 141 aa  87.8  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.741203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1673  flagellar basal-body rod protein FlgC  31.25 
 
 		 163 aa  87.4  5e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0299  flagellar basal body rod protein FlgC  34 
 
 		 152 aa  87.4  5e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2923  flagellar basal-body rod protein FlgC  39.53 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>