44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3118 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3118  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  820    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0457389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000304  BatD  30.13 
 
 		 438 aa  124  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5136  hypothetical protein  32.06 
 
 		 430 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.136835  normal  0.601622 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3803  hypothetical protein  27.82 
 
 		 447 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.853464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2140  hypothetical protein  30.34 
 
 		 458 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.582958  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2886  hypothetical protein  28.52 
 
 		 451 aa  100  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.669839  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3554  hypothetical protein  25.54 
 
 		 472 aa  94.7  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2993  hypothetical protein  25 
 
 		 465 aa  94.4  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0569  hypothetical protein  25.11 
 
 		 476 aa  94  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3384  hypothetical protein  26.29 
 
 		 475 aa  93.2  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.75671 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4530  hypothetical protein  28.95 
 
 		 363 aa  93.2  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744271  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3053  hypothetical protein  27.92 
 
 		 436 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0216691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1207  hypothetical protein  28.86 
 
 		 424 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3087  hypothetical protein  24.93 
 
 		 595 aa  75.9  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.232406  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2934  hypothetical protein  22.85 
 
 		 546 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.707413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3213  hypothetical protein  26.47 
 
 		 546 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.338113 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2065  hypothetical protein  26.5 
 
 		 543 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1559  hypothetical protein  25.59 
 
 		 544 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.545989  normal  0.355299 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2027  hypothetical protein  23.85 
 
 		 543 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.379068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3715  hypothetical protein  23.78 
 
 		 543 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18780  hypothetical protein  25.78 
 
 		 544 aa  60.5  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.374717  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1731  hypothetical protein  25.49 
 
 		 611 aa  60.1  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.187494  normal  0.124659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1716  hypothetical protein  26.16 
 
 		 552 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0987625  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3764  hypothetical protein  26.94 
 
 		 551 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.137041  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24380  hypothetical protein  26.82 
 
 		 543 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00155106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1587  hypothetical protein  23.14 
 
 		 541 aa  53.5  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00091604 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0854  hypothetical protein  28.33 
 
 		 589 aa  50.8  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.254625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1950  hypothetical protein  23.86 
 
 		 580 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.673108  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1108  hypothetical protein  25.21 
 
 		 550 aa  48.9  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0071  hypothetical protein  23 
 
 		 566 aa  48.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1454  hypothetical protein  22.02 
 
 		 553 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000118146 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1657  BatD protein  23.15 
 
 		 584 aa  47.8  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0760039  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1742  forkhead-associated  22.97 
 
 		 570 aa  47.4  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.607903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1466  hypothetical protein  23.49 
 
 		 553 aa  47  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.661911  hitchhiker  0.00237644 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3095  hypothetical protein  22.65 
 
 		 555 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1401  hypothetical protein  25.11 
 
 		 552 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.559389  hitchhiker  0.00000222203 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1741  hypothetical protein  21.88 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.360365  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2911  hypothetical protein  23.24 
 
 		 549 aa  45.8  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0522  hypothetical protein  31.58 
 
 		 568 aa  45.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1622  hypothetical protein  21.45 
 
 		 544 aa  43.9  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.652102  hitchhiker  0.00000525013 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2466  hypothetical protein  24.07 
 
 		 547 aa  43.9  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3164  batD protein  26.61 
 
 		 581 aa  43.5  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00886751  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05142  hypothetical protein  26.63 
 
 		 548 aa  43.5  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2765  hypothetical protein  25.16 
 
 		 549 aa  43.5  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>