More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3111 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3411  sulfatase  63.6 
 
 
526 aa  658    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.420036 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3111  arylsulfatase precursor  100 
 
 
533 aa  1102    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.513855  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3081  arylsulfatase  63.76 
 
 
496 aa  663    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1202  sulfatase  62.08 
 
 
547 aa  657    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191965 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8070  sulfatase  65.73 
 
 
557 aa  684    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.883043  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000313  arylsulfatase  68.9 
 
 
515 aa  730    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1195  sulfatase  64.57 
 
 
552 aa  671    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.031071  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3791  sulfatase  61.11 
 
 
548 aa  634    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.425915  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4629  sulfatase  62.43 
 
 
496 aa  630  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.284621  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0789  sulfatase  58.56 
 
 
525 aa  618  1e-176  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0797845  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4113  sulfatase  58.9 
 
 
514 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446861  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4188  sulfatase  58.9 
 
 
514 aa  617  1e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2095  sulfatase  60.81 
 
 
512 aa  615  1e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0111977  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4344  sulfatase  58.58 
 
 
505 aa  608  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.252658 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5416  arylsulfatase-like enzyme  57.29 
 
 
579 aa  600  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3051  sulfatase  58.75 
 
 
522 aa  599  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.829801  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3123  sulfatase  55.03 
 
 
549 aa  593  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2984  sulfatase family protein  53.98 
 
 
512 aa  591  1e-167  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00336122  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2893  sulfatase  57.46 
 
 
567 aa  591  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269953  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0660  sulfatase family protein  55.11 
 
 
525 aa  583  1.0000000000000001e-165  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.61402  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5142  sulfatase  58.33 
 
 
544 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2985  sulfatase family protein  54.55 
 
 
502 aa  570  1e-161  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0283878  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1142  sulfatase  54.6 
 
 
555 aa  569  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5118  sulfatase  53.63 
 
 
554 aa  557  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0562  sulfatase  54 
 
 
505 aa  551  1e-156  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000311  arylsulfatase  54.6 
 
 
508 aa  550  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.63107  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3391  sulfatase  53.8 
 
 
505 aa  550  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6900  sulfatase  53.99 
 
 
545 aa  551  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0879565  normal  0.386644 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2132  putative arylsulfatase  55.58 
 
 
560 aa  547  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.242707  normal  0.0122075 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003601  arylsulfatase  53.65 
 
 
521 aa  538  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3805  sulfatase  54.12 
 
 
552 aa  521  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0419  sulfatase  50 
 
 
513 aa  514  1e-144  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2983  putative arylsulfatase  50.67 
 
 
522 aa  509  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0960108  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3032  sulfatase family protein  51.75 
 
 
522 aa  499  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1735  sulfatase  46.08 
 
 
508 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2371  sulfatase  43.97 
 
 
510 aa  421  1e-116  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.852311  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0526  sulfatase  44.59 
 
 
564 aa  410  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4569  arylsulfatase  41.71 
 
 
542 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.149859  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1946  sulfatase  41.94 
 
 
546 aa  383  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0357  arylsulfatase  39.51 
 
 
512 aa  369  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.340259  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3990  sulfatase family protein  38.8 
 
 
517 aa  356  5e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2939  sulfatase  32.02 
 
 
556 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6751  sulfatase  31.32 
 
 
569 aa  209  1e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6681  sulfatase  30.13 
 
 
561 aa  197  3e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1239  sulfatase  29.68 
 
 
554 aa  195  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0342863  normal  0.143694 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1647  sulfatase  30.04 
 
 
590 aa  191  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.425588  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3142  sulfatase  28.4 
 
 
524 aa  190  5.999999999999999e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.854728  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1030  sulfatase  28.2 
 
 
470 aa  189  9e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5555  sulfatase  29.59 
 
 
561 aa  189  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.708907  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6904  sulfatase  29.13 
 
 
556 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.430095 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5768  sulfatase  29.06 
 
 
555 aa  188  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0793  sulfatase  29.63 
 
 
569 aa  188  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0527752  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  32.04 
 
 
462 aa  186  8e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  31.24 
 
 
486 aa  184  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3115  cerebroside-sulfatase  28.54 
 
 
440 aa  181  2.9999999999999997e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100154  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  30.11 
 
 
480 aa  176  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2976  sulfatase  30.53 
 
 
496 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5097  sulfatase  26.45 
 
 
550 aa  159  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551425  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03676  acrylsulfatase-like enzyme  27.01 
 
 
551 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.176732  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4178  sulfatase  27.01 
 
 
551 aa  158  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0425413  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5237  arylsulfatase  27.01 
 
 
551 aa  158  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0995003  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03625  hypothetical protein  27.01 
 
 
551 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.173568  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4166  arylsulfatase  27.01 
 
 
551 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00523411  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  27.83 
 
 
471 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3980  Cerebroside-sulfatase  28.74 
 
 
458 aa  153  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  29.94 
 
 
466 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  28.54 
 
 
452 aa  149  8e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  28.67 
 
 
487 aa  149  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8255  sulfatase  30.19 
 
 
482 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.229678  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  28.15 
 
 
440 aa  149  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3501  sulfatase  27.49 
 
 
506 aa  147  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.486843  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  29.17 
 
 
491 aa  144  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  27.75 
 
 
470 aa  141  3e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  28.08 
 
 
497 aa  141  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  27.51 
 
 
497 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  27.51 
 
 
497 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  28.26 
 
 
457 aa  137  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  28.65 
 
 
497 aa  137  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  27.51 
 
 
497 aa  137  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  27.51 
 
 
497 aa  137  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  29.85 
 
 
462 aa  135  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2890  sulfatase  29.37 
 
 
523 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3640  sulfatase  28.57 
 
 
520 aa  135  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  26.98 
 
 
472 aa  134  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  26.77 
 
 
497 aa  130  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2831  sulfatase  25.5 
 
 
440 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0404074 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  25.76 
 
 
501 aa  129  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  28.76 
 
 
481 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1568  sulfatase  29.95 
 
 
638 aa  129  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0365787  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  27.08 
 
 
517 aa  127  4.0000000000000003e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  27.97 
 
 
457 aa  127  6e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2382  sulfatase  29.49 
 
 
488 aa  126  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.285521  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0555  sulfatase  27.42 
 
 
486 aa  125  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  26.88 
 
 
553 aa  125  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  25.91 
 
 
500 aa  123  8e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  26.42 
 
 
480 aa  122  1.9999999999999998e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  27.39 
 
 
474 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  25.78 
 
 
479 aa  120  4.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0121  sulfatase  27.56 
 
 
526 aa  120  6e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  25.22 
 
 
548 aa  120  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>